RNA–Protein interactions for RNA: 15S_rRNA

15S_rRNA, Transcript of Ribosomal RNA of the small mitochondrial ribosomal subunit, yeastyeast

Gene 15S_rRNA, Length 1,649 nt, Biotype rRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
15S_rRNA15S_rRNA KNH1P50112 268 aa1.32□□□□□ -2.2
15S_rRNA15S_rRNA PGA2P53903 129 aa1.32□□□□□ -2.2
15S_rRNA15S_rRNA LSM7P53905 115 aaKnown RBP1.32□□□□□ -2.2
15S_rRNA15S_rRNA COG5P53951 403 aa1.32□□□□□ -2.2
15S_rRNA15S_rRNA YIL177CP40434 1758 aa1.31□□□□□ -2.2
15S_rRNA15S_rRNA YJL225CP40889 1758 aa1.31□□□□□ -2.2
15S_rRNA15S_rRNA YDR157WA0A023PZE8 133 aa1.31□□□□□ -2.2
15S_rRNA15S_rRNA SIR2P06700 562 aa1.31□□□□□ -2.2
15S_rRNA15S_rRNA TRM5P38793 499 aa1.31□□□□□ -2.2
15S_rRNA15S_rRNA MPA43P53583 542 aaPredicted RBP1.31□□□□□ -2.2
15S_rRNA15S_rRNA PET191Q02772 108 aa1.31□□□□□ -2.2
15S_rRNA15S_rRNA YHR214C-EQ8TGK0 99 aa1.31□□□□□ -2.2
15S_rRNA15S_rRNA YFR032C-BQ8TGU2 87 aa1.31□□□□□ -2.2
15S_rRNA15S_rRNA YLR236CA0A023PZG4 107 aa1.3□□□□□ -2.2
15S_rRNA15S_rRNA YDR274CP87283 123 aa1.3□□□□□ -2.2
15S_rRNA15S_rRNA RNH1Q04740 348 aa1.3□□□□□ -2.2
15S_rRNA15S_rRNA YNG1Q08465 219 aa1.3□□□□□ -2.2
15S_rRNA15S_rRNA CPA1P07258 411 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
15S_rRNA15S_rRNA ATP15P21306 62 aa1.29□□□□□ -2.2
15S_rRNA15S_rRNA YCR087C-AP37263 153 aa1.29□□□□□ -2.2
15S_rRNA15S_rRNA IKI1P38874 309 aa1.29□□□□□ -2.2
15S_rRNA15S_rRNA HMF1P40037 129 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
15S_rRNA15S_rRNA YER076CP40049 302 aa1.29□□□□□ -2.2
15S_rRNA15S_rRNA BNA7Q04066 261 aa1.29□□□□□ -2.2
15S_rRNA15S_rRNA CUE4Q04201 117 aaPredicted RBP1.29□□□□□ -2.2
15S_rRNA15S_rRNA MDM32Q12171 622 aa1.29□□□□□ -2.2
15S_rRNA15S_rRNA MER1P16523 270 aa1.29□□□□□ -2.2
15S_rRNA15S_rRNA CKS1P20486 150 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
15S_rRNA15S_rRNA OPY1P38271 328 aa1.29□□□□□ -2.2
15S_rRNA15S_rRNA UBC7Q02159 165 aa1.29□□□□□ -2.2
15S_rRNA15S_rRNA ARG80P07249 177 aa1.28□□□□□ -2.2
15S_rRNA15S_rRNA TAF14P35189 244 aa1.28□□□□□ -2.2
15S_rRNA15S_rRNA RPL27AP0C2H6 136 aaKnown RBP1.27□□□□□ -2.21
15S_rRNA15S_rRNA SEC11P15367 167 aa1.27□□□□□ -2.21
15S_rRNA15S_rRNA SPS18P32572 300 aa1.27□□□□□ -2.21
15S_rRNA15S_rRNA KDX1P36005 433 aa1.27□□□□□ -2.21
15S_rRNA15S_rRNA ODC2Q99297 307 aa1.27□□□□□ -2.21
15S_rRNA15S_rRNA IKI3Q06706 1349 aaKnown RBP1.27□□□□□ -2.21
15S_rRNA15S_rRNA YER034WP40022 185 aaKnown RBP1.26□□□□□ -2.21
15S_rRNA15S_rRNA RIO2P40160 425 aaKnown RBP1.26□□□□□ -2.21
15S_rRNA15S_rRNA HNT1Q04344 158 aaKnown RBP1.26□□□□□ -2.21
15S_rRNA15S_rRNA RAD28Q12021 506 aa1.26□□□□□ -2.21
15S_rRNA15S_rRNA YNL146C-AQ3E7Z1 64 aa1.26□□□□□ -2.21
15S_rRNA15S_rRNA MSB2P32334 1306 aa1.26□□□□□ -2.21
15S_rRNA15S_rRNA VAR1P02381 398 aa1.26□□□□□ -2.21
15S_rRNA15S_rRNA RPB4P20433 221 aaPredicted RBP1.26□□□□□ -2.21
15S_rRNA15S_rRNA RFA3P26755 122 aaKnown RBP1.26□□□□□ -2.21
15S_rRNA15S_rRNA ERG10P41338 398 aaKnown RBP1.26□□□□□ -2.21
15S_rRNA15S_rRNA TIM11P81449 96 aaPredicted RBP1.26□□□□□ -2.21
15S_rRNA15S_rRNA GIS3Q12418 502 aa1.26□□□□□ -2.21
15S_rRNA15S_rRNA NTG1P31378 399 aa1.25□□□□□ -2.21
15S_rRNA15S_rRNA VMA22P38784 181 aa1.25□□□□□ -2.21
15S_rRNA15S_rRNA YMR226CQ05016 267 aaKnown RBP1.25□□□□□ -2.21
15S_rRNA15S_rRNA GGA1Q06336 557 aa1.25□□□□□ -2.21
15S_rRNA15S_rRNA YHR007C-AQ07074 71 aa1.25□□□□□ -2.21
15S_rRNA15S_rRNA YOL160WQ08321 113 aa1.25□□□□□ -2.21
15S_rRNA15S_rRNA ACC1Q00955 2233 aaKnown RBP1.25□□□□□ -2.21
15S_rRNA15S_rRNA FAS1P07149 2051 aaKnown RBP1.24□□□□□ -2.21
15S_rRNA15S_rRNA YCR090CP25654 182 aaKnown RBP1.24□□□□□ -2.21
15S_rRNA15S_rRNA OCH1P31755 480 aa1.24□□□□□ -2.21
15S_rRNA15S_rRNA FLX1P40464 311 aa1.24□□□□□ -2.21
15S_rRNA15S_rRNA AIM25P47140 327 aa1.24□□□□□ -2.21
15S_rRNA15S_rRNA RCE1Q03530 315 aa1.24□□□□□ -2.21
15S_rRNA15S_rRNA HTB1P02293 131 aaKnown RBP1.23□□□□□ -2.21
15S_rRNA15S_rRNA HTB2P02294 131 aa1.23□□□□□ -2.21
15S_rRNA15S_rRNA ECM4P36156 370 aa1.23□□□□□ -2.21
15S_rRNA15S_rRNA YAE1P47118 141 aaPredicted RBP1.23□□□□□ -2.21
15S_rRNA15S_rRNA FUS2Q05670 677 aa1.23□□□□□ -2.21
15S_rRNA15S_rRNA SPO13P23624 291 aa1.22□□□□□ -2.21
15S_rRNA15S_rRNA CNB1P25296 175 aa1.22□□□□□ -2.21
15S_rRNA15S_rRNA EDC3P39998 551 aaKnown RBP1.22□□□□□ -2.21
15S_rRNA15S_rRNA ARO8P53090 500 aaKnown RBP1.22□□□□□ -2.21
15S_rRNA15S_rRNA MPC3P53311 146 aa1.22□□□□□ -2.21
15S_rRNA15S_rRNA DGA1Q08650 418 aa1.22□□□□□ -2.21
15S_rRNA15S_rRNA PAN3P36102 679 aaPredicted RBP1.22□□□□□ -2.21
15S_rRNA15S_rRNA RFC4P40339 323 aaKnown RBP1.22□□□□□ -2.21
15S_rRNA15S_rRNA SKI6P46948 246 aaPredicted RBP1.22□□□□□ -2.21
15S_rRNA15S_rRNA MRPS17Q03246 237 aaPredicted RBP1.22□□□□□ -2.21
15S_rRNA15S_rRNA DYN3Q04949 312 aa1.22□□□□□ -2.21
15S_rRNA15S_rRNA YPR174CQ06616 221 aaPredicted RBP1.22□□□□□ -2.21
15S_rRNA15S_rRNA YRA1Q12159 226 aaKnown RBP1.22□□□□□ -2.21
15S_rRNA15S_rRNA POR1P04840 283 aaKnown RBP1.21□□□□□ -2.22
15S_rRNA15S_rRNA CDC36P06100 191 aaPredicted RBP1.21□□□□□ -2.22
15S_rRNA15S_rRNA ASF2P32448 525 aaPredicted RBP1.21□□□□□ -2.22
15S_rRNA15S_rRNA TVP23P38962 199 aa1.21□□□□□ -2.22
15S_rRNA15S_rRNA AIM2P39721 246 aa1.21□□□□□ -2.22
15S_rRNA15S_rRNA GET1P53192 235 aa1.21□□□□□ -2.22
15S_rRNA15S_rRNA CWC27Q02770 301 aa1.21□□□□□ -2.22
15S_rRNA15S_rRNA MDM35O60200 86 aa1.2□□□□□ -2.22
15S_rRNA15S_rRNA YPK2P18961 677 aa1.2□□□□□ -2.22
15S_rRNA15S_rRNA YHL042WP38729 150 aa1.2□□□□□ -2.22
15S_rRNA15S_rRNA YEA4P40004 342 aa1.2□□□□□ -2.22
15S_rRNA15S_rRNA YNL247WP53852 767 aaKnown RBP1.2□□□□□ -2.22
15S_rRNA15S_rRNA MBF1O14467 151 aaKnown RBP1.19□□□□□ -2.22
15S_rRNA15S_rRNA YKT6P36015 200 aaKnown RBP1.19□□□□□ -2.22
15S_rRNA15S_rRNA YER134CP40081 178 aa1.19□□□□□ -2.22
15S_rRNA15S_rRNA YPL073CP40323 161 aa1.19□□□□□ -2.22
15S_rRNA15S_rRNA SER2P42941 309 aa1.19□□□□□ -2.22
15S_rRNA15S_rRNA MMS2P53152 137 aa1.19□□□□□ -2.22
15S_rRNA15S_rRNA ABP140Q08641 628 aaKnown RBP1.19□□□□□ -2.22
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