RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000203261.2

Smim4-204, Transcript of Small integral membrane protein 4, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Smim4, Length 1,219 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim4-204ENSMUST00000203261 Chic2Q9D9G3 165 aa23.61■■□□□ 1.37
Smim4-204ENSMUST00000203261 Lamc1P02468 1607 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
Smim4-204ENSMUST00000203261 Skint5A7XUY5 1461 aa23.61■■□□□ 1.37
Smim4-204ENSMUST00000203261 IghaA0A0A6YXW6 389 aa23.59■■□□□ 1.37
Smim4-204ENSMUST00000203261 Slain2Q8CI08 581 aa23.59■■□□□ 1.37
Smim4-204ENSMUST00000203261 Ankrd36D3Z4K0 1415 aa23.59■■□□□ 1.37
Smim4-204ENSMUST00000203261 Naip7Q9JIB3 1402 aa23.58■■□□□ 1.36
Smim4-204ENSMUST00000203261 MypopQ8R4U1 393 aa23.57■■□□□ 1.36
Smim4-204ENSMUST00000203261 Arap3Q8R5G7 1538 aa23.56■■□□□ 1.36
Smim4-204ENSMUST00000203261 Ttc21bQ0HA38 1315 aa23.55■■□□□ 1.36
Smim4-204ENSMUST00000203261 MpndQ3TV65 487 aa23.53■■□□□ 1.36
Smim4-204ENSMUST00000203261 Ggt6Q6PDE7 497 aa23.53■■□□□ 1.36
Smim4-204ENSMUST00000203261 Ehbp1l1Q99MS7 1716 aa23.53■■□□□ 1.36
Smim4-204ENSMUST00000203261 Il16O54824 1322 aa23.52■■□□□ 1.36
Smim4-204ENSMUST00000203261 Tns3Q5SSZ5 1440 aa23.51■■□□□ 1.35
Smim4-204ENSMUST00000203261 Lmtk3Q5XJV6 1424 aa23.5■■□□□ 1.35
Smim4-204ENSMUST00000203261 Prdm2A2A7B5 1709 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
Smim4-204ENSMUST00000203261 Lrp6O88572 1613 aa23.47■■□□□ 1.35
Smim4-204ENSMUST00000203261 Siglec1Q62230 1695 aa23.47■■□□□ 1.35
Smim4-204ENSMUST00000203261 PplQ9R269 1755 aa23.47■■□□□ 1.35
Smim4-204ENSMUST00000203261 PalldQ9ET54 1408 aa23.46■■□□□ 1.35
Smim4-204ENSMUST00000203261 Asxl2Q8BZ32 1370 aa23.45■■□□□ 1.34
Smim4-204ENSMUST00000203261 Rgs17Q9QZB0 210 aa23.45■■□□□ 1.34
Smim4-204ENSMUST00000203261 Zfp142G5E869 1843 aa23.45■■□□□ 1.34
Smim4-204ENSMUST00000203261 Tmem131lQ3U3D7 1597 aa23.44■■□□□ 1.34
Smim4-204ENSMUST00000203261 Ino80Q6ZPV2 1559 aa23.43■■□□□ 1.34
Smim4-204ENSMUST00000203261 Nwd1A6H603 1563 aa23.41■■□□□ 1.34
Smim4-204ENSMUST00000203261 Atf3Q60765 181 aa23.41■■□□□ 1.34
Smim4-204ENSMUST00000203261 Efcab6Q6P1E8 1516 aa23.4■■□□□ 1.34
Smim4-204ENSMUST00000203261 AnkarA2RT91 1465 aa23.4■■□□□ 1.34
Smim4-204ENSMUST00000203261 Znf526Q8BI66 675 aa23.39■■□□□ 1.33
Smim4-204ENSMUST00000203261 Erich6D3Z6S9 713 aa23.38■■□□□ 1.33
Smim4-204ENSMUST00000203261 Bcl2l12Q9D3J3 255 aa23.37■■□□□ 1.33
Smim4-204ENSMUST00000203261 Ybx3Q9JKB3 361 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
Smim4-204ENSMUST00000203261 Ylpm1Q9R0I7 1386 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
Smim4-204ENSMUST00000203261 Kdm2bQ6P1G2 1309 aa23.34■■□□□ 1.33
Smim4-204ENSMUST00000203261 Prrc2bQ7TPM1 1486 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
Smim4-204ENSMUST00000203261 Stk24Q99KH8 431 aa23.33■■□□□ 1.33
Smim4-204ENSMUST00000203261 Tmem94Q7TSH8 1360 aa23.29■■□□□ 1.32
Smim4-204ENSMUST00000203261 Arhgef28P97433 1693 aa23.29■■□□□ 1.32
Smim4-204ENSMUST00000203261 Map4P27546 1125 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
Smim4-204ENSMUST00000203261 Slit3Q9WVB4 1523 aa23.28■■□□□ 1.32
Smim4-204ENSMUST00000203261 Uggt1Q6P5E4 1551 aa23.28■■□□□ 1.32
Smim4-204ENSMUST00000203261 Atp7aQ64430 1491 aa23.28■■□□□ 1.32
Smim4-204ENSMUST00000203261 Dapk1Q80YE7 1442 aa23.27■■□□□ 1.32
Smim4-204ENSMUST00000203261 Unc13bQ9Z1N9 1602 aa23.26■■□□□ 1.31
Smim4-204ENSMUST00000203261 Myom3A2ABU4 1439 aa23.26■■□□□ 1.31
Smim4-204ENSMUST00000203261 Clstn2Q9ER65 966 aa23.26■■□□□ 1.31
Smim4-204ENSMUST00000203261 C3P01027 1663 aa23.25■■□□□ 1.31
Smim4-204ENSMUST00000203261 Rprd2Q6NXI6 1469 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
Smim4-204ENSMUST00000203261 Col14a1Q80X19 1797 aa23.24■■□□□ 1.31
Smim4-204ENSMUST00000203261 NclP09405 707 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
Smim4-204ENSMUST00000203261 Atp1b4Q99ME6 356 aa23.24■■□□□ 1.31
Smim4-204ENSMUST00000203261 Nup155Q99P88 1391 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
Smim4-204ENSMUST00000203261 Iqgap3F8VQ29 1632 aa23.22■■□□□ 1.31
Smim4-204ENSMUST00000203261 Marf1Q8BJ34 1730 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
Smim4-204ENSMUST00000203261 Abcc10Q8R4P9 1501 aa23.22■■□□□ 1.31
Smim4-204ENSMUST00000203261 Kif24Q6NWW5 1356 aa23.21■■□□□ 1.31
Smim4-204ENSMUST00000203261 KdrP35918 1367 aa23.2■■□□□ 1.3
Smim4-204ENSMUST00000203261 Tecpr2Q3UH45 1423 aa23.19■■□□□ 1.3
Smim4-204ENSMUST00000203261 Nsd2Q8BVE8 1365 aa23.19■■□□□ 1.3
Smim4-204ENSMUST00000203261 Zfp644E9QA22 1323 aa23.17■■□□□ 1.3
Smim4-204ENSMUST00000203261 Ddx17Q501J6 650 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
Smim4-204ENSMUST00000203261 PtprgQ05909 1442 aa23.16■■□□□ 1.3
Smim4-204ENSMUST00000203261 Emilin2Q8K482 1074 aa23.15■■□□□ 1.3
Smim4-204ENSMUST00000203261 HnrnpmQ9D0E1 729 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
Smim4-204ENSMUST00000203261 Mroh1E0CZ22 1640 aa23.15■■□□□ 1.3
Smim4-204ENSMUST00000203261 Tarbp1E9Q368 1579 aa23.14■■□□□ 1.29
Smim4-204ENSMUST00000203261 NalcnQ8BXR5 1738 aa23.13■■□□□ 1.29
Smim4-204ENSMUST00000203261 Col22a1E9Q7P1 1613 aa23.12■■□□□ 1.29
Smim4-204ENSMUST00000203261 Q9D9H8 365 aa23.11■■□□□ 1.29
Smim4-204ENSMUST00000203261 Cd109Q8R422 1442 aa23.1■■□□□ 1.29
Smim4-204ENSMUST00000203261 Smim5Q8BT42 78 aa23.1■■□□□ 1.29
Smim4-204ENSMUST00000203261 Eno4Q8C042 619 aa23.1■■□□□ 1.29
Smim4-204ENSMUST00000203261 Sall3Q62255 1320 aa23.09■■□□□ 1.29
Smim4-204ENSMUST00000203261 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
Smim4-204ENSMUST00000203261 Abca8aQ8K442 1620 aa23.07■■□□□ 1.28
Smim4-204ENSMUST00000203261 Pik3r4Q8VD65 1358 aa23.06■■□□□ 1.28
Smim4-204ENSMUST00000203261 GnpatP98192 678 aa23.06■■□□□ 1.28
Smim4-204ENSMUST00000203261 Robo1O89026 1612 aa23.04■■□□□ 1.28
Smim4-204ENSMUST00000203261 ErbinQ80TH2 1402 aa23.03■■□□□ 1.28
Smim4-204ENSMUST00000203261 Rreb1Q3UH06 1700 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
Smim4-204ENSMUST00000203261 Tex14Q7M6U3 1450 aa23.01■■□□□ 1.27
Smim4-204ENSMUST00000203261 Ift172Q6VH22 1749 aa23.01■■□□□ 1.27
Smim4-204ENSMUST00000203261 UacaQ8CGB3 1411 aa23■■□□□ 1.27
Smim4-204ENSMUST00000203261 Shq1Q7TMX5 569 aa23■■□□□ 1.27
Smim4-204ENSMUST00000203261 Ttll5Q8CHB8 1328 aa23■■□□□ 1.27
Smim4-204ENSMUST00000203261 Ddx54Q8K4L0 874 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
Smim4-204ENSMUST00000203261 Pik3c2bE9QAN8 1632 aa22.97■■□□□ 1.27
Smim4-204ENSMUST00000203261 Slc34a2Q9DBP0 697 aa22.96■■□□□ 1.27
Smim4-204ENSMUST00000203261 AatkQ80YE4 1365 aa22.96■■□□□ 1.27
Smim4-204ENSMUST00000203261 DccP70211 1447 aa22.96■■□□□ 1.27
Smim4-204ENSMUST00000203261 N4bp2F8VQG7 1678 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
Smim4-204ENSMUST00000203261 Kif20bQ80WE4 1774 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
Smim4-204ENSMUST00000203261 Ccdc6D3YZP9 469 aa22.95■■□□□ 1.26
Smim4-204ENSMUST00000203261 Pik3c2gO70167 1506 aa22.94■■□□□ 1.26
Smim4-204ENSMUST00000203261 Rfx7F8VPJ6 1459 aa22.94■■□□□ 1.26
Smim4-204ENSMUST00000203261 AU022751B1B0V2 589 aa22.94■■□□□ 1.26
Smim4-204ENSMUST00000203261 Arhgef1Q61210 920 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
Smim4-204ENSMUST00000203261 Trak1Q6PD31 939 aa22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 68 ms