RNA–Protein interactions for RNA: YGR274C

TAF1, Transcript of TFIID subunit, involved in RNA pol II transcription initiation, yeast

Gene TAF1, Length 3,201 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TAF1	YGR274C	PAU13	P38725	120 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	YND1	P40009	630 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	CUP9	P41817	306 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	CYT2	Q00873	224 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	PAU10	Q03050	120 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	ASM4	Q05166	528 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	FRQ1	Q06389	190 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	YDL242W	Q07746	117 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	THI73	Q07904	523 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	MED7	Q08278	222 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	PAU20	Q08322	120 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	IZH2	Q12442	317 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	HUT1	Q12520	339 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	SET6	Q12529	373 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	PAU9	Q3E770	120 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	COX5B	P00425	151 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	SCEI	P03882	235 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	SPS4	P09937	338 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	IRC22	P40006	225 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	YGR149W	P48236	432 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	SKP1	P52286	194 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	PAU4	P53427	120 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	OCA2	P53949	197 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	DAD3	P69850	94 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	YMR082C	Q04276	118 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	BDS1	Q08347	646 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	AKR2	Q12013	749 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	COA2	Q3E823	68 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	LSB5	P25369	354 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	EMP70	P32802	667 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	AVT5	P38176	459 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	TRS20	P38334	175 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	WSC4	P38739	605 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	YHR210C	P38893	341 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	GLC8	P41818	229 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	MOB2	P43563	287 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	NAT3	Q06504	195 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	PIB1	Q06651	286 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	ATX2	Q12067	313 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	LAS17	Q12446	633 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	YGL010W	P25338	174 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	IMG1	P25626	169 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	ERG2	P32352	222 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	WSS1	P38838	269 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	MID1	P41821	548 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	HIT1	P46973	164 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	FYV7	Q12247	151 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	SWM1	Q12379	170 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	SRX1	P36077	127 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	SLM6	P38343	150 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	PFS1	P38872	237 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	LTP1	P40347	161 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	GWT1	P47026	490 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	OST3	P48439	350 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	SWS2	P53937	143 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	YOR186W	Q08560	144 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	ATG5	Q12380	294 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TAF1	YGR274C	YMR084W	A2P2R3	262 aa		3.09	□□□□□ -1.92
TAF1	YGR274C	YLR358C	O13565	187 aa		3.09	□□□□□ -1.92
TAF1	YGR274C	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.92
TAF1	YGR274C	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.92
TAF1	YGR274C	STP22	P25604	385 aa		3.09	□□□□□ -1.92
TAF1	YGR274C	CWP1	P28319	239 aa		3.09	□□□□□ -1.92
TAF1	YGR274C	CPR5	P35176	225 aa		3.09	□□□□□ -1.92
TAF1	YGR274C	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.92
TAF1	YGR274C	MRPS9	P38120	278 aa		3.09	□□□□□ -1.92
TAF1	YGR274C	PCL7	P40186	285 aa		3.09	□□□□□ -1.92
TAF1	YGR274C	PAU5	P43575	122 aa		3.09	□□□□□ -1.92
TAF1	YGR274C	CTK2	P46962	323 aa		3.09	□□□□□ -1.92
TAF1	YGR274C	MSY1	P48527	492 aa		3.09	□□□□□ -1.92
TAF1	YGR274C	PDR17	P53844	350 aa		3.09	□□□□□ -1.92

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