RNA–Protein interactions for RNA: YHR125W

YHR125W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YHR125W, Length 306 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YHR125W	YHR125W	PAM18	Q07914	168 aa		0.53	□□□□□ -2.32
YHR125W	YHR125W	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.32
YHR125W	YHR125W	TDA8	Q6B2U8	126 aa		0.53	□□□□□ -2.32
YHR125W	YHR125W	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	0.52	□□□□□ -2.33
YHR125W	YHR125W	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	0.52	□□□□□ -2.33
YHR125W	YHR125W	BNA6	P43619	295 aa		0.52	□□□□□ -2.33
YHR125W	YHR125W	MRPL50	P53724	139 aa		0.52	□□□□□ -2.33
YHR125W	YHR125W	YML108W	Q03759	105 aa		0.52	□□□□□ -2.33
YHR125W	YHR125W	YDR248C	Q03786	193 aa		0.52	□□□□□ -2.33
YHR125W	YHR125W	KRE28	Q04431	385 aa		0.52	□□□□□ -2.33
YHR125W	YHR125W	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	0.52	□□□□□ -2.33
YHR125W	YHR125W	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	0.51	□□□□□ -2.33
YHR125W	YHR125W	RIB7	P33312	244 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YHR125W	YHR125W	SNC2	P33328	115 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YHR125W	YHR125W	CUE1	P38428	203 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YHR125W	YHR125W	YFL065C	P43539	102 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YHR125W	YHR125W	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	0.51	□□□□□ -2.33
YHR125W	YHR125W	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	0.51	□□□□□ -2.33
YHR125W	YHR125W	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
YHR125W	YHR125W	VMA22	P38784	181 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YHR125W	YHR125W	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	0.5	□□□□□ -2.33
YHR125W	YHR125W	AIM36	Q03798	255 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YHR125W	YHR125W	RRT8	Q08219	342 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YHR125W	YHR125W	TSC3	Q3E790	80 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YHR125W	YHR125W	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
YHR125W	YHR125W	DRS2	P39524	1355 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YHR125W	YHR125W	YLR236C	A0A023PZG4	107 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YHR125W	YHR125W	SIR2	P06700	562 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YHR125W	YHR125W	YHR212W-A	P0CX91	67 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YHR125W	YHR125W	RPO26	P20435	155 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YHR125W	YHR125W	MRPL25	P23369	157 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YHR125W	YHR125W	LDB7	P38210	180 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YHR125W	YHR125W	SIP3	P38717	1229 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YHR125W	YHR125W	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
YHR125W	YHR125W	FLX1	P40464	311 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YHR125W	YHR125W	GPM2	Q12008	311 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YHR125W	YHR125W	MCP1	Q12106	302 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YHR125W	YHR125W	ATG40	Q99325	256 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YHR125W	YHR125W	SEC17	P32602	292 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YHR125W	YHR125W	YUH1	P35127	236 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YHR125W	YHR125W	NUP84	P52891	726 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YHR125W	YHR125W	RCE1	Q03530	315 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YHR125W	YHR125W	YLR173W	Q06247	608 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YHR125W	YHR125W	RAD28	Q12021	506 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YHR125W	YHR125W	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
YHR125W	YHR125W	SPT3	P06844	337 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YHR125W	YHR125W	URA6	P15700	204 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YHR125W	YHR125W	OPY1	P38271	328 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YHR125W	YHR125W	YHL042W	P38729	150 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YHR125W	YHR125W	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
YHR125W	YHR125W	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	0.47	□□□□□ -2.33
YHR125W	YHR125W	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
YHR125W	YHR125W	SEC11	P15367	167 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YHR125W	YHR125W	DBF2	P22204	572 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YHR125W	YHR125W	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
YHR125W	YHR125W	SKG1	P36169	355 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YHR125W	YHR125W	FYV6	P53913	173 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YHR125W	YHR125W	YHR007C-A	Q07074	71 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YHR125W	YHR125W	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.45	□□□□□ -2.34	not detected
YHR125W	YHR125W	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
YHR125W	YHR125W	YDR274C	P87283	123 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YHR125W	YHR125W	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	0.45	□□□□□ -2.34
YHR125W	YHR125W	CWC27	Q02770	301 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YHR125W	YHR125W	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.43	□□□□□ -2.34	not detected
YHR125W	YHR125W	YBR285W	P38354	144 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YHR125W	YHR125W	FMC1	P40491	155 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YHR125W	YHR125W	FAR7	P43592	221 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YHR125W	YHR125W	PRM8	P53174	237 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YHR125W	YHR125W	ALG13	P53178	202 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YHR125W	YHR125W	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
YHR125W	YHR125W	YOL160W	Q08321	113 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YHR125W	YHR125W	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YHR125W	YHR125W	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YHR125W	YHR125W	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
YHR125W	YHR125W	RPC17	P47076	161 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YHR125W	YHR125W	SRL4	Q03085	281 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YHR125W	YHR125W	YFR032C-B	Q8TGU2	87 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YHR125W	YHR125W	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
YHR125W	YHR125W	TCA17	P32613	152 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YHR125W	YHR125W	BXI1	P48558	297 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YHR125W	YHR125W	CDC123	Q05791	360 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YHR125W	YHR125W	MED4	Q12343	284 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YHR125W	YHR125W	MDM35	O60200	86 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YHR125W	YHR125W	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
YHR125W	YHR125W	KSS1	P14681	368 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YHR125W	YHR125W	ATP15	P21306	62 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YHR125W	YHR125W	YPL073C	P40323	161 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YHR125W	YHR125W	BRR6	P53062	197 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YHR125W	YHR125W	YDR249C	Q03787	373 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YHR125W	YHR125W	YLR283W	Q05867	314 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YHR125W	YHR125W	LCL2	Q08045	131 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YHR125W	YHR125W	BET1	P22804	142 aa		0.39	□□□□□ -2.35
YHR125W	YHR125W	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
YHR125W	YHR125W	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
YHR125W	YHR125W	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
YHR125W	YHR125W	YFH7	P43591	353 aa		0.39	□□□□□ -2.35
YHR125W	YHR125W	MIC26	P50087	233 aa		0.39	□□□□□ -2.35
YHR125W	YHR125W	YGR050C	P53231	118 aa		0.39	□□□□□ -2.35
YHR125W	YHR125W	RRN5	Q02983	363 aa		0.39	□□□□□ -2.35
YHR125W	YHR125W	YMR252C	Q04814	134 aa		0.39	□□□□□ -2.35

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 84.6 ms