RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481079.1

PTPRD-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRD, Length 521 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-210ENST00000481079 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa36.12■■■■□ 3.37
PTPRD-210ENST00000481079 TRPM2O94759 1503 aa36.08■■■■□ 3.37
PTPRD-210ENST00000481079 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP36.07■■■■□ 3.36
PTPRD-210ENST00000481079 HDGFP51858 240 aaKnown RBP36.06■■■■□ 3.36
PTPRD-210ENST00000481079 CLTCL1P53675 1640 aa36.05■■■■□ 3.36
PTPRD-210ENST00000481079 TRIM52Q96A61 297 aa36.05■■■■□ 3.36
PTPRD-210ENST00000481079 TOM1O60784 492 aa36.04■■■■□ 3.36
PTPRD-210ENST00000481079 NWD1Q149M9 1564 aa36.03■■■■□ 3.36
PTPRD-210ENST00000481079 KCNA6P17658 529 aa36.03■■■■□ 3.36
PTPRD-210ENST00000481079 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP36.03■■■■□ 3.36
PTPRD-210ENST00000481079 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP36.02■■■■□ 3.36
PTPRD-210ENST00000481079 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP36.01■■■■□ 3.36
PTPRD-210ENST00000481079 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP36■■■■□ 3.35
PTPRD-210ENST00000481079 BCANQ96GW7 911 aa35.99■■■■□ 3.35
PTPRD-210ENST00000481079 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa35.98■■■■□ 3.35
PTPRD-210ENST00000481079 PIP4K2BP78356 416 aa35.96■■■■□ 3.35
PTPRD-210ENST00000481079 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP35.96■■■■□ 3.35
PTPRD-210ENST00000481079 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP35.96■■■■□ 3.35
PTPRD-210ENST00000481079 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP35.94■■■■□ 3.34
PTPRD-210ENST00000481079 TBX22Q9Y458 520 aa35.94■■■■□ 3.34
PTPRD-210ENST00000481079 TMEM94Q12767 1356 aa35.93■■■■□ 3.34
PTPRD-210ENST00000481079 DIP2AQ14689 1571 aa35.92■■■■□ 3.34
PTPRD-210ENST00000481079 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP35.9■■■■□ 3.34
PTPRD-210ENST00000481079 KIF1BO60333 1816 aa35.9■■■■□ 3.34
PTPRD-210ENST00000481079 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa35.88■■■■□ 3.33
PTPRD-210ENST00000481079 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa35.88■■■■□ 3.33
PTPRD-210ENST00000481079 HSPA1LP34931 641 aa35.86■■■■□ 3.33
PTPRD-210ENST00000481079 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP35.86■■■■□ 3.33
PTPRD-210ENST00000481079 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa35.85■■■■□ 3.33
PTPRD-210ENST00000481079 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP35.85■■■■□ 3.33
PTPRD-210ENST00000481079 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP35.84■■■■□ 3.33
PTPRD-210ENST00000481079 SETD5Q9C0A6 1442 aa35.83■■■■□ 3.33
PTPRD-210ENST00000481079 FOXD1Q16676 465 aa35.83■■■■□ 3.33
PTPRD-210ENST00000481079 PIK3R4Q99570 1358 aa35.83■■■■□ 3.33
PTPRD-210ENST00000481079 MPHOSPH9Q99550 1183 aa35.81■■■■□ 3.32
PTPRD-210ENST00000481079 PTPRUQ92729 1446 aa35.77■■■■□ 3.32
PTPRD-210ENST00000481079 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP35.71■■■■□ 3.31
PTPRD-210ENST00000481079 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa35.71■■■■□ 3.31
PTPRD-210ENST00000481079 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP35.7■■■■□ 3.31
PTPRD-210ENST00000481079 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa35.7■■■■□ 3.31
PTPRD-210ENST00000481079 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa35.69■■■■□ 3.3
PTPRD-210ENST00000481079 METP08581 1390 aa35.68■■■■□ 3.3
PTPRD-210ENST00000481079 PPLO60437 1756 aa35.68■■■■□ 3.3
PTPRD-210ENST00000481079 FAM135BQ49AJ0 1406 aa35.67■■■■□ 3.3
PTPRD-210ENST00000481079 MSH6P52701 1360 aa35.67■■■■□ 3.3
PTPRD-210ENST00000481079 DISP3Q9P2K9 1392 aa35.67■■■■□ 3.3
PTPRD-210ENST00000481079 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa35.67■■■■□ 3.3
PTPRD-210ENST00000481079 CCDC144AA2RUR9 1427 aa35.66■■■■□ 3.3
PTPRD-210ENST00000481079 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa35.64■■■■□ 3.3
PTPRD-210ENST00000481079 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP35.63■■■■□ 3.29
PTPRD-210ENST00000481079 VGFO15240 615 aaPredicted RBP35.63■■■■□ 3.29
PTPRD-210ENST00000481079 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa35.61■■■■□ 3.29
PTPRD-210ENST00000481079 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP35.58■■■■□ 3.29
PTPRD-210ENST00000481079 IFT172Q9UG01 1749 aa35.55■■■■□ 3.28
PTPRD-210ENST00000481079 SLAIN2Q9P270 581 aa35.55■■■■□ 3.28
PTPRD-210ENST00000481079 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP35.53■■■■□ 3.28
PTPRD-210ENST00000481079 C19orf44Q9H6X5 657 aa35.53■■■■□ 3.28
PTPRD-210ENST00000481079 C14orf37Q86TY3 774 aa35.51■■■■□ 3.28
PTPRD-210ENST00000481079 RGL3Q3MIN7 710 aa35.5■■■■□ 3.27
PTPRD-210ENST00000481079 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa35.49■■■■□ 3.27
PTPRD-210ENST00000481079 HRCP23327 699 aa35.48■■■■□ 3.27
PTPRD-210ENST00000481079 ILDR2Q71H61 639 aa35.46■■■■□ 3.27
PTPRD-210ENST00000481079 CADPS2Q86UW7 1296 aa35.46■■■■□ 3.27
PTPRD-210ENST00000481079 PRAG1Q86YV5 1406 aa35.46■■■■□ 3.27
PTPRD-210ENST00000481079 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa35.45■■■■□ 3.27
PTPRD-210ENST00000481079 DCCP43146 1447 aa35.45■■■■□ 3.27
PTPRD-210ENST00000481079 PTCH1Q13635 1447 aa35.43■■■■□ 3.26
PTPRD-210ENST00000481079 ATF3P18847 181 aa35.42■■■■□ 3.26
PTPRD-210ENST00000481079 NALCNQ8IZF0 1738 aa35.4■■■■□ 3.26
PTPRD-210ENST00000481079 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa35.4■■■■□ 3.26
PTPRD-210ENST00000481079 ROBO2Q9HCK4 1378 aa35.39■■■■□ 3.26
PTPRD-210ENST00000481079 PIK3C2GO75747 1445 aa35.38■■■■□ 3.25
PTPRD-210ENST00000481079 PHLPP1O60346 1717 aa35.37■■■■□ 3.25
PTPRD-210ENST00000481079 MST1RQ04912 1400 aa35.34■■■■□ 3.25
PTPRD-210ENST00000481079 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa35.33■■■■□ 3.25
PTPRD-210ENST00000481079 NRXN1Q9ULB1 1477 aa35.33■■■■□ 3.25
PTPRD-210ENST00000481079 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP35.32■■■■□ 3.25
PTPRD-210ENST00000481079 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP35.31■■■■□ 3.24
PTPRD-210ENST00000481079 MYOM2P54296 1465 aa35.3■■■■□ 3.24
PTPRD-210ENST00000481079 BRINP3Q76B58 766 aa35.29■■■■□ 3.24
PTPRD-210ENST00000481079 TECPR2O15040 1411 aa35.26■■■■□ 3.24
PTPRD-210ENST00000481079 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP35.24■■■■□ 3.23
PTPRD-210ENST00000481079 TMEM132EQ6IEE7 984 aa35.22■■■■□ 3.23
PTPRD-210ENST00000481079 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP35.22■■■■□ 3.23
PTPRD-210ENST00000481079 KNDC1Q76NI1 1749 aa35.22■■■■□ 3.23
PTPRD-210ENST00000481079 ABCC11Q96J66 1382 aa35.21■■■■□ 3.23
PTPRD-210ENST00000481079 JCADQ9P266 1359 aa35.2■■■■□ 3.23
PTPRD-210ENST00000481079 LAMC1P11047 1609 aa35.18■■■■□ 3.22
PTPRD-210ENST00000481079 NHSL1Q5SYE7 1610 aa35.18■■■■□ 3.22
PTPRD-210ENST00000481079 STK26Q9P289 416 aa35.18■■■■□ 3.22
PTPRD-210ENST00000481079 C1orf167Q5SNV9 1468 aa35.17■■■■□ 3.22
PTPRD-210ENST00000481079 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP35.17■■■■□ 3.22
PTPRD-210ENST00000481079 CFAP70Q5T0N1 1121 aa35.16■■■■□ 3.22
PTPRD-210ENST00000481079 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP35.15■■■■□ 3.22
PTPRD-210ENST00000481079 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa35.13■■■■□ 3.21
PTPRD-210ENST00000481079 WAPLQ7Z5K2 1190 aa35.13■■■■□ 3.21
PTPRD-210ENST00000481079 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa35.12■■■■□ 3.21
PTPRD-210ENST00000481079 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP35.11■■■■□ 3.21
PTPRD-210ENST00000481079 SHPRHQ149N8 1683 aa35.11■■■■□ 3.21
PTPRD-210ENST00000481079 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP35.1■■■■□ 3.21
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