RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000039517.10

Syde2-201, Transcript of Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Syde2, Length 5,495 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2-201ENSMUST00000039517 Tdrd9Q14BI7 1383 aa25.44■■□□□ 1.66
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Syde2-201ENSMUST00000039517 Vps8Q0P5W1 1427 aa25.44■■□□□ 1.66
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Syde2-201ENSMUST00000039517 Fbxo2Q80UW2 297 aa25.42■■□□□ 1.66
Syde2-201ENSMUST00000039517 Plekhh1Q80TI1 1356 aa25.42■■□□□ 1.66
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Syde2-201ENSMUST00000039517 Ttll13A4Q9F6 804 aa25.4■■□□□ 1.66
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Syde2-201ENSMUST00000039517 Swt1Q9DBQ9 907 aa25.32■■□□□ 1.64
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Syde2-201ENSMUST00000039517 Ppp2r3aB2RXC8 1150 aa25.29■■□□□ 1.64
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Syde2-201ENSMUST00000039517 Shroom4Q1W617 1475 aa25.27■■□□□ 1.64
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Syde2-201ENSMUST00000039517 Gsto1O09131 240 aa25.26■■□□□ 1.63
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Syde2-201ENSMUST00000039517 Ftsj3Q9DBE9 838 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
Syde2-201ENSMUST00000039517 Zfp644E9QA22 1323 aa25.25■■□□□ 1.63
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Syde2-201ENSMUST00000039517 Cyp46a1Q9WVK8 500 aa25.23■■□□□ 1.63
Syde2-201ENSMUST00000039517 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa25.23■■□□□ 1.63
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Syde2-201ENSMUST00000039517 Samd1D3YXK1 519 aa25.23■■□□□ 1.63
Syde2-201ENSMUST00000039517 Ppp2r1aQ76MZ3 589 aa25.23■■□□□ 1.63
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Syde2-201ENSMUST00000039517 EzrP26040 586 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
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Syde2-201ENSMUST00000039517 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
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Syde2-201ENSMUST00000039517 Puf60Q3UEB3 564 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.63
Syde2-201ENSMUST00000039517 Tnpo1Q8BFY9 898 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.63
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Syde2-201ENSMUST00000039517 Mcm2P97310 904 aa25.19■■□□□ 1.62
Syde2-201ENSMUST00000039517 Naip1Q9QWK5 1403 aa25.19■■□□□ 1.62
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Syde2-201ENSMUST00000039517 Rnf214Q8BFU3 668 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
Syde2-201ENSMUST00000039517 Neurod6P48986 337 aa25.18■■□□□ 1.62
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