RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000195705.1

Rnf149-204, Transcript of E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mouse

TSL 3 BASIC

Gene Rnf149, Length 389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Psme1	P97371	249 aa		43.26	■■■■■ 4.52
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Myo3a	Q8K3H5	1613 aa		43.24	■■■■■ 4.51
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Prrc2b	Q7TPM1	1486 aa	Known RBP	43.21	■■■■■ 4.51
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Setd1a	E9PYH6	1716 aa		43.19	■■■■■ 4.51
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Ppl	Q9R269	1755 aa		43.18	■■■■■ 4.5
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Erbin	Q80TH2	1402 aa		43.18	■■■■■ 4.5
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Mroh1	E0CZ22	1640 aa		43.15	■■■■■ 4.5
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Edc4	Q3UJB9	1406 aa	Known RBP	43.15	■■■■■ 4.5
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Palld	Q9ET54	1408 aa		43.15	■■■■■ 4.5
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Abca8a	Q8K442	1620 aa		43.13	■■■■■ 4.49
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Pik3c2g	O70167	1506 aa		43.12	■■■■■ 4.49
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Igha	A0A0A6YXW6	389 aa		43.11	■■■■■ 4.49
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Mphosph9	A6H5Y1	991 aa		43.11	■■■■■ 4.49
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Bcl11b	Q99PV8	884 aa		43.1	■■■■■ 4.49
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Sall3	Q62255	1320 aa		43.1	■■■■■ 4.49
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Ehbp1l1	Q99MS7	1716 aa		43.08	■■■■■ 4.49
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Ehmt2	Q9Z148	1263 aa	Known RBP	43.07	■■■■■ 4.49
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Thsd7a	Q69ZU6	1645 aa		43.07	■■■■■ 4.48
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Aatk	Q80YE4	1365 aa		43.02	■■■■■ 4.48
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Kif21b	Q9QXL1	1668 aa		43	■■■■■ 4.47
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Arhgef28	P97433	1693 aa		42.95	■■■■■ 4.47
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Dhx9	O70133	1380 aa	Known RBP	42.94	■■■■■ 4.46
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Slit3	Q9WVB4	1523 aa		42.94	■■■■■ 4.46
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Rprd2	Q6NXI6	1469 aa	Known RBP	42.93	■■■■■ 4.46
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Asxl2	Q8BZ32	1370 aa		42.92	■■■■■ 4.46
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Amigo3	Q8C2S7	508 aa		42.91	■■■■■ 4.46
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Hdac5	Q9Z2V6	1113 aa		42.91	■■■■■ 4.46
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Mbd5	B1AYB6	1498 aa		42.85	■■■■■ 4.45
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Col18a1	P39061	1774 aa		42.84	■■■■■ 4.45
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Cdk13	Q69ZA1	1511 aa	Known RBP	42.82	■■■■■ 4.45
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Ankrd36	D3Z4K0	1415 aa		42.82	■■■■■ 4.45
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Atp1b4	Q99ME6	356 aa		42.81	■■■■■ 4.44
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Pkd2	O35245	966 aa		42.8	■■■■■ 4.44
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	AU022751	B1B0V2	589 aa		42.79	■■■■■ 4.44
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Tns3	Q5SSZ5	1440 aa		42.78	■■■■■ 4.44
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Ccer2	J3QPU5	274 aa		42.77	■■■■■ 4.44
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Dnmbp	Q6TXD4	1580 aa		42.75	■■■■■ 4.43
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Myom1	Q62234	1667 aa	Known RBP	42.73	■■■■■ 4.43
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Dot1l	Q6XZL8	1540 aa		42.72	■■■■■ 4.43
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Brinp3	Q499E0	766 aa		42.71	■■■■■ 4.43
Rnf149-204	ENSMUST00000195705		Q9D9H8	365 aa		42.7	■■■■■ 4.43
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Ppip5k1	A2ARP1	1436 aa		42.69	■■■■■ 4.42
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Pik3r4	Q8VD65	1358 aa		42.67	■■■■■ 4.42
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Plxnc1	Q9QZC2	1574 aa		42.67	■■■■■ 4.42
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Shq1	Q7TMX5	569 aa		42.65	■■■■■ 4.42
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Slain2	Q8CI08	581 aa		42.65	■■■■■ 4.42
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Mroh3	A0A1D5RM54	893 aa		42.64	■■■■■ 4.42
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Evi5l	H3BKQ3	813 aa		42.62	■■■■■ 4.41
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Arap3	Q8R5G7	1538 aa		42.61	■■■■■ 4.41
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Tom1	O88746	492 aa		42.6	■■■■■ 4.41
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Gapdhs	Q64467	440 aa		42.55	■■■■■ 4.4
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Washc2	Q6PGL7	1334 aa		42.52	■■■■■ 4.4
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Unc13b	Q9Z1N9	1602 aa		42.51	■■■■■ 4.4
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Gimap5	Q8BWF2	308 aa		42.51	■■■■■ 4.4
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Hnrnpm	Q9D0E1	729 aa	Known RBP	42.49	■■■■■ 4.39
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Tmem94	Q7TSH8	1360 aa		42.45	■■■■■ 4.39
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Rock1	P70335	1354 aa		42.44	■■■■■ 4.38
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Rims1	Q99NE5	1463 aa		42.43	■■■■■ 4.38
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Pik3c2a	Q61194	1686 aa		42.43	■■■■■ 4.38
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Madd	Q80U28	1577 aa		42.43	■■■■■ 4.38
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Nwd1	A6H603	1563 aa		42.39	■■■■■ 4.38
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Tulp4	Q9JIL5	1547 aa		42.36	■■■■■ 4.37
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Col14a1	Q80X19	1797 aa		42.36	■■■■■ 4.37
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Cps1	Q8C196	1500 aa		42.34	■■■■■ 4.37
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Atf3	Q60765	181 aa		42.33	■■■■■ 4.37
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Ift172	Q6VH22	1749 aa		42.32	■■■■■ 4.37
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Ttll13	A4Q9F6	804 aa		42.31	■■■■■ 4.36
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Slc52a2	Q9D8F3	450 aa		42.31	■■■■■ 4.36
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Dapk1	Q80YE7	1442 aa		42.27	■■■■■ 4.36
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Adamts13	Q769J6	1426 aa		42.26	■■■■■ 4.36
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Nalcn	Q8BXR5	1738 aa		42.23	■■■■■ 4.35
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Usp47	Q8BY87	1376 aa		42.22	■■■■■ 4.35
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Rgl3	Q3UYI5	709 aa		42.21	■■■■■ 4.35
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Mier1	Q5UAK0	511 aa		42.21	■■■■■ 4.35
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Utp14a	Q640M1	767 aa	Known RBP	42.19	■■■■■ 4.34
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Kdm2a	P59997	1161 aa		42.18	■■■■■ 4.34
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Slc5a4b	Q91ZP4	660 aa		42.18	■■■■■ 4.34
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Stk26	Q99JT2	416 aa		42.18	■■■■■ 4.34
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Ifit1bl1	D3Z6F0	470 aa		42.17	■■■■■ 4.34
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Nyap1	Q6PFX7	833 aa		42.17	■■■■■ 4.34
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Srpk2	O54781	681 aa	Known RBP	42.16	■■■■■ 4.34
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Itsn2	Q9Z0R6	1659 aa		42.14	■■■■■ 4.34
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	C3	P01027	1663 aa		42.13	■■■■■ 4.34
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Eid3	Q3V124	375 aa		42.13	■■■■■ 4.33
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Kif20b	Q80WE4	1774 aa	Known RBP	42.12	■■■■■ 4.33
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Qtrt2	B8ZXI1	415 aa		42.12	■■■■■ 4.33
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Fan1	Q69ZT1	1020 aa		42.12	■■■■■ 4.33
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Os9	Q8K2C7	672 aa		42.12	■■■■■ 4.33
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Cep152	A2AUM9	1736 aa	Known RBP	42.12	■■■■■ 4.33
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Fbln2	P37889	1221 aa		42.09	■■■■■ 4.33
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Kdr	P35918	1367 aa		42.06	■■■■■ 4.32
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Gm10563	F6WIE4	79 aa		42.05	■■■■■ 4.32
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Puf60	Q3UEB3	564 aa	Known RBP	42.05	■■■■■ 4.32
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Rreb1	Q3UH06	1700 aa	Known RBP	42.05	■■■■■ 4.32
Rnf149-204	ENSMUST00000195705		Q3UJC8	639 aa		42.04	■■■■■ 4.32
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Pik3c2b	E9QAN8	1632 aa		42.03	■■■■■ 4.32
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Lrrc7	Q80TE7	1490 aa		42.03	■■■■■ 4.32
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Gm20521	D3Z5F7	333 aa		42	■■■■■ 4.31
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Cep170b	Q80U49	1574 aa		42	■■■■■ 4.31
Rnf149-204	ENSMUST00000195705	Cdk5rap2	Q8K389	1822 aa		41.99	■■■■■ 4.31

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