RNA–Protein interactions for RNA: YKR061W

KTR2, Transcript of Mannosyltransferase involved in N-linked protein glycosylation, yeast

Gene KTR2, Length 1,278 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KTR2	YKR061W	IXR1	P33417	597 aa		5.94	□□□□□ -1.46
KTR2	YKR061W	YDL206W	Q12424	762 aa		5.94	□□□□□ -1.46
KTR2	YKR061W	SNQ2	P32568	1501 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
KTR2	YKR061W	RPO21	P04050	1733 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
KTR2	YKR061W	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
KTR2	YKR061W	NUP85	P46673	744 aa		5.93	□□□□□ -1.46
KTR2	YKR061W	ITT1	Q04638	464 aa		5.93	□□□□□ -1.46
KTR2	YKR061W	VPS15	P22219	1454 aa		5.92	□□□□□ -1.46
KTR2	YKR061W	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
KTR2	YKR061W	BRL1	P38770	471 aa		5.92	□□□□□ -1.46
KTR2	YKR061W	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	5.92	□□□□□ -1.46
KTR2	YKR061W	STH1	P32597	1359 aa		5.92	□□□□□ -1.46
KTR2	YKR061W	OPT2	Q06593	877 aa		5.91	□□□□□ -1.46
KTR2	YKR061W	TRM1	P15565	570 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.46
KTR2	YKR061W	TYW1	Q08960	810 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.46
KTR2	YKR061W	CAF120	P53836	1060 aa		5.89	□□□□□ -1.47
KTR2	YKR061W	MMP1	Q12372	583 aa		5.89	□□□□□ -1.47
KTR2	YKR061W	MIP1	P15801	1254 aa		5.88	□□□□□ -1.47
KTR2	YKR061W	GLN1	P32288	370 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
KTR2	YKR061W	MET10	P39692	1035 aa		5.88	□□□□□ -1.47
KTR2	YKR061W	SLX8	P40072	274 aa		5.88	□□□□□ -1.47
KTR2	YKR061W	SCW11	P53189	542 aa		5.88	□□□□□ -1.47
KTR2	YKR061W	ATF2	P53296	535 aa		5.88	□□□□□ -1.47
KTR2	YKR061W	ARG82	P07250	355 aa		5.87	□□□□□ -1.47
KTR2	YKR061W	YGR035C	P53222	116 aa		5.86	□□□□□ -1.47
KTR2	YKR061W	MTC5	Q03897	1148 aa		5.86	□□□□□ -1.47
KTR2	YKR061W	ULS1	Q08562	1619 aa		5.85	□□□□□ -1.47
KTR2	YKR061W	DRS2	P39524	1355 aa		5.85	□□□□□ -1.47
KTR2	YKR061W	VAC17	P25591	423 aa		5.85	□□□□□ -1.47
KTR2	YKR061W	TRK2	P28584	889 aa		5.85	□□□□□ -1.47
KTR2	YKR061W	LSC2	P53312	427 aa		5.85	□□□□□ -1.47
KTR2	YKR061W	UBP2	Q01476	1272 aa		5.85	□□□□□ -1.47
KTR2	YKR061W	PDR12	Q02785	1511 aa		5.84	□□□□□ -1.47
KTR2	YKR061W	YNR021W	P53723	404 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
KTR2	YKR061W	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
KTR2	YKR061W	PDR15	Q04182	1529 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.48
KTR2	YKR061W	SPO14	P36126	1683 aa		5.83	□□□□□ -1.48
KTR2	YKR061W	SSA1	P10591	642 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
KTR2	YKR061W	SCJ1	P25303	377 aa		5.83	□□□□□ -1.48
KTR2	YKR061W	TY1A-BL	Q12266	440 aa		5.83	□□□□□ -1.48
KTR2	YKR061W	MMS1	Q06211	1407 aa		5.82	□□□□□ -1.48
KTR2	YKR061W	MLP2	P40457	1679 aa		5.82	□□□□□ -1.48
KTR2	YKR061W	MNN4	P36044	1178 aa		5.82	□□□□□ -1.48
KTR2	YKR061W	GEF1	P37020	779 aa		5.82	□□□□□ -1.48
KTR2	YKR061W	IRC20	Q06554	1556 aa		5.81	□□□□□ -1.48
KTR2	YKR061W	ASF1	P32447	279 aa		5.81	□□□□□ -1.48
KTR2	YKR061W	YBL086C	P38177	466 aa		5.81	□□□□□ -1.48
KTR2	YKR061W	AAD14	P42884	376 aa		5.81	□□□□□ -1.48
KTR2	YKR061W	NUP170	P38181	1502 aa		5.8	□□□□□ -1.48
KTR2	YKR061W	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
KTR2	YKR061W	YIR007W	P40566	764 aa		5.8	□□□□□ -1.48
KTR2	YKR061W	VPS72	Q03388	795 aa		5.8	□□□□□ -1.48
KTR2	YKR061W	YPR204W	Q08995	1032 aa		5.8	□□□□□ -1.48
KTR2	YKR061W	GDB1	Q06625	1536 aa		5.79	□□□□□ -1.48
KTR2	YKR061W	KIN1	P13185	1064 aa		5.79	□□□□□ -1.48
KTR2	YKR061W	SLD2	P34252	453 aa		5.79	□□□□□ -1.48
KTR2	YKR061W	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
KTR2	YKR061W	ESS1	P22696	170 aa		5.78	□□□□□ -1.48
KTR2	YKR061W	BRN1	P38170	754 aa		5.78	□□□□□ -1.48
KTR2	YKR061W	EMW1	P42842	904 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
KTR2	YKR061W	HPF1	Q05164	967 aa		5.78	□□□□□ -1.48
KTR2	YKR061W	RSC30	P38781	883 aa		5.77	□□□□□ -1.49
KTR2	YKR061W	DPH6	Q12429	685 aa		5.77	□□□□□ -1.49
KTR2	YKR061W	IQG1	Q12280	1495 aa		5.77	□□□□□ -1.49
KTR2	YKR061W	PDR10	P51533	1564 aa		5.76	□□□□□ -1.49
KTR2	YKR061W	GEA1	P47102	1408 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
KTR2	YKR061W	YJR098C	P47139	656 aa		5.76	□□□□□ -1.49
KTR2	YKR061W	AIM7	Q12156	149 aa		5.76	□□□□□ -1.49
KTR2	YKR061W	TY3B-G	Q99315	1547 aa		5.74	□□□□□ -1.49
KTR2	YKR061W	YJU3	P28321	313 aa		5.74	□□□□□ -1.49
KTR2	YKR061W	RTS3	P53289	263 aa		5.74	□□□□□ -1.49
KTR2	YKR061W	TCB1	Q12466	1186 aa		5.73	□□□□□ -1.49
KTR2	YKR061W	CAT8	P39113	1433 aa		5.73	□□□□□ -1.49
KTR2	YKR061W	GLC3	P32775	704 aa		5.72	□□□□□ -1.49
KTR2	YKR061W	OSH7	P38755	437 aa		5.72	□□□□□ -1.49
KTR2	YKR061W	LYS5	P50113	272 aa		5.72	□□□□□ -1.49
KTR2	YKR061W	DOS2	P54858	310 aa		5.72	□□□□□ -1.49
KTR2	YKR061W	PKH3	Q03306	898 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
KTR2	YKR061W	DNF2	Q12675	1612 aa		5.72	□□□□□ -1.49
KTR2	YKR061W	TRM3	Q07527	1436 aa		5.72	□□□□□ -1.49
KTR2	YKR061W	BUD3	P25558	1636 aa		5.71	□□□□□ -1.5
KTR2	YKR061W	ARG8	P18544	423 aa		5.71	□□□□□ -1.5
KTR2	YKR061W	SWE1	P32944	819 aa		5.71	□□□□□ -1.5
KTR2	YKR061W	ICP55	P40051	511 aa		5.71	□□□□□ -1.5
KTR2	YKR061W	ROG3	P43602	733 aa		5.71	□□□□□ -1.5
KTR2	YKR061W	MRX12	P47084	519 aa		5.71	□□□□□ -1.5
KTR2	YKR061W	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		5.71	□□□□□ -1.5
KTR2	YKR061W	DOP1	Q03921	1698 aa		5.71	□□□□□ -1.5
KTR2	YKR061W	MKS1	P34072	584 aa		5.7	□□□□□ -1.5
KTR2	YKR061W	APP1	P53933	587 aa		5.7	□□□□□ -1.5
KTR2	YKR061W	GIN4	Q12263	1142 aa		5.7	□□□□□ -1.5
KTR2	YKR061W	YBT1	P32386	1661 aa		5.69	□□□□□ -1.5
KTR2	YKR061W	ARO1	P08566	1588 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
KTR2	YKR061W	YSP2	Q06681	1438 aa		5.69	□□□□□ -1.5
KTR2	YKR061W	DLD1	P32891	587 aa		5.69	□□□□□ -1.5
KTR2	YKR061W	FIG4	P42837	879 aa		5.69	□□□□□ -1.5
KTR2	YKR061W	CSN12	P47130	423 aa		5.69	□□□□□ -1.5
KTR2	YKR061W	FAR11	P53917	953 aa		5.69	□□□□□ -1.5
KTR2	YKR061W	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
KTR2	YKR061W	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.1 ms