RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466539.1

PSME4-204, Transcript of proteasome activator subunit 4, humanhuman

TSL 4

Gene PSME4, Length 548 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4-204ENST00000466539 GNPATO15228 680 aa10.12□□□□□ -0.79
PSME4-204ENST00000466539 PROX2Q3B8N5 592 aa10.12□□□□□ -0.79
PSME4-204ENST00000466539 BARGINQ6ZT62 677 aa10.12□□□□□ -0.79
PSME4-204ENST00000466539 ADAMTS12P58397 1594 aa10.11□□□□□ -0.79
PSME4-204ENST00000466539 HIC1Q14526 733 aa10.11□□□□□ -0.79
PSME4-204ENST00000466539 CDCA7LQ96GN5 454 aa10.11□□□□□ -0.79
PSME4-204ENST00000466539 ZBED2Q9BTP6 218 aa10.11□□□□□ -0.79
PSME4-204ENST00000466539 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa10.11□□□□□ -0.79
PSME4-204ENST00000466539 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa10.11□□□□□ -0.79
PSME4-204ENST00000466539 GOLGA3Q08378 1498 aa10.1□□□□□ -0.79
PSME4-204ENST00000466539 GRIN2BQ13224 1484 aa10.1□□□□□ -0.79
PSME4-204ENST00000466539 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa10.1□□□□□ -0.79
PSME4-204ENST00000466539 C3orf80F5H4A9 247 aa10.1□□□□□ -0.79
PSME4-204ENST00000466539 PBX2P40425 430 aa10.1□□□□□ -0.79
PSME4-204ENST00000466539 PRSS12P56730 875 aa10.1□□□□□ -0.79
PSME4-204ENST00000466539 MMRN1Q13201 1228 aa10.1□□□□□ -0.79
PSME4-204ENST00000466539 PADI6Q6TGC4 694 aa10.1□□□□□ -0.79
PSME4-204ENST00000466539 TSKSQ9UJT2 592 aa10.1□□□□□ -0.79
PSME4-204ENST00000466539 FAM161AQ3B820 660 aa10.09□□□□□ -0.79
PSME4-204ENST00000466539 TTC13Q8NBP0 860 aa10.09□□□□□ -0.79
PSME4-204ENST00000466539 CERKQ8TCT0 537 aa10.09□□□□□ -0.79
PSME4-204ENST00000466539 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
PSME4-204ENST00000466539 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP10.09□□□□□ -0.798e-8■■■■■ 39.5
PSME4-204ENST00000466539 SLC24A3Q9HC58 644 aa10.08□□□□□ -0.8
PSME4-204ENST00000466539 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
PSME4-204ENST00000466539 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa10.07□□□□□ -0.8
PSME4-204ENST00000466539 TNIKQ9UKE5 1360 aa10.07□□□□□ -0.8
PSME4-204ENST00000466539 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP10.06□□□□□ -0.8
PSME4-204ENST00000466539 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa10.06□□□□□ -0.8
PSME4-204ENST00000466539 FHAD1B1AJZ9 1412 aa10.06□□□□□ -0.8
PSME4-204ENST00000466539 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa10.05□□□□□ -0.8
PSME4-204ENST00000466539 IRF6O14896 467 aa10.04□□□□□ -0.8
PSME4-204ENST00000466539 KCNH8Q96L42 1107 aa10.04□□□□□ -0.8
PSME4-204ENST00000466539 SLC4A5Q9BY07 1137 aa10.04□□□□□ -0.8
PSME4-204ENST00000466539 MAP2K5Q13163 448 aa10.03□□□□□ -0.8
PSME4-204ENST00000466539 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa10.03□□□□□ -0.8
PSME4-204ENST00000466539 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
PSME4-204ENST00000466539 KIAA1468Q9P260 1216 aa10.03□□□□□ -0.8
PSME4-204ENST00000466539 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
PSME4-204ENST00000466539 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa10.02□□□□□ -0.8
PSME4-204ENST00000466539 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa10.02□□□□□ -0.81
PSME4-204ENST00000466539 ADGRG1Q9Y653 693 aa10.02□□□□□ -0.81
PSME4-204ENST00000466539 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa10.02□□□□□ -0.81
PSME4-204ENST00000466539 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
PSME4-204ENST00000466539 SMAPO00193 183 aa10.01□□□□□ -0.81
PSME4-204ENST00000466539 ADGRD1Q6QNK2 874 aa10.01□□□□□ -0.81
PSME4-204ENST00000466539 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
PSME4-204ENST00000466539 CCDC102AQ96A19 550 aa10.01□□□□□ -0.81
PSME4-204ENST00000466539 PHOX2BQ99453 314 aa10.01□□□□□ -0.81
PSME4-204ENST00000466539 SYNJ2O15056 1496 aa10.01□□□□□ -0.81
PSME4-204ENST00000466539 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
PSME4-204ENST00000466539 HRO43593 1189 aa10□□□□□ -0.81
PSME4-204ENST00000466539 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
PSME4-204ENST00000466539 NUP160Q12769 1436 aa9.99□□□□□ -0.81
PSME4-204ENST00000466539 GRIN2AQ12879 1464 aa9.99□□□□□ -0.81
PSME4-204ENST00000466539 TK2O00142 265 aa9.99□□□□□ -0.81
PSME4-204ENST00000466539 NUDT18Q6ZVK8 323 aa9.99□□□□□ -0.81
PSME4-204ENST00000466539 TATDN2Q93075 761 aa9.99□□□□□ -0.81
PSME4-204ENST00000466539 EYA1Q99502 592 aa9.99□□□□□ -0.81
PSME4-204ENST00000466539 RABGEF1Q9UJ41 708 aa9.99□□□□□ -0.81
PSME4-204ENST00000466539 PACS2Q86VP3 889 aa9.97□□□□□ -0.81
PSME4-204ENST00000466539 NLRP7Q8WX94 980 aa9.97□□□□□ -0.81
PSME4-204ENST00000466539 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
PSME4-204ENST00000466539 PNMA3Q9UL41 463 aa9.97□□□□□ -0.81
PSME4-204ENST00000466539 TRIM66O15016 1216 aa9.96□□□□□ -0.82
PSME4-204ENST00000466539 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
PSME4-204ENST00000466539 PXYLP1Q8TE99 480 aa9.96□□□□□ -0.82
PSME4-204ENST00000466539 AK7Q96M32 723 aa9.96□□□□□ -0.82
PSME4-204ENST00000466539 CEP162Q5TB80 1403 aa9.96□□□□□ -0.82
PSME4-204ENST00000466539 SAMD9Q5K651 1589 aa9.96□□□□□ -0.82
PSME4-204ENST00000466539 CEP170Q5SW79 1584 aa9.96□□□□□ -0.82
PSME4-204ENST00000466539 CHD1O14646 1710 aa9.95□□□□□ -0.82
PSME4-204ENST00000466539 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa9.94□□□□□ -0.82
PSME4-204ENST00000466539 UGGT2Q9NYU1 1516 aa9.94□□□□□ -0.82
PSME4-204ENST00000466539 OATP04181 439 aa9.93□□□□□ -0.82
PSME4-204ENST00000466539 SHROOM2Q13796 1616 aa9.93□□□□□ -0.82
PSME4-204ENST00000466539 IQGAP2Q13576 1575 aa9.92□□□□□ -0.82
PSME4-204ENST00000466539 EFCAB5A4FU69 1503 aa9.92□□□□□ -0.82
PSME4-204ENST00000466539 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa9.92□□□□□ -0.82
PSME4-204ENST00000466539 NBPF26B4DH59 902 aa9.92□□□□□ -0.82
PSME4-204ENST00000466539 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PSME4-204ENST00000466539 RCCD1A6NED2 376 aa9.91□□□□□ -0.82
PSME4-204ENST00000466539 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
PSME4-204ENST00000466539 CLASP1Q7Z460 1538 aa9.91□□□□□ -0.82
PSME4-204ENST00000466539 ARAP1Q96P48 1450 aa9.9□□□□□ -0.83
PSME4-204ENST00000466539 CLIP1P30622 1438 aa9.9□□□□□ -0.83
PSME4-204ENST00000466539 PDE4DQ08499 809 aa9.89□□□□□ -0.83
PSME4-204ENST00000466539 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PSME4-204ENST00000466539 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PSME4-204ENST00000466539 NBPF3Q9H094 633 aa9.88□□□□□ -0.83
PSME4-204ENST00000466539 DISP1Q96F81 1524 aa9.87□□□□□ -0.83
PSME4-204ENST00000466539 AMHR2Q16671 573 aa9.87□□□□□ -0.83
PSME4-204ENST00000466539 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
PSME4-204ENST00000466539 TMUB1Q9BVT8 246 aa9.87□□□□□ -0.83
PSME4-204ENST00000466539 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
PSME4-204ENST00000466539 LAPTM4BQ86VI4 370 aa9.86□□□□□ -0.83
PSME4-204ENST00000466539 VPS8Q8N3P4 1428 aa9.85□□□□□ -0.83
PSME4-204ENST00000466539 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
PSME4-204ENST00000466539 UBTFP17480 764 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
PSME4-204ENST00000466539 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.8 ms