RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	CLTCL1	P53675	1640 aa		26.27	■■□□□ 1.8
USP19-210	ENST00000465902	KIF1B	O60333	1816 aa		26.26	■■□□□ 1.79
USP19-210	ENST00000465902	BCAN	Q96GW7	911 aa		26.26	■■□□□ 1.79
USP19-210	ENST00000465902	CPS1	P31327	1500 aa		26.25	■■□□□ 1.79
USP19-210	ENST00000465902	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	26.25	■■□□□ 1.79
USP19-210	ENST00000465902	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	26.25	■■□□□ 1.79
USP19-210	ENST00000465902	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	26.25	■■□□□ 1.79
USP19-210	ENST00000465902	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		26.24	■■□□□ 1.79
USP19-210	ENST00000465902	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	26.24	■■□□□ 1.79
USP19-210	ENST00000465902	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		26.23	■■□□□ 1.79
USP19-210	ENST00000465902	HRC	P23327	699 aa		26.21	■■□□□ 1.79
USP19-210	ENST00000465902	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	26.21	■■□□□ 1.79
USP19-210	ENST00000465902	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	26.19	■■□□□ 1.78
USP19-210	ENST00000465902	ZFYVE9	O95405	1425 aa		26.17	■■□□□ 1.78
USP19-210	ENST00000465902	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	26.16	■■□□□ 1.78
USP19-210	ENST00000465902	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		26.15	■■□□□ 1.78
USP19-210	ENST00000465902	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		26.15	■■□□□ 1.78
USP19-210	ENST00000465902	TOM1	O60784	492 aa		26.13	■■□□□ 1.77
USP19-210	ENST00000465902	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		26.1	■■□□□ 1.77
USP19-210	ENST00000465902	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		26.08	■■□□□ 1.77
USP19-210	ENST00000465902	RGL3	Q3MIN7	710 aa		26.07	■■□□□ 1.76
USP19-210	ENST00000465902	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		26.06	■■□□□ 1.76
USP19-210	ENST00000465902	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		26.04	■■□□□ 1.76
USP19-210	ENST00000465902	PIP4K2B	P78356	416 aa		26.03	■■□□□ 1.76
USP19-210	ENST00000465902	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		26.01	■■□□□ 1.75
USP19-210	ENST00000465902	PPL	O60437	1756 aa		26	■■□□□ 1.75
USP19-210	ENST00000465902	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	26	■■□□□ 1.75
USP19-210	ENST00000465902	KCNA6	P17658	529 aa		26	■■□□□ 1.75
USP19-210	ENST00000465902	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		25.99	■■□□□ 1.75
USP19-210	ENST00000465902	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	25.99	■■□□□ 1.75
USP19-210	ENST00000465902	TBX22	Q9Y458	520 aa		25.99	■■□□□ 1.75
USP19-210	ENST00000465902	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		25.97	■■□□□ 1.75
USP19-210	ENST00000465902	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		25.97	■■□□□ 1.75
USP19-210	ENST00000465902	ALK	Q9UM73	1620 aa		25.96	■■□□□ 1.75
USP19-210	ENST00000465902	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	25.95	■■□□□ 1.75
USP19-210	ENST00000465902	DIP2A	Q14689	1571 aa		25.95	■■□□□ 1.75
USP19-210	ENST00000465902	HSPA1L	P34931	641 aa		25.95	■■□□□ 1.74
USP19-210	ENST00000465902	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		25.95	■■□□□ 1.74
USP19-210	ENST00000465902	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		25.94	■■□□□ 1.74
USP19-210	ENST00000465902	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		25.93	■■□□□ 1.74
USP19-210	ENST00000465902	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	25.92	■■□□□ 1.74
USP19-210	ENST00000465902	IFT172	Q9UG01	1749 aa		25.91	■■□□□ 1.74
USP19-210	ENST00000465902	TMEM94	Q12767	1356 aa		25.89	■■□□□ 1.74
USP19-210	ENST00000465902	NWD1	Q149M9	1564 aa		25.88	■■□□□ 1.73
USP19-210	ENST00000465902	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	25.88	■■□□□ 1.73
USP19-210	ENST00000465902	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		25.88	■■□□□ 1.73
USP19-210	ENST00000465902	PIK3R4	Q99570	1358 aa		25.87	■■□□□ 1.73
USP19-210	ENST00000465902	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	25.87	■■□□□ 1.73
USP19-210	ENST00000465902	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		25.86	■■□□□ 1.73
USP19-210	ENST00000465902	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	25.85	■■□□□ 1.73
USP19-210	ENST00000465902	MET	P08581	1390 aa		25.84	■■□□□ 1.73
USP19-210	ENST00000465902	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		25.82	■■□□□ 1.72
USP19-210	ENST00000465902	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		25.82	■■□□□ 1.72
USP19-210	ENST00000465902	PTPRU	Q92729	1446 aa		25.81	■■□□□ 1.72
USP19-210	ENST00000465902	C14orf37	Q86TY3	774 aa		25.81	■■□□□ 1.72
USP19-210	ENST00000465902	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		25.8	■■□□□ 1.72
USP19-210	ENST00000465902	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	25.8	■■□□□ 1.72
USP19-210	ENST00000465902	ILDR2	Q71H61	639 aa		25.79	■■□□□ 1.72
USP19-210	ENST00000465902	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	25.79	■■□□□ 1.72
USP19-210	ENST00000465902	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		25.77	■■□□□ 1.72
USP19-210	ENST00000465902	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	25.76	■■□□□ 1.71
USP19-210	ENST00000465902	MYOM2	P54296	1465 aa		25.75	■■□□□ 1.71
USP19-210	ENST00000465902	PIK3C2G	O75747	1445 aa		25.75	■■□□□ 1.71
USP19-210	ENST00000465902	NEUROD1	Q13562	356 aa		25.75	■■□□□ 1.71
USP19-210	ENST00000465902	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		25.74	■■□□□ 1.71
USP19-210	ENST00000465902	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		25.73	■■□□□ 1.71
USP19-210	ENST00000465902	MSH6	P52701	1360 aa		25.73	■■□□□ 1.71
USP19-210	ENST00000465902	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		25.71	■■□□□ 1.71
USP19-210	ENST00000465902	STK26	Q9P289	416 aa		25.71	■■□□□ 1.71
USP19-210	ENST00000465902	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		25.7	■■□□□ 1.7
USP19-210	ENST00000465902	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		25.69	■■□□□ 1.7
USP19-210	ENST00000465902	LAMC1	P11047	1609 aa		25.68	■■□□□ 1.7
USP19-210	ENST00000465902	STAC3	Q96MF2	364 aa		25.68	■■□□□ 1.7
USP19-210	ENST00000465902	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	25.68	■■□□□ 1.7
USP19-210	ENST00000465902	SLAIN2	Q9P270	581 aa		25.67	■■□□□ 1.7
USP19-210	ENST00000465902	ATF3	P18847	181 aa		25.65	■■□□□ 1.7
USP19-210	ENST00000465902	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		25.65	■■□□□ 1.7
USP19-210	ENST00000465902	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	25.65	■■□□□ 1.7
USP19-210	ENST00000465902	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	25.65	■■□□□ 1.7
USP19-210	ENST00000465902	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		25.63	■■□□□ 1.69
USP19-210	ENST00000465902	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		25.63	■■□□□ 1.69
USP19-210	ENST00000465902	PTCH1	Q13635	1447 aa		25.62	■■□□□ 1.69
USP19-210	ENST00000465902	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	25.61	■■□□□ 1.69
USP19-210	ENST00000465902	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	25.61	■■□□□ 1.69
USP19-210	ENST00000465902	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		25.6	■■□□□ 1.69
USP19-210	ENST00000465902	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		25.6	■■□□□ 1.69
USP19-210	ENST00000465902	SOCS7	O14512	581 aa		25.59	■■□□□ 1.69
USP19-210	ENST00000465902	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		25.58	■■□□□ 1.69
USP19-210	ENST00000465902	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		25.58	■■□□□ 1.69
USP19-210	ENST00000465902	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		25.58	■■□□□ 1.69
USP19-210	ENST00000465902	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		25.57	■■□□□ 1.68
USP19-210	ENST00000465902	ABCC11	Q96J66	1382 aa		25.56	■■□□□ 1.68
USP19-210	ENST00000465902	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		25.56	■■□□□ 1.68
USP19-210	ENST00000465902	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		25.55	■■□□□ 1.68
USP19-210	ENST00000465902	TECPR2	O15040	1411 aa		25.54	■■□□□ 1.68
USP19-210	ENST00000465902	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	25.53	■■□□□ 1.68
USP19-210	ENST00000465902	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		25.53	■■□□□ 1.68
USP19-210	ENST00000465902	DCC	P43146	1447 aa		25.52	■■□□□ 1.68
USP19-210	ENST00000465902	TONSL	Q96HA7	1378 aa		25.51	■■□□□ 1.67
USP19-210	ENST00000465902	ADGRB1	O14514	1584 aa		25.51	■■□□□ 1.67

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