Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40.09■■■■■ 4.01
Cacnb2Q8CC27 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Cacnb2Q8CC27 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Cacnb2Q8CC27 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
Cacnb2Q8CC27 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
Cacnb2Q8CC27 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Cacnb2Q8CC27 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Cacnb2Q8CC27 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Cacnb2Q8CC27 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Cacnb2Q8CC27 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cacnb2Q8CC27 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Cacnb2Q8CC27 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
Cacnb2Q8CC27 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cacnb2Q8CC27 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Cacnb2Q8CC27 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Cacnb2Q8CC27 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Cacnb2Q8CC27 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Cacnb2Q8CC27 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Cacnb2Q8CC27 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Cacnb2Q8CC27 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Cacnb2Q8CC27 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Cacnb2Q8CC27 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cacnb2Q8CC27 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Cacnb2Q8CC27 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Cacnb2Q8CC27 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Cacnb2Q8CC27 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Cacnb2Q8CC27 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Cacnb2Q8CC27 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Cacnb2Q8CC27 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Cacnb2Q8CC27 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Cacnb2Q8CC27 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
Cacnb2Q8CC27 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
Cacnb2Q8CC27 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Cacnb2Q8CC27 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Cacnb2Q8CC27 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Cacnb2Q8CC27 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
Cacnb2Q8CC27 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Cacnb2Q8CC27 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Cacnb2Q8CC27 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Cacnb2Q8CC27 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Cacnb2Q8CC27 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Cacnb2Q8CC27 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Cacnb2Q8CC27 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Cacnb2Q8CC27 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Cacnb2Q8CC27 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
Cacnb2Q8CC27 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Cacnb2Q8CC27 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Cacnb2Q8CC27 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Cacnb2Q8CC27 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Cacnb2Q8CC27 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Cacnb2Q8CC27 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Cacnb2Q8CC27 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Cacnb2Q8CC27 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Cacnb2Q8CC27 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Cacnb2Q8CC27 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Cacnb2Q8CC27 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Cacnb2Q8CC27 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cacnb2Q8CC27 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cacnb2Q8CC27 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cacnb2Q8CC27 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Cacnb2Q8CC27 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Cacnb2Q8CC27 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cacnb2Q8CC27 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cacnb2Q8CC27 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cacnb2Q8CC27 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cacnb2Q8CC27 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cacnb2Q8CC27 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cacnb2Q8CC27 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cacnb2Q8CC27 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Cacnb2Q8CC27 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cacnb2Q8CC27 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cacnb2Q8CC27 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cacnb2Q8CC27 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cacnb2Q8CC27 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cacnb2Q8CC27 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cacnb2Q8CC27 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cacnb2Q8CC27 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cacnb2Q8CC27 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cacnb2Q8CC27 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Cacnb2Q8CC27 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cacnb2Q8CC27 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cacnb2Q8CC27 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cacnb2Q8CC27 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Cacnb2Q8CC27 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cacnb2Q8CC27 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cacnb2Q8CC27 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Cacnb2Q8CC27 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cacnb2Q8CC27 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cacnb2Q8CC27 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cacnb2Q8CC27 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Cacnb2Q8CC27 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cacnb2Q8CC27 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cacnb2Q8CC27 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Cacnb2Q8CC27 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cacnb2Q8CC27 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cacnb2Q8CC27 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cacnb2Q8CC27 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Cacnb2Q8CC27 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Cacnb2Q8CC27 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cacnb2Q8CC27 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms