Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJF7

Cacna2d4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d4Q5RJF7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41,21■■■■■ 4,19
Cacna2d4Q5RJF7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37,91■■■■□ 3,66
Cacna2d4Q5RJF7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,57■■■■□ 3,6
Cacna2d4Q5RJF7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,47■■■■□ 3,59
Cacna2d4Q5RJF7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,67■■■■□ 3,46
Cacna2d4Q5RJF7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36,44■■■■□ 3,42
Cacna2d4Q5RJF7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,31■■■■□ 3,4
Cacna2d4Q5RJF7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35,66■■■■□ 3,3
Cacna2d4Q5RJF7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35,48■■■■□ 3,27
Cacna2d4Q5RJF7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,23■■■■□ 3,23
Cacna2d4Q5RJF7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,17■■■■□ 3,22
Cacna2d4Q5RJF7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34,76■■■■□ 3,16
Cacna2d4Q5RJF7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,74■■■■□ 3,15
Cacna2d4Q5RJF7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34,61■■■■□ 3,13
Cacna2d4Q5RJF7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34,52■■■■□ 3,12
Cacna2d4Q5RJF7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34,5■■■■□ 3,11
Cacna2d4Q5RJF7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,41■■■■□ 3,1
Cacna2d4Q5RJF7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,38■■■■□ 3,09
Cacna2d4Q5RJF7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,28■■■■□ 3,08
Cacna2d4Q5RJF7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,15■■■■□ 3,06
Cacna2d4Q5RJF7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Cacna2d4Q5RJF7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,93■■■■□ 3,02
Cacna2d4Q5RJF7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,92■■■■□ 3,02
Cacna2d4Q5RJF7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,9■■■■□ 3,02
Cacna2d4Q5RJF7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,84■■■■□ 3,01
Cacna2d4Q5RJF7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,72■■■□□ 2,99
Cacna2d4Q5RJF7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33,71■■■□□ 2,99
Cacna2d4Q5RJF7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,71■■■□□ 2,99
Cacna2d4Q5RJF7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,6■■■□□ 2,97
Cacna2d4Q5RJF7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,57■■■□□ 2,96
Cacna2d4Q5RJF7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33,55■■■□□ 2,96
Cacna2d4Q5RJF7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33,47■■■□□ 2,95
Cacna2d4Q5RJF7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,34■■■□□ 2,93
Cacna2d4Q5RJF7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33,31■■■□□ 2,92
Cacna2d4Q5RJF7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,16■■■□□ 2,9
Cacna2d4Q5RJF7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,1■■■□□ 2,89
Cacna2d4Q5RJF7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32,85■■■□□ 2,85
Cacna2d4Q5RJF7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,83■■■□□ 2,85
Cacna2d4Q5RJF7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,8■■■□□ 2,84
Cacna2d4Q5RJF7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,72■■■□□ 2,83
Cacna2d4Q5RJF7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32,72■■■□□ 2,83
Cacna2d4Q5RJF7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32,58■■■□□ 2,81
Cacna2d4Q5RJF7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,58■■■□□ 2,81
Cacna2d4Q5RJF7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,52■■■□□ 2,8
Cacna2d4Q5RJF7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
Cacna2d4Q5RJF7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32,39■■■□□ 2,78
Cacna2d4Q5RJF7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32,38■■■□□ 2,77
Cacna2d4Q5RJF7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32,35■■■□□ 2,77
Cacna2d4Q5RJF7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,31■■■□□ 2,76
Cacna2d4Q5RJF7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,3■■■□□ 2,76
Cacna2d4Q5RJF7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32,27■■■□□ 2,76
Cacna2d4Q5RJF7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,24■■■□□ 2,75
Cacna2d4Q5RJF7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,22■■■□□ 2,75
Cacna2d4Q5RJF7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32,21■■■□□ 2,75
Cacna2d4Q5RJF7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,2■■■□□ 2,74
Cacna2d4Q5RJF7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,09■■■□□ 2,73
Cacna2d4Q5RJF7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31,98■■■□□ 2,71
Cacna2d4Q5RJF7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,96■■■□□ 2,71
Cacna2d4Q5RJF7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,9■■■□□ 2,7
Cacna2d4Q5RJF7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,9■■■□□ 2,7
Cacna2d4Q5RJF7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31,9■■■□□ 2,7
Cacna2d4Q5RJF7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31,85■■■□□ 2,69
Cacna2d4Q5RJF7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,82■■■□□ 2,68
Cacna2d4Q5RJF7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,81■■■□□ 2,68
Cacna2d4Q5RJF7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31,79■■■□□ 2,68
Cacna2d4Q5RJF7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,78■■■□□ 2,68
Cacna2d4Q5RJF7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31,73■■■□□ 2,67
Cacna2d4Q5RJF7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31,68■■■□□ 2,66
Cacna2d4Q5RJF7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,66■■■□□ 2,66
Cacna2d4Q5RJF7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,64■■■□□ 2,66
Cacna2d4Q5RJF7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,58■■■□□ 2,65
Cacna2d4Q5RJF7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,57■■■□□ 2,64
Cacna2d4Q5RJF7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31,53■■■□□ 2,64
Cacna2d4Q5RJF7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31,53■■■□□ 2,64
Cacna2d4Q5RJF7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31,51■■■□□ 2,63
Cacna2d4Q5RJF7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31,49■■■□□ 2,63
Cacna2d4Q5RJF7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Cacna2d4Q5RJF7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31,47■■■□□ 2,63
Cacna2d4Q5RJF7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31,46■■■□□ 2,63
Cacna2d4Q5RJF7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
Cacna2d4Q5RJF7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31,22■■■□□ 2,59
Cacna2d4Q5RJF7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,2■■■□□ 2,58
Cacna2d4Q5RJF7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,19■■■□□ 2,58
Cacna2d4Q5RJF7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31,15■■■□□ 2,58
Cacna2d4Q5RJF7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,09■■■□□ 2,57
Cacna2d4Q5RJF7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,08■■■□□ 2,57
Cacna2d4Q5RJF7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2,55
Cacna2d4Q5RJF7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2,55
Cacna2d4Q5RJF7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Cacna2d4Q5RJF7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30,98■■■□□ 2,55
Cacna2d4Q5RJF7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,92■■■□□ 2,54
Cacna2d4Q5RJF7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
Cacna2d4Q5RJF7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30,85■■■□□ 2,53
Cacna2d4Q5RJF7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30,85■■■□□ 2,53
Cacna2d4Q5RJF7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Cacna2d4Q5RJF7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Cacna2d4Q5RJF7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Cacna2d4Q5RJF7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Cacna2d4Q5RJF7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,79■■■□□ 2,52
Cacna2d4Q5RJF7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30,79■■■□□ 2,52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,1 ms