RNA–Protein interactions for RNA: YNL058C

YNL058C, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YNL058C, Length 951 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL058C	YNL058C	GPA2	P10823	449 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YNL058C	YNL058C	OM45	P16547	393 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YNL058C	YNL058C	FZF1	P32805	299 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YNL058C	YNL058C	YBR063C	P38083	404 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YNL058C	YNL058C	PET100	P38958	111 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YNL058C	YNL058C	ERV29	P53337	310 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YNL058C	YNL058C	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	0.5	□□□□□ -2.33
YNL058C	YNL058C	YNR077C	P53758	84 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YNL058C	YNL058C	CSM4	Q08955	156 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YNL058C	YNL058C	MSH5	Q12175	901 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YNL058C	YNL058C	YOR020W-A	Q3E824	90 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YNL058C	YNL058C	ICE2	P40499	491 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YNL058C	YNL058C	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
YNL058C	YNL058C	HOC1	P47124	396 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YNL058C	YNL058C	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	0.49	□□□□□ -2.33
YNL058C	YNL058C	YOL107W	Q12239	342 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YNL058C	YNL058C	PSF1	Q12488	208 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YNL058C	YNL058C	VAR1	P02381	398 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YNL058C	YNL058C	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
YNL058C	YNL058C	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YNL058C	YNL058C	AQY2	P0CD90	149 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YNL058C	YNL058C	RIB1	P38066	345 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YNL058C	YNL058C	GAA1	P39012	614 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YNL058C	YNL058C	PEX17	P40155	199 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YNL058C	YNL058C	PGD1	P40356	397 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YNL058C	YNL058C	RPL37A	P49166	88 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
YNL058C	YNL058C	AIF1	P52923	378 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YNL058C	YNL058C	YML096W	Q04489	525 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YNL058C	YNL058C	BTS1	Q12051	335 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YNL058C	YNL058C	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	0.48	□□□□□ -2.33
YNL058C	YNL058C	REP2	P03872	296 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YNL058C	YNL058C	RIB7	P33312	244 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YNL058C	YNL058C	IRC22	P40006	225 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YNL058C	YNL058C	YER076C	P40049	302 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YNL058C	YNL058C	YNL217W	P40152	326 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YNL058C	YNL058C	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
YNL058C	YNL058C	YJR149W	P47177	404 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YNL058C	YNL058C	DOC1	P53068	250 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YNL058C	YNL058C	UBC7	Q02159	165 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YNL058C	YNL058C	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
YNL058C	YNL058C	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	0.47	□□□□□ -2.33
YNL058C	YNL058C	MSB2	P32334	1306 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YNL058C	YNL058C	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	0.46	□□□□□ -2.34
YNL058C	YNL058C	RTT105	P40063	208 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YNL058C	YNL058C	GPI8	P49018	411 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YNL058C	YNL058C	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
YNL058C	YNL058C	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
YNL058C	YNL058C	RSM25	P40496	264 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YNL058C	YNL058C	ILM1	P47155	203 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YNL058C	YNL058C	TRM9	P49957	279 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YNL058C	YNL058C	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
YNL058C	YNL058C	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	0.45	□□□□□ -2.34
YNL058C	YNL058C	ANT1	Q06497	328 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YNL058C	YNL058C	RRT8	Q08219	342 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YNL058C	YNL058C	ATG31	Q12421	196 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YNL058C	YNL058C	SLH1	P53327	1967 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
YNL058C	YNL058C	YLR156W	P0CE96	114 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YNL058C	YNL058C	YLR159W	P0CE97	114 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YNL058C	YNL058C	YLR161W	P0CE98	114 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YNL058C	YNL058C	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
YNL058C	YNL058C	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
YNL058C	YNL058C	BNA6	P43619	295 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YNL058C	YNL058C	ABF2	Q02486	183 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YNL058C	YNL058C	LPP1	Q04396	274 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YNL058C	YNL058C	YPL162C	Q12042	273 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YNL058C	YNL058C	YER188C-A	P0C0V2	99 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YNL058C	YNL058C	SRB4	P32569	687 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YNL058C	YNL058C	SRY1	P36007	326 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YNL058C	YNL058C	YEL067C	P39978	195 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YNL058C	YNL058C	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	0.43	□□□□□ -2.34
YNL058C	YNL058C	MET5	P47169	1442 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YNL058C	YNL058C	DRS2	P39524	1355 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YNL058C	YNL058C	ACC1	Q00955	2233 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
YNL058C	YNL058C	RPO26	P20435	155 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YNL058C	YNL058C	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
YNL058C	YNL058C	MRPL17	P36528	281 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YNL058C	YNL058C	DOG2	P38773	246 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YNL058C	YNL058C	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	0.42	□□□□□ -2.34
YNL058C	YNL058C	MCM22	P47167	239 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YNL058C	YNL058C	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.42	□□□□□ -2.34	not detected
YNL058C	YNL058C	PAM18	Q07914	168 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YNL058C	YNL058C	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YNL058C	YNL058C	TUS1	Q06412	1307 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YNL058C	YNL058C	MRPS28	P21771	286 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YNL058C	YNL058C	ATG22	P25568	528 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YNL058C	YNL058C	YET1	P35723	206 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YNL058C	YNL058C	LDB7	P38210	180 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YNL058C	YNL058C	UMP1	P38293	148 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YNL058C	YNL058C	POP4	P38336	279 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YNL058C	YNL058C	VMA22	P38784	181 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YNL058C	YNL058C	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
YNL058C	YNL058C	HUA1	P40325	198 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YNL058C	YNL058C	KNH1	P50112	268 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YNL058C	YNL058C	RPL37B	P51402	88 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
YNL058C	YNL058C	SWP1	Q02795	286 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YNL058C	YNL058C	SNZ1	Q03148	297 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YNL058C	YNL058C	GAS3	Q03655	524 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YNL058C	YNL058C	MCP1	Q12106	302 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YNL058C	YNL058C	INO80	P53115	1489 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YNL058C	YNL058C	TIM9	O74700	87 aa		0.4	□□□□□ -2.35

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 68.7 ms