RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490751.1

LDB1-204, Transcript of LIM domain binding 1, humanhuman

TSL 2

Gene LDB1, Length 762 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB1-204ENST00000490751 BCANQ96GW7 911 aa47.31■■■■■ 5.16
LDB1-204ENST00000490751 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP47.3■■■■■ 5.16
LDB1-204ENST00000490751 HDGFP51858 240 aaKnown RBP47.3■■■■■ 5.16
LDB1-204ENST00000490751 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP47.3■■■■■ 5.16
LDB1-204ENST00000490751 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa47.29■■■■■ 5.16
LDB1-204ENST00000490751 ALKQ9UM73 1620 aa47.28■■■■■ 5.16
LDB1-204ENST00000490751 PIP4K2BP78356 416 aa47.28■■■■■ 5.16
LDB1-204ENST00000490751 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP47.26■■■■■ 5.16
LDB1-204ENST00000490751 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP47.26■■■■■ 5.16
LDB1-204ENST00000490751 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP47.24■■■■■ 5.15
LDB1-204ENST00000490751 TRIM52Q96A61 297 aa47.23■■■■■ 5.15
LDB1-204ENST00000490751 KCNA6P17658 529 aa47.22■■■■■ 5.15
LDB1-204ENST00000490751 NWD1Q149M9 1564 aa47.2■■■■■ 5.15
LDB1-204ENST00000490751 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP47.18■■■■■ 5.14
LDB1-204ENST00000490751 TRPM2O94759 1503 aa47.18■■■■■ 5.14
LDB1-204ENST00000490751 CLTCL1P53675 1640 aa47.16■■■■■ 5.14
LDB1-204ENST00000490751 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP47.12■■■■■ 5.13
LDB1-204ENST00000490751 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP47.1■■■■■ 5.13
LDB1-204ENST00000490751 TMEM94Q12767 1356 aa47.1■■■■■ 5.13
LDB1-204ENST00000490751 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa47.07■■■■■ 5.13
LDB1-204ENST00000490751 HSPA1LP34931 641 aa47.07■■■■■ 5.13
LDB1-204ENST00000490751 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP47.07■■■■■ 5.13
LDB1-204ENST00000490751 TBX22Q9Y458 520 aa47.07■■■■■ 5.13
LDB1-204ENST00000490751 DIP2AQ14689 1571 aa47.07■■■■■ 5.12
LDB1-204ENST00000490751 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP47.06■■■■■ 5.12
LDB1-204ENST00000490751 KIF1BO60333 1816 aa47.04■■■■■ 5.12
LDB1-204ENST00000490751 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP47.03■■■■■ 5.12
LDB1-204ENST00000490751 DISP3Q9P2K9 1392 aa47■■■■■ 5.12
LDB1-204ENST00000490751 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP47■■■■■ 5.11
LDB1-204ENST00000490751 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa46.94■■■■■ 5.1
LDB1-204ENST00000490751 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa46.94■■■■■ 5.1
LDB1-204ENST00000490751 PIK3R4Q99570 1358 aa46.92■■■■■ 5.1
LDB1-204ENST00000490751 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa46.91■■■■■ 5.1
LDB1-204ENST00000490751 FOXD1Q16676 465 aa46.84■■■■■ 5.09
LDB1-204ENST00000490751 MSH6P52701 1360 aa46.84■■■■■ 5.09
LDB1-204ENST00000490751 SETD5Q9C0A6 1442 aa46.8■■■■■ 5.08
LDB1-204ENST00000490751 PTPRUQ92729 1446 aa46.79■■■■■ 5.08
LDB1-204ENST00000490751 MPHOSPH9Q99550 1183 aa46.79■■■■■ 5.08
LDB1-204ENST00000490751 FAM135BQ49AJ0 1406 aa46.76■■■■■ 5.08
LDB1-204ENST00000490751 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa46.75■■■■■ 5.07
LDB1-204ENST00000490751 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa46.74■■■■■ 5.07
LDB1-204ENST00000490751 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP46.74■■■■■ 5.07
LDB1-204ENST00000490751 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa46.72■■■■■ 5.07
LDB1-204ENST00000490751 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP46.7■■■■■ 5.07
LDB1-204ENST00000490751 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP46.69■■■■■ 5.07
LDB1-204ENST00000490751 PPLO60437 1756 aa46.69■■■■■ 5.06
LDB1-204ENST00000490751 C14orf37Q86TY3 774 aa46.69■■■■■ 5.06
LDB1-204ENST00000490751 METP08581 1390 aa46.69■■■■■ 5.06
LDB1-204ENST00000490751 CCDC144AA2RUR9 1427 aa46.69■■■■■ 5.06
LDB1-204ENST00000490751 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa46.67■■■■■ 5.06
LDB1-204ENST00000490751 VGFO15240 615 aaPredicted RBP46.65■■■■■ 5.06
LDB1-204ENST00000490751 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa46.64■■■■■ 5.06
LDB1-204ENST00000490751 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP46.64■■■■■ 5.06
LDB1-204ENST00000490751 ILDR2Q71H61 639 aa46.61■■■■■ 5.05
LDB1-204ENST00000490751 SLAIN2Q9P270 581 aa46.61■■■■■ 5.05
LDB1-204ENST00000490751 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP46.59■■■■■ 5.05
LDB1-204ENST00000490751 C19orf44Q9H6X5 657 aa46.57■■■■■ 5.05
LDB1-204ENST00000490751 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa46.54■■■■■ 5.04
LDB1-204ENST00000490751 CADPS2Q86UW7 1296 aa46.52■■■■■ 5.04
LDB1-204ENST00000490751 ATF3P18847 181 aa46.5■■■■■ 5.03
LDB1-204ENST00000490751 IFT172Q9UG01 1749 aa46.49■■■■■ 5.03
LDB1-204ENST00000490751 RGL3Q3MIN7 710 aa46.49■■■■■ 5.03
LDB1-204ENST00000490751 PHLPP1O60346 1717 aa46.45■■■■■ 5.03
LDB1-204ENST00000490751 DCCP43146 1447 aa46.44■■■■■ 5.02
LDB1-204ENST00000490751 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa46.4■■■■■ 5.02
LDB1-204ENST00000490751 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa46.39■■■■■ 5.02
LDB1-204ENST00000490751 NALCNQ8IZF0 1738 aa46.39■■■■■ 5.02
LDB1-204ENST00000490751 PTCH1Q13635 1447 aa46.37■■■■■ 5.01
LDB1-204ENST00000490751 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa46.37■■■■■ 5.01
LDB1-204ENST00000490751 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP46.33■■■■■ 5.01
LDB1-204ENST00000490751 PRAG1Q86YV5 1406 aa46.33■■■■■ 5.01
LDB1-204ENST00000490751 ROBO2Q9HCK4 1378 aa46.32■■■■■ 5.01
LDB1-204ENST00000490751 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP46.31■■■■■ 5
LDB1-204ENST00000490751 MST1RQ04912 1400 aa46.28■■■■■ 5
LDB1-204ENST00000490751 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP46.28■■■■■ 5
LDB1-204ENST00000490751 HRCP23327 699 aa46.27■■■■■ 5
LDB1-204ENST00000490751 PIK3C2GO75747 1445 aa46.25■■■■■ 4.99
LDB1-204ENST00000490751 BRINP3Q76B58 766 aa46.24■■■■■ 4.99
LDB1-204ENST00000490751 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa46.21■■■■■ 4.99
LDB1-204ENST00000490751 JCADQ9P266 1359 aa46.21■■■■■ 4.99
LDB1-204ENST00000490751 SOCS7O14512 581 aa46.18■■■■■ 4.98
LDB1-204ENST00000490751 MYOM2P54296 1465 aa46.16■■■■■ 4.98
LDB1-204ENST00000490751 NRXN1Q9ULB1 1477 aa46.12■■■■■ 4.97
LDB1-204ENST00000490751 NHSL1Q5SYE7 1610 aa46.12■■■■■ 4.97
LDB1-204ENST00000490751 TECPR2O15040 1411 aa46.11■■■■■ 4.97
LDB1-204ENST00000490751 KNDC1Q76NI1 1749 aa46.11■■■■■ 4.97
LDB1-204ENST00000490751 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP46.11■■■■■ 4.97
LDB1-204ENST00000490751 STK26Q9P289 416 aa46.11■■■■■ 4.97
LDB1-204ENST00000490751 TMEM132EQ6IEE7 984 aa46.1■■■■■ 4.97
LDB1-204ENST00000490751 C1orf167Q5SNV9 1468 aa46.07■■■■■ 4.97
LDB1-204ENST00000490751 LAMC1P11047 1609 aa46.07■■■■■ 4.97
LDB1-204ENST00000490751 SHPRHQ149N8 1683 aa46.06■■■■■ 4.96
LDB1-204ENST00000490751 ABCC11Q96J66 1382 aa46.04■■■■■ 4.96
LDB1-204ENST00000490751 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP46.03■■■■■ 4.96
LDB1-204ENST00000490751 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP46.03■■■■■ 4.96
LDB1-204ENST00000490751 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP46.02■■■■■ 4.96
LDB1-204ENST00000490751 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa46.01■■■■■ 4.96
LDB1-204ENST00000490751 CFAP70Q5T0N1 1121 aa45.99■■■■■ 4.95
LDB1-204ENST00000490751 WAPLQ7Z5K2 1190 aa45.99■■■■■ 4.95
LDB1-204ENST00000490751 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa45.97■■■■■ 4.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 133.1 ms