RNA–Protein interactions for RNA: YKL215C

OXP1, Transcript of 5-oxoprolinase, yeast

Gene OXP1, Length 3,861 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
OXP1	YKL215C	SNF5	P18480	905 aa		4.9	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	OXA1	P39952	402 aa		4.9	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		4.9	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	POX1	P13711	748 aa		4.9	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	YKL187C	P34231	750 aa		4.9	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	PIC2	P40035	300 aa		4.9	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	LAS17	Q12446	633 aa		4.9	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	VPS63	O13549	108 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	SIS1	P25294	352 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	POP5	P28005	173 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	YHR130C	P38834	111 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	VHT1	P53241	593 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	SAY1	P53324	424 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	PRM3	Q08931	133 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	MRP20	P32387	263 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	MRP49	P32388	137 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	ZRT1	P32804	376 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	PPZ2	P33329	710 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	THI80	P35202	319 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	CUE1	P38428	203 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	RPA43	P46669	326 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	COX18	P53239	316 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	GIP3	Q03016	1276 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	EST3	Q03096	181 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	MCH1	Q07376	486 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	ADK2	P26364	225 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	YBR063C	P38083	404 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	YPS6	P40583	537 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	MIC26	P50087	233 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	MUP1	P50276	574 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	AQR1	P53943	586 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	TDA6	Q06466	467 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	SLC1	P33333	303 aa		4.88	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	YBR090C	P38253	122 aa		4.88	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	YNR040W	P53736	256 aa		4.88	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	APJ1	P53940	528 aa		4.88	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	YDL157C	Q12082	118 aa		4.88	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	YLR149C	Q99296	730 aa		4.88	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	TIM9	O74700	87 aa		4.88	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	FRM2	P37261	193 aa		4.88	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	THI2	P38141	450 aa		4.88	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	PSD1	P39006	500 aa		4.88	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	BUD9	P53226	547 aa		4.88	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	YLR460C	P54007	376 aa		4.88	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	SIA1	Q12212	622 aa		4.88	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	YER039C-A	P0CD97	72 aa		4.88	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	SAM35	P14693	329 aa		4.88	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	OAC1	P32332	324 aa		4.88	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	YGR149W	P48236	432 aa		4.88	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	COX19	Q3E731	98 aa		4.88	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	MEP2	P41948	499 aa		4.87	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	BNS1	P50084	137 aa		4.87	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	MTM1	P53320	366 aa		4.87	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	YMR087W	Q04299	284 aa		4.87	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	MRX8	Q05473	314 aa		4.87	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		4.87	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	GPI12	P23797	304 aa		4.87	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	EMC3	P36039	253 aa		4.87	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	MRPS9	P38120	278 aa		4.87	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	POS5	Q06892	414 aa		4.87	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	MCP1	Q12106	302 aa		4.87	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	YPR096C	O13587	100 aa		4.87	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	SDH3	P33421	198 aa		4.87	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	YJL118W	P47022	219 aa		4.87	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	THI74	Q04083	370 aa		4.87	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	ATG33	Q06485	197 aa		4.87	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	YLR012C	Q07927	99 aa		4.87	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	DUT1	P33317	147 aa		4.86	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	SPC25	P40014	221 aa		4.86	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	FRE4	P53746	719 aa		4.86	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	SEI1	Q06058	285 aa		4.86	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	SOR2	Q07786	357 aa		4.86	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	STE7	P06784	515 aa		4.86	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	SCO1	P23833	295 aa		4.86	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	PCL1	P24867	279 aa		4.86	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	CWP1	P28319	239 aa		4.86	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	TRS20	P38334	175 aa		4.86	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	YHC3	P47040	408 aa		4.86	□□□□□ -1.63
OXP1	YKL215C	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.6 ms