RNA–Protein interactions for RNA: YKR071C

DRE2, Transcript of Component of the cytosolic Fe-S protein assembly (CIA) machinery, yeast

Gene DRE2, Length 1,047 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DRE2	YKR071C	NDC1	P32500	655 aa		5.26	□□□□□ -1.57
DRE2	YKR071C	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
DRE2	YKR071C	SDS22	P36047	338 aa		5.26	□□□□□ -1.57
DRE2	YKR071C	RCN1	P36054	211 aa		5.26	□□□□□ -1.57
DRE2	YKR071C	THI2	P38141	450 aa		5.26	□□□□□ -1.57
DRE2	YKR071C	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
DRE2	YKR071C	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	5.26	□□□□□ -1.57
DRE2	YKR071C	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	5.26	□□□□□ -1.57
DRE2	YKR071C	YMR087W	Q04299	284 aa		5.26	□□□□□ -1.57
DRE2	YKR071C	YLR173W	Q06247	608 aa		5.26	□□□□□ -1.57
DRE2	YKR071C	RFM1	Q12192	310 aa		5.26	□□□□□ -1.57
DRE2	YKR071C	TRM10	Q12400	293 aa		5.26	□□□□□ -1.57
DRE2	YKR071C	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
DRE2	YKR071C	RPN13	O13563	156 aa		5.25	□□□□□ -1.57
DRE2	YKR071C	ELO2	P25358	347 aa		5.25	□□□□□ -1.57
DRE2	YKR071C	PPZ2	P33329	710 aa		5.25	□□□□□ -1.57
DRE2	YKR071C	SHE1	P38200	338 aa		5.25	□□□□□ -1.57
DRE2	YKR071C	GRX5	Q02784	150 aa		5.25	□□□□□ -1.57
DRE2	YKR071C	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
DRE2	YKR071C	FIN1	Q03898	291 aa		5.25	□□□□□ -1.57
DRE2	YKR071C	LIP2	Q06005	328 aa		5.25	□□□□□ -1.57
DRE2	YKR071C	YLR345W	Q06137	509 aa		5.25	□□□□□ -1.57
DRE2	YKR071C	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
DRE2	YKR071C	SPS4	P09937	338 aa		5.24	□□□□□ -1.57
DRE2	YKR071C	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
DRE2	YKR071C	YPT53	P36019	220 aa		5.24	□□□□□ -1.57
DRE2	YKR071C	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
DRE2	YKR071C	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
DRE2	YKR071C	FIP1	P45976	327 aa		5.24	□□□□□ -1.57
DRE2	YKR071C	EFM3	P47163	339 aa		5.24	□□□□□ -1.57
DRE2	YKR071C	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
DRE2	YKR071C	SOR2	Q07786	357 aa		5.24	□□□□□ -1.57
DRE2	YKR071C	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
DRE2	YKR071C	PET122	P10355	254 aa		5.23	□□□□□ -1.57
DRE2	YKR071C	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
DRE2	YKR071C	CUE1	P38428	203 aa		5.23	□□□□□ -1.57
DRE2	YKR071C	YLF2	P38746	405 aa		5.23	□□□□□ -1.57
DRE2	YKR071C	YJR056C	P47115	236 aa		5.23	□□□□□ -1.57
DRE2	YKR071C	SSN8	P47821	323 aa		5.23	□□□□□ -1.57
DRE2	YKR071C	COX18	P53239	316 aa		5.23	□□□□□ -1.57
DRE2	YKR071C	OKP1	P53298	406 aa		5.23	□□□□□ -1.57
DRE2	YKR071C	ECM18	Q04623	453 aa		5.23	□□□□□ -1.57
DRE2	YKR071C	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
DRE2	YKR071C	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
DRE2	YKR071C	YOR186W	Q08560	144 aa		5.23	□□□□□ -1.57
DRE2	YKR071C	FCY1	Q12178	158 aa		5.23	□□□□□ -1.57
DRE2	YKR071C	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
DRE2	YKR071C	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
DRE2	YKR071C	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		5.23	□□□□□ -1.57
DRE2	YKR071C	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
DRE2	YKR071C	PHO85	P17157	305 aa		5.22	□□□□□ -1.57
DRE2	YKR071C	MDM31	P38880	579 aa		5.22	□□□□□ -1.57
DRE2	YKR071C	JLP2	P40206	208 aa		5.22	□□□□□ -1.57
DRE2	YKR071C	RPA43	P46669	326 aa		5.22	□□□□□ -1.57
DRE2	YKR071C	MRX5	P47007	382 aa		5.22	□□□□□ -1.57
DRE2	YKR071C	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
DRE2	YKR071C	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
DRE2	YKR071C	YLR283W	Q05867	314 aa		5.22	□□□□□ -1.57
DRE2	YKR071C	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
DRE2	YKR071C	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
DRE2	YKR071C	VAM3	Q12241	283 aa		5.22	□□□□□ -1.57
DRE2	YKR071C	BBP1	Q12365	385 aa		5.22	□□□□□ -1.57
DRE2	YKR071C	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
DRE2	YKR071C	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
DRE2	YKR071C	GCN3	P14741	305 aa		5.21	□□□□□ -1.58
DRE2	YKR071C	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
DRE2	YKR071C	ATG22	P25568	528 aa		5.21	□□□□□ -1.58
DRE2	YKR071C	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
DRE2	YKR071C	FMC1	P40491	155 aa		5.21	□□□□□ -1.58
DRE2	YKR071C	YFL015C	P43578	164 aa		5.21	□□□□□ -1.58
DRE2	YKR071C	TTI2	P47168	421 aa		5.21	□□□□□ -1.58
DRE2	YKR071C	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
DRE2	YKR071C	YGL262W	P53054	175 aa		5.21	□□□□□ -1.58
DRE2	YKR071C	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
DRE2	YKR071C	UPS1	Q05776	175 aa		5.21	□□□□□ -1.58
DRE2	YKR071C	ASR1	Q06834	288 aa		5.21	□□□□□ -1.58
DRE2	YKR071C	ATO3	Q12359	275 aa		5.21	□□□□□ -1.58
DRE2	YKR071C	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
DRE2	YKR071C	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
DRE2	YKR071C	MTC7	P32633	139 aa		5.2	□□□□□ -1.58
DRE2	YKR071C	PMU1	P36069	295 aa		5.2	□□□□□ -1.58
DRE2	YKR071C	SDS24	P38314	527 aa		5.2	□□□□□ -1.58
DRE2	YKR071C	FCY21	P40039	528 aa		5.2	□□□□□ -1.58
DRE2	YKR071C	PAM16	P42949	149 aa		5.2	□□□□□ -1.58
DRE2	YKR071C	POP6	P53218	158 aa		5.2	□□□□□ -1.58
DRE2	YKR071C	PAU12	P53343	120 aa		5.2	□□□□□ -1.58
DRE2	YKR071C	CPR8	P53728	308 aa		5.2	□□□□□ -1.58
DRE2	YKR071C	SPG4	Q04438	115 aa		5.2	□□□□□ -1.58
DRE2	YKR071C	MGR3	Q04472	501 aa		5.2	□□□□□ -1.58
DRE2	YKR071C	YMR252C	Q04814	134 aa		5.2	□□□□□ -1.58
DRE2	YKR071C	PEX10	Q05568	337 aa		5.2	□□□□□ -1.58
DRE2	YKR071C	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
DRE2	YKR071C	MDM36	Q06820	579 aa		5.2	□□□□□ -1.58
DRE2	YKR071C	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
DRE2	YKR071C	HEM25	Q07534	307 aa		5.2	□□□□□ -1.58
DRE2	YKR071C	ATG40	Q99325	256 aa		5.2	□□□□□ -1.58
DRE2	YKR071C	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
DRE2	YKR071C	GPX2	P38143	162 aa		5.19	□□□□□ -1.58
DRE2	YKR071C	FMP23	P38231	175 aa		5.19	□□□□□ -1.58
DRE2	YKR071C	DDI1	P40087	428 aa		5.19	□□□□□ -1.58

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 22.2 ms