RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466278.1

MKL1-208, Transcript of MKL/myocardin-like protein 1, human

TSL 3

Gene MKL1, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MKL1-208	ENST00000466278	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		34.36	■■■■□ 3.09
MKL1-208	ENST00000466278	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	34.35	■■■■□ 3.09
MKL1-208	ENST00000466278	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	34.33	■■■■□ 3.09
MKL1-208	ENST00000466278	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		34.33	■■■■□ 3.09
MKL1-208	ENST00000466278	BCAN	Q96GW7	911 aa		34.31	■■■■□ 3.08
MKL1-208	ENST00000466278	TRPM2	O94759	1503 aa		34.3	■■■■□ 3.08
MKL1-208	ENST00000466278	NWD1	Q149M9	1564 aa		34.3	■■■■□ 3.08
MKL1-208	ENST00000466278	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	34.29	■■■■□ 3.08
MKL1-208	ENST00000466278	ALK	Q9UM73	1620 aa		34.29	■■■■□ 3.08
MKL1-208	ENST00000466278	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	34.29	■■■■□ 3.08
MKL1-208	ENST00000466278	TRIM52	Q96A61	297 aa		34.28	■■■■□ 3.08
MKL1-208	ENST00000466278	KCNA6	P17658	529 aa		34.27	■■■■□ 3.08
MKL1-208	ENST00000466278	PIP4K2B	P78356	416 aa		34.27	■■■■□ 3.08
MKL1-208	ENST00000466278	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	34.26	■■■■□ 3.07
MKL1-208	ENST00000466278	CLTCL1	P53675	1640 aa		34.26	■■■■□ 3.07
MKL1-208	ENST00000466278	DIP2A	Q14689	1571 aa		34.23	■■■■□ 3.07
MKL1-208	ENST00000466278	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	34.21	■■■■□ 3.07
MKL1-208	ENST00000466278	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	34.2	■■■■□ 3.07
MKL1-208	ENST00000466278	KIF1B	O60333	1816 aa		34.19	■■■■□ 3.06
MKL1-208	ENST00000466278	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	34.19	■■■■□ 3.06
MKL1-208	ENST00000466278	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	34.19	■■■■□ 3.06
MKL1-208	ENST00000466278	TMEM94	Q12767	1356 aa		34.18	■■■■□ 3.06
MKL1-208	ENST00000466278	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		34.17	■■■■□ 3.06
MKL1-208	ENST00000466278	TBX22	Q9Y458	520 aa		34.17	■■■■□ 3.06
MKL1-208	ENST00000466278	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	34.14	■■■■□ 3.06
MKL1-208	ENST00000466278	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	34.14	■■■■□ 3.06
MKL1-208	ENST00000466278	HSPA1L	P34931	641 aa		34.11	■■■■□ 3.05
MKL1-208	ENST00000466278	PIK3R4	Q99570	1358 aa		34.11	■■■■□ 3.05
MKL1-208	ENST00000466278	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		34.1	■■■■□ 3.05
MKL1-208	ENST00000466278	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		34.09	■■■■□ 3.05
MKL1-208	ENST00000466278	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		34.08	■■■■□ 3.05
MKL1-208	ENST00000466278	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		34.07	■■■■□ 3.04
MKL1-208	ENST00000466278	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	34.04	■■■■□ 3.04
MKL1-208	ENST00000466278	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	34.03	■■■■□ 3.04
MKL1-208	ENST00000466278	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		34.03	■■■■□ 3.04
MKL1-208	ENST00000466278	MSH6	P52701	1360 aa		34.02	■■■■□ 3.04
MKL1-208	ENST00000466278	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		33.99	■■■■□ 3.03
MKL1-208	ENST00000466278	FOXD1	Q16676	465 aa		33.97	■■■■□ 3.03
MKL1-208	ENST00000466278	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		33.97	■■■■□ 3.03
MKL1-208	ENST00000466278	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	33.96	■■■■□ 3.03
MKL1-208	ENST00000466278	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		33.96	■■■■□ 3.03
MKL1-208	ENST00000466278	PTPRU	Q92729	1446 aa		33.96	■■■■□ 3.03
MKL1-208	ENST00000466278	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		33.95	■■■■□ 3.02
MKL1-208	ENST00000466278	PPL	O60437	1756 aa		33.93	■■■■□ 3.02
MKL1-208	ENST00000466278	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		33.92	■■■■□ 3.02
MKL1-208	ENST00000466278	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		33.92	■■■■□ 3.02
MKL1-208	ENST00000466278	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		33.91	■■■■□ 3.02
MKL1-208	ENST00000466278	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		33.89	■■■■□ 3.02
MKL1-208	ENST00000466278	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	33.89	■■■■□ 3.02
MKL1-208	ENST00000466278	MET	P08581	1390 aa		33.88	■■■■□ 3.01
MKL1-208	ENST00000466278	C14orf37	Q86TY3	774 aa		33.88	■■■■□ 3.01
MKL1-208	ENST00000466278	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	33.87	■■■■□ 3.01
MKL1-208	ENST00000466278	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	33.85	■■■■□ 3.01
MKL1-208	ENST00000466278	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	33.84	■■■■□ 3.01
MKL1-208	ENST00000466278	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		33.82	■■■■□ 3
MKL1-208	ENST00000466278	SLAIN2	Q9P270	581 aa		33.82	■■■■□ 3
MKL1-208	ENST00000466278	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		33.81	■■■■□ 3
MKL1-208	ENST00000466278	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		33.79	■■■■□ 3
MKL1-208	ENST00000466278	IFT172	Q9UG01	1749 aa		33.78	■■■■□ 3
MKL1-208	ENST00000466278	DCC	P43146	1447 aa		33.78	■■■■□ 3
MKL1-208	ENST00000466278	ATF3	P18847	181 aa		33.76	■■■□□ 2.99
MKL1-208	ENST00000466278	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		33.73	■■■□□ 2.99
MKL1-208	ENST00000466278	RGL3	Q3MIN7	710 aa		33.73	■■■□□ 2.99
MKL1-208	ENST00000466278	PTCH1	Q13635	1447 aa		33.72	■■■□□ 2.99
MKL1-208	ENST00000466278	ILDR2	Q71H61	639 aa		33.72	■■■□□ 2.99
MKL1-208	ENST00000466278	PHLPP1	O60346	1717 aa		33.71	■■■□□ 2.99
MKL1-208	ENST00000466278	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		33.7	■■■□□ 2.99
MKL1-208	ENST00000466278	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		33.7	■■■□□ 2.98
MKL1-208	ENST00000466278	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		33.68	■■■□□ 2.98
MKL1-208	ENST00000466278	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		33.67	■■■□□ 2.98
MKL1-208	ENST00000466278	HRC	P23327	699 aa		33.66	■■■□□ 2.98
MKL1-208	ENST00000466278	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	33.62	■■■□□ 2.97
MKL1-208	ENST00000466278	PIK3C2G	O75747	1445 aa		33.62	■■■□□ 2.97
MKL1-208	ENST00000466278	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		33.61	■■■□□ 2.97
MKL1-208	ENST00000466278	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	33.61	■■■□□ 2.97
MKL1-208	ENST00000466278	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	33.61	■■■□□ 2.97
MKL1-208	ENST00000466278	MST1R	Q04912	1400 aa		33.61	■■■□□ 2.97
MKL1-208	ENST00000466278	MYOM2	P54296	1465 aa		33.57	■■■□□ 2.97
MKL1-208	ENST00000466278	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		33.56	■■■□□ 2.96
MKL1-208	ENST00000466278	BRINP3	Q76B58	766 aa		33.55	■■■□□ 2.96
MKL1-208	ENST00000466278	JCAD	Q9P266	1359 aa		33.55	■■■□□ 2.96
MKL1-208	ENST00000466278	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		33.53	■■■□□ 2.96
MKL1-208	ENST00000466278	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		33.53	■■■□□ 2.96
MKL1-208	ENST00000466278	TECPR2	O15040	1411 aa		33.53	■■■□□ 2.96
MKL1-208	ENST00000466278	LAMC1	P11047	1609 aa		33.52	■■■□□ 2.96
MKL1-208	ENST00000466278	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	33.5	■■■□□ 2.95
MKL1-208	ENST00000466278	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		33.5	■■■□□ 2.95
MKL1-208	ENST00000466278	SOCS7	O14512	581 aa		33.47	■■■□□ 2.95
MKL1-208	ENST00000466278	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		33.46	■■■□□ 2.95
MKL1-208	ENST00000466278	ABCC11	Q96J66	1382 aa		33.46	■■■□□ 2.95
MKL1-208	ENST00000466278	SHPRH	Q149N8	1683 aa		33.45	■■■□□ 2.95
MKL1-208	ENST00000466278	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		33.45	■■■□□ 2.95
MKL1-208	ENST00000466278	STK26	Q9P289	416 aa		33.44	■■■□□ 2.94
MKL1-208	ENST00000466278	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	33.44	■■■□□ 2.94
MKL1-208	ENST00000466278	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		33.43	■■■□□ 2.94
MKL1-208	ENST00000466278	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	33.43	■■■□□ 2.94
MKL1-208	ENST00000466278	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		33.39	■■■□□ 2.94
MKL1-208	ENST00000466278	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		33.37	■■■□□ 2.93
MKL1-208	ENST00000466278	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	33.35	■■■□□ 2.93
MKL1-208	ENST00000466278	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		33.34	■■■□□ 2.93

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