RNA–Protein interactions for RNA: YGR214W

RPS0A, Transcript of Ribosomal 40S subunit protein S0A, yeast

Gene RPS0A, Length 759 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS0A	YGR214W	TOS1	P38288	455 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPS0A	YGR214W	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
RPS0A	YGR214W	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
RPS0A	YGR214W	YOL036W	Q08206	761 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPS0A	YGR214W	SNF2	P22082	1703 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPS0A	YGR214W	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
RPS0A	YGR214W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
RPS0A	YGR214W	RAD54	P32863	898 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RPS0A	YGR214W	YBP2	P53169	641 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RPS0A	YGR214W	RLF2	Q12495	606 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RPS0A	YGR214W	PSE1	P32337	1089 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
RPS0A	YGR214W	DCW1	P36091	449 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RPS0A	YGR214W	KIC1	P38692	1080 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RPS0A	YGR214W	TAP42	Q04372	366 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RPS0A	YGR214W	MHP1	P43638	1398 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RPS0A	YGR214W	OSM1	P21375	501 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
RPS0A	YGR214W	SET4	P42948	560 aa		5	□□□□□ -1.61
RPS0A	YGR214W	FPK1	P53739	893 aa		5	□□□□□ -1.61
RPS0A	YGR214W	SSA4	P22202	642 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RPS0A	YGR214W	BCK2	P33306	851 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS0A	YGR214W	ERT1	P38140	529 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS0A	YGR214W	ORC6	P38826	435 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS0A	YGR214W	ILV3	P39522	585 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RPS0A	YGR214W	CWH41	P53008	833 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS0A	YGR214W	MDG1	P53885	366 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS0A	YGR214W	CTF4	Q01454	927 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPS0A	YGR214W	AI4	P03878	556 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS0A	YGR214W	HTA1	P04911	132 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RPS0A	YGR214W	HTA2	P04912	132 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS0A	YGR214W	MPH3	P0CE00	602 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS0A	YGR214W	HGH1	P48362	394 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RPS0A	YGR214W	PUS5	Q06244	254 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS0A	YGR214W	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RPS0A	YGR214W	YML133C	Q03099	1374 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS0A	YGR214W	YLL067C	Q07888	1374 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS0A	YGR214W	YLL066C	Q99208	1374 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPS0A	YGR214W	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPS0A	YGR214W	EAP1	P36041	632 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPS0A	YGR214W	RGA1	P39083	1007 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS0A	YGR214W	NYV1	Q12255	253 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPS0A	YGR214W	YIL177C	P40434	1758 aa		4.96	□□□□□ -1.61
RPS0A	YGR214W	YJL225C	P40889	1758 aa		4.96	□□□□□ -1.61
RPS0A	YGR214W	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPS0A	YGR214W	PFF1	P38244	976 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS0A	YGR214W	SLI15	P38283	698 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS0A	YGR214W	RMT2	Q03305	412 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS0A	YGR214W	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPS0A	YGR214W	RIM15	P43565	1770 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS0A	YGR214W	TOM1	Q03280	3268 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS0A	YGR214W	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPS0A	YGR214W	KIN4	Q01919	800 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS0A	YGR214W	IRC3	Q06683	689 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS0A	YGR214W	NCR1	Q12200	1170 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS0A	YGR214W	TOP1	P04786	769 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS0A	YGR214W	GAP1	P19145	602 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPS0A	YGR214W	RGR1	P19263	1082 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS0A	YGR214W	SEC61	P32915	480 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS0A	YGR214W	YEL023C	P39992	682 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS0A	YGR214W	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
RPS0A	YGR214W	DAN4	P47179	1161 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS0A	YGR214W	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPS0A	YGR214W	TFB3	Q03290	321 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS0A	YGR214W	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPS0A	YGR214W	CTI6	Q08923	506 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS0A	YGR214W	MLP1	Q02455	1875 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPS0A	YGR214W	TEA1	P47988	759 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS0A	YGR214W	DSD1	P53095	428 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS0A	YGR214W	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPS0A	YGR214W	AOS1	Q06624	347 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS0A	YGR214W	HIM1	Q06674	414 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS0A	YGR214W	NUP145	P49687	1317 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS0A	YGR214W	AUS1	Q08409	1394 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS0A	YGR214W	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPS0A	YGR214W	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPS0A	YGR214W	RTG1	P32607	177 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS0A	YGR214W	RTG2	P32608	588 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPS0A	YGR214W	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPS0A	YGR214W	SHC1	P39000	512 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS0A	YGR214W	MVP1	P40959	511 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPS0A	YGR214W	BUB1	P41695	1021 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
RPS0A	YGR214W	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPS0A	YGR214W	CSN12	P47130	423 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS0A	YGR214W	TUM1	Q08686	304 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPS0A	YGR214W	TRP5	P00931	707 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPS0A	YGR214W	KCC4	P25389	1037 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS0A	YGR214W	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPS0A	YGR214W	YKU70	P32807	602 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS0A	YGR214W	PTC4	P38089	393 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS0A	YGR214W	ERO1	Q03103	563 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS0A	YGR214W	BDF2	Q07442	638 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS0A	YGR214W	SSP2	Q08646	371 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS0A	YGR214W	PHM7	Q12252	991 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS0A	YGR214W	GRX6	Q12438	231 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS0A	YGR214W	PKC1	P24583	1151 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS0A	YGR214W	KTR1	P27810	393 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPS0A	YGR214W	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPS0A	YGR214W	ATG20	Q07528	640 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS0A	YGR214W	MSM1	P22438	575 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS0A	YGR214W	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPS0A	YGR214W	CLB5	P30283	435 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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