RNA–Protein interactions for RNA: YJL059W

YHC3, Transcript of Protein required for the ATP-dependent transport of arginine, yeast

Gene YHC3, Length 1,227 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YHC3	YJL059W	YMC1	P32331	307 aa		5.77	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	RTS2	P40962	232 aa		5.77	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	GAT1	P43574	510 aa		5.77	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	AVT4	P50944	713 aa		5.77	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	NRM1	P53718	249 aa		5.77	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	SCS7	Q03529	384 aa		5.77	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	YDL199C	Q12407	687 aa		5.77	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	CCH1	P50077	2039 aa		5.77	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	MRS1	P07266	363 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	AEP1	P32493	518 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	CSN9	Q03981	162 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	EAF3	Q12432	401 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	MOT1	P32333	1867 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	RPN13	O13563	156 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	HEM4	P06174	275 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	HSP30	P25619	332 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	PHA2	P32452	334 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	SRY1	P36007	326 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	PRY2	P36110	329 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.75	□□□□□ -1.49	not detected
YHC3	YJL059W	ECM14	P38836	430 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	SWP1	Q02795	286 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	LIP2	Q06005	328 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	HRT3	Q12347	344 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	RAX2	Q12465	1220 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	YCR023C	P25351	611 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	OAC1	P32332	324 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	EFM1	P38732	585 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	GLE2	P40066	365 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	FAR7	P43592	221 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	RAV2	Q03956	351 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	YLR112W	Q12130	139 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	WIP1	Q2V2P8	89 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	FCY2	P17064	533 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	ARO7	P32178	256 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	NVJ1	P38881	321 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	PET8	P38921	284 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	HEM14	P40012	539 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	MAM33	P40513	266 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	TOS8	P53147	276 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	BSC1	Q12140	328 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	MHT1	Q12525	324 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	YLR111W	Q12528	110 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	BEM2	P39960	2167 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	SCO1	P23833	295 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	CSG2	P35206	410 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	PEX22	P39718	180 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	PAN6	P40459	309 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	AIM25	P47140	327 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	SUN4	P53616	420 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	SUR7	P54003	302 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	SUE1	Q06524	206 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	YPL257W	Q08974	193 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
YHC3	YJL059W	PBI2	P0CT04	75 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
YHC3	YJL059W	CDC50	P25656	391 aa		5.71	□□□□□ -1.5
YHC3	YJL059W	TRS65	P32893	560 aa		5.71	□□□□□ -1.5
YHC3	YJL059W	APS1	P35181	156 aa		5.71	□□□□□ -1.5
YHC3	YJL059W	SRL3	P36167	246 aa		5.71	□□□□□ -1.5
YHC3	YJL059W	RCK1	P38622	512 aa		5.71	□□□□□ -1.5
YHC3	YJL059W	EGT2	P42835	1041 aa		5.71	□□□□□ -1.5
YHC3	YJL059W	RRT5	P43607	289 aa		5.71	□□□□□ -1.5
YHC3	YJL059W	MRX11	Q03079	207 aa		5.71	□□□□□ -1.5
YHC3	YJL059W	PIR3	Q03180	325 aa		5.71	□□□□□ -1.5
YHC3	YJL059W	YMD8	Q03697	442 aa		5.71	□□□□□ -1.5
YHC3	YJL059W	YMR317W	Q04893	1140 aa		5.71	□□□□□ -1.5
YHC3	YJL059W	HMS1	Q12398	434 aa		5.71	□□□□□ -1.5
YHC3	YJL059W	UTP20	P35194	2493 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
YHC3	YJL059W	KIN28	P06242	306 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YHC3	YJL059W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
YHC3	YJL059W	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
YHC3	YJL059W	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
YHC3	YJL059W	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
YHC3	YJL059W	FRM2	P37261	193 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YHC3	YJL059W	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
YHC3	YJL059W	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
YHC3	YJL059W	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5

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