RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458354.5

PNCK-216, Transcript of pregnancy up-regulated nonubiquitous CaM kinase, human

TSL 3

Gene PNCK, Length 498 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PNCK-216	ENST00000458354	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	43.5	■■■■■ 4.55
PNCK-216	ENST00000458354	ZFYVE9	O95405	1425 aa		43.5	■■■■■ 4.55
PNCK-216	ENST00000458354	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		43.49	■■■■■ 4.55
PNCK-216	ENST00000458354	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		43.48	■■■■■ 4.55
PNCK-216	ENST00000458354	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	43.47	■■■■■ 4.55
PNCK-216	ENST00000458354	PIP4K2B	P78356	416 aa		43.46	■■■■■ 4.55
PNCK-216	ENST00000458354	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		43.43	■■■■■ 4.54
PNCK-216	ENST00000458354	TRIM52	Q96A61	297 aa		43.43	■■■■■ 4.54
PNCK-216	ENST00000458354	KCNA6	P17658	529 aa		43.4	■■■■■ 4.54
PNCK-216	ENST00000458354	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	43.38	■■■■■ 4.53
PNCK-216	ENST00000458354	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	43.31	■■■■■ 4.52
PNCK-216	ENST00000458354	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	43.29	■■■■■ 4.52
PNCK-216	ENST00000458354	TRPM2	O94759	1503 aa		43.28	■■■■■ 4.52
PNCK-216	ENST00000458354	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	43.28	■■■■■ 4.52
PNCK-216	ENST00000458354	ALK	Q9UM73	1620 aa		43.28	■■■■■ 4.52
PNCK-216	ENST00000458354	NWD1	Q149M9	1564 aa		43.28	■■■■■ 4.52
PNCK-216	ENST00000458354	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	43.27	■■■■■ 4.52
PNCK-216	ENST00000458354	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	43.26	■■■■■ 4.52
PNCK-216	ENST00000458354	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	43.26	■■■■■ 4.52
PNCK-216	ENST00000458354	TBX22	Q9Y458	520 aa		43.26	■■■■■ 4.52
PNCK-216	ENST00000458354	TMEM94	Q12767	1356 aa		43.25	■■■■■ 4.51
PNCK-216	ENST00000458354	CLTCL1	P53675	1640 aa		43.23	■■■■■ 4.51
PNCK-216	ENST00000458354	HSPA1L	P34931	641 aa		43.23	■■■■■ 4.51
PNCK-216	ENST00000458354	DIP2A	Q14689	1571 aa		43.2	■■■■■ 4.51
PNCK-216	ENST00000458354	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	43.2	■■■■■ 4.51
PNCK-216	ENST00000458354	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		43.2	■■■■■ 4.51
PNCK-216	ENST00000458354	KIF1B	O60333	1816 aa		43.18	■■■■■ 4.5
PNCK-216	ENST00000458354	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		43.17	■■■■■ 4.5
PNCK-216	ENST00000458354	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	43.12	■■■■■ 4.49
PNCK-216	ENST00000458354	PIK3R4	Q99570	1358 aa		43.12	■■■■■ 4.49
PNCK-216	ENST00000458354	MSH6	P52701	1360 aa		43.06	■■■■■ 4.48
PNCK-216	ENST00000458354	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	43.06	■■■■■ 4.48
PNCK-216	ENST00000458354	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		43.04	■■■■■ 4.48
PNCK-216	ENST00000458354	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		43.03	■■■■■ 4.48
PNCK-216	ENST00000458354	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		43	■■■■■ 4.47
PNCK-216	ENST00000458354	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		42.99	■■■■■ 4.47
PNCK-216	ENST00000458354	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		42.99	■■■■■ 4.47
PNCK-216	ENST00000458354	FOXD1	Q16676	465 aa		42.98	■■■■■ 4.47
PNCK-216	ENST00000458354	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		42.97	■■■■■ 4.47
PNCK-216	ENST00000458354	C14orf37	Q86TY3	774 aa		42.97	■■■■■ 4.47
PNCK-216	ENST00000458354	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		42.96	■■■■■ 4.47
PNCK-216	ENST00000458354	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		42.96	■■■■■ 4.47
PNCK-216	ENST00000458354	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	42.93	■■■■■ 4.46
PNCK-216	ENST00000458354	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		42.93	■■■■■ 4.46
PNCK-216	ENST00000458354	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		42.9	■■■■■ 4.46
PNCK-216	ENST00000458354	PTPRU	Q92729	1446 aa		42.9	■■■■■ 4.46
PNCK-216	ENST00000458354	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		42.87	■■■■■ 4.45
PNCK-216	ENST00000458354	SLAIN2	Q9P270	581 aa		42.85	■■■■■ 4.45
PNCK-216	ENST00000458354	MET	P08581	1390 aa		42.84	■■■■■ 4.45
PNCK-216	ENST00000458354	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	42.84	■■■■■ 4.45
PNCK-216	ENST00000458354	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	42.82	■■■■■ 4.45
PNCK-216	ENST00000458354	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		42.82	■■■■■ 4.45
PNCK-216	ENST00000458354	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		42.81	■■■■■ 4.44
PNCK-216	ENST00000458354	PPL	O60437	1756 aa		42.8	■■■■■ 4.44
PNCK-216	ENST00000458354	ATF3	P18847	181 aa		42.79	■■■■■ 4.44
PNCK-216	ENST00000458354	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		42.79	■■■■■ 4.44
PNCK-216	ENST00000458354	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	42.77	■■■■■ 4.44
PNCK-216	ENST00000458354	ILDR2	Q71H61	639 aa		42.75	■■■■■ 4.43
PNCK-216	ENST00000458354	RGL3	Q3MIN7	710 aa		42.73	■■■■■ 4.43
PNCK-216	ENST00000458354	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		42.7	■■■■■ 4.43
PNCK-216	ENST00000458354	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	42.67	■■■■■ 4.42
PNCK-216	ENST00000458354	DCC	P43146	1447 aa		42.65	■■■■■ 4.42
PNCK-216	ENST00000458354	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	42.65	■■■■■ 4.42
PNCK-216	ENST00000458354	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		42.65	■■■■■ 4.42
PNCK-216	ENST00000458354	PHLPP1	O60346	1717 aa		42.63	■■■■■ 4.41
PNCK-216	ENST00000458354	IFT172	Q9UG01	1749 aa		42.6	■■■■■ 4.41
PNCK-216	ENST00000458354	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		42.58	■■■■■ 4.41
PNCK-216	ENST00000458354	PTCH1	Q13635	1447 aa		42.57	■■■■■ 4.41
PNCK-216	ENST00000458354	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		42.57	■■■■■ 4.41
PNCK-216	ENST00000458354	HRC	P23327	699 aa		42.55	■■■■■ 4.4
PNCK-216	ENST00000458354	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		42.51	■■■■■ 4.4
PNCK-216	ENST00000458354	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		42.5	■■■■■ 4.39
PNCK-216	ENST00000458354	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		42.5	■■■■■ 4.39
PNCK-216	ENST00000458354	MST1R	Q04912	1400 aa		42.47	■■■■■ 4.39
PNCK-216	ENST00000458354	BRINP3	Q76B58	766 aa		42.47	■■■■■ 4.39
PNCK-216	ENST00000458354	JCAD	Q9P266	1359 aa		42.47	■■■■■ 4.39
PNCK-216	ENST00000458354	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	42.46	■■■■■ 4.39
PNCK-216	ENST00000458354	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	42.46	■■■■■ 4.39
PNCK-216	ENST00000458354	SOCS7	O14512	581 aa		42.45	■■■■■ 4.39
PNCK-216	ENST00000458354	PIK3C2G	O75747	1445 aa		42.44	■■■■■ 4.38
PNCK-216	ENST00000458354	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		42.4	■■■■■ 4.38
PNCK-216	ENST00000458354	STK26	Q9P289	416 aa		42.37	■■■■■ 4.37
PNCK-216	ENST00000458354	MYOM2	P54296	1465 aa		42.36	■■■■■ 4.37
PNCK-216	ENST00000458354	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	42.35	■■■■■ 4.37
PNCK-216	ENST00000458354	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		42.34	■■■■■ 4.37
PNCK-216	ENST00000458354	TECPR2	O15040	1411 aa		42.31	■■■■■ 4.36
PNCK-216	ENST00000458354	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		42.3	■■■■■ 4.36
PNCK-216	ENST00000458354	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	42.3	■■■■■ 4.36
PNCK-216	ENST00000458354	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		42.3	■■■■■ 4.36
PNCK-216	ENST00000458354	ABCC11	Q96J66	1382 aa		42.29	■■■■■ 4.36
PNCK-216	ENST00000458354	LAMC1	P11047	1609 aa		42.29	■■■■■ 4.36
PNCK-216	ENST00000458354	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		42.29	■■■■■ 4.36
PNCK-216	ENST00000458354	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		42.29	■■■■■ 4.36
PNCK-216	ENST00000458354	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		42.28	■■■■■ 4.36
PNCK-216	ENST00000458354	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	42.27	■■■■■ 4.36
PNCK-216	ENST00000458354	SHPRH	Q149N8	1683 aa		42.25	■■■■■ 4.35
PNCK-216	ENST00000458354	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		42.23	■■■■■ 4.35
PNCK-216	ENST00000458354	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		42.22	■■■■■ 4.35
PNCK-216	ENST00000458354	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	42.22	■■■■■ 4.35
PNCK-216	ENST00000458354	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	42.22	■■■■■ 4.35

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms