RNA–Protein interactions for RNA: YER103W

SSA4, Transcript of Heat shock protein that is highly induced upon stress, yeastyeast

Gene SSA4, Length 1,929 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSA4YER103W COQ3P27680 312 aa11.33□□□□□ -0.6
SSA4YER103W PAD1P33751 242 aaKnown RBP RIP-Chip data11.33□□□□□ -0.6not detected
SSA4YER103W PEX28P38848 579 aa11.33□□□□□ -0.6
SSA4YER103W RPA34P47006 233 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
SSA4YER103W NPC2Q12408 173 aa11.33□□□□□ -0.6
SSA4YER103W LAS17Q12446 633 aa11.33□□□□□ -0.6
SSA4YER103W CTA1P15202 515 aa11.32□□□□□ -0.6
SSA4YER103W RFA1P22336 621 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
SSA4YER103W TAE1P38340 232 aa11.32□□□□□ -0.6
SSA4YER103W FLC3P53121 802 aa11.32□□□□□ -0.6
SSA4YER103W STE18P18852 110 aa11.31□□□□□ -0.6
SSA4YER103W YJR012CP47087 207 aa11.31□□□□□ -0.6
SSA4YER103W CWC27Q02770 301 aa11.31□□□□□ -0.6
SSA4YER103W YMR082CQ04276 118 aa11.31□□□□□ -0.6
SSA4YER103W UBA3Q99344 299 aa11.31□□□□□ -0.6
SSA4YER103W HOP09932 586 aa11.31□□□□□ -0.6
SSA4YER103W TPC1P53257 314 aa11.31□□□□□ -0.6
SSA4YER103W YML096WQ04489 525 aa11.31□□□□□ -0.6
SSA4YER103W PFA4Q12006 378 aa11.31□□□□□ -0.6
SSA4YER103W OPI3P05375 206 aa11.3□□□□□ -0.6
SSA4YER103W NHP6AP11632 93 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
SSA4YER103W GPX1P36014 167 aa11.3□□□□□ -0.6
SSA4YER103W YER010CP40011 234 aa11.3□□□□□ -0.6
SSA4YER103W ATG27P46989 271 aa11.3□□□□□ -0.6
SSA4YER103W MTQ2Q03920 221 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
SSA4YER103W ILV5P06168 395 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
SSA4YER103W NUP1P20676 1076 aa11.29□□□□□ -0.6
SSA4YER103W POA1P38218 177 aa11.29□□□□□ -0.6
SSA4YER103W ERJ5P43613 295 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
SSA4YER103W GWT1P47026 490 aa11.29□□□□□ -0.6
SSA4YER103W PAU4P53427 120 aa11.29□□□□□ -0.6
SSA4YER103W YOP1Q12402 180 aa11.29□□□□□ -0.6
SSA4YER103W TDH3P00359 332 aaKnown RBP RIP-Chip data11.29□□□□□ -0.6not detected
SSA4YER103W DFR1P07807 211 aaKnown RBP RIP-Chip data11.29□□□□□ -0.6not detected
SSA4YER103W ELO2P25358 347 aa11.28□□□□□ -0.6
SSA4YER103W HSP10P38910 106 aa11.28□□□□□ -0.6
SSA4YER103W YDL242WQ07746 117 aa11.28□□□□□ -0.6
SSA4YER103W AKR2Q12013 749 aa11.28□□□□□ -0.6
SSA4YER103W SME1Q12330 94 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
SSA4YER103W TOM1Q03280 3268 aa11.28□□□□□ -0.6
SSA4YER103W RPL20AP0CX23 172 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.6
SSA4YER103W RPL20BP0CX24 172 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.6
SSA4YER103W OM14P38325 134 aa11.27□□□□□ -0.6
SSA4YER103W PMT3P47190 753 aa11.27□□□□□ -0.6
SSA4YER103W FRQ1Q06389 190 aa11.27□□□□□ -0.6
SSA4YER103W PAU1P0CE88 120 aa11.27□□□□□ -0.61
SSA4YER103W PAU14P0CE89 120 aa11.27□□□□□ -0.61
SSA4YER103W PAU6P0CE90 120 aa11.27□□□□□ -0.61
SSA4YER103W PAU18P0CE91 120 aa11.27□□□□□ -0.61
SSA4YER103W PAU8P0CE92 120 aa11.27□□□□□ -0.61
SSA4YER103W PAU11P0CE93 120 aa11.27□□□□□ -0.61
SSA4YER103W PAU13P38725 120 aa11.27□□□□□ -0.61
SSA4YER103W RTC3P38804 111 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
SSA4YER103W PEX7P39108 375 aa11.27□□□□□ -0.61
SSA4YER103W SMD3P43321 101 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
SSA4YER103W MPP6P53725 186 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
SSA4YER103W PET191Q02772 108 aa11.27□□□□□ -0.61
SSA4YER103W PAU10Q03050 120 aa11.27□□□□□ -0.61
SSA4YER103W RUB1Q03919 77 aa11.27□□□□□ -0.61
SSA4YER103W PAU20Q08322 120 aa11.27□□□□□ -0.61
SSA4YER103W FCY22Q12119 530 aa11.27□□□□□ -0.61
SSA4YER103W PAU9Q3E770 120 aa11.27□□□□□ -0.61
SSA4YER103W MAK32P23060 363 aa11.26□□□□□ -0.61
SSA4YER103W YBR096WP38256 230 aa11.26□□□□□ -0.61
SSA4YER103W XBP1P40489 647 aa11.26□□□□□ -0.61
SSA4YER103W IRC24P40580 263 aa11.26□□□□□ -0.61
SSA4YER103W YJR011CP47086 261 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
SSA4YER103W COA2Q3E823 68 aa11.26□□□□□ -0.61
SSA4YER103W YHR210CP38893 341 aa11.25□□□□□ -0.61
SSA4YER103W PIB1Q06651 286 aa11.25□□□□□ -0.61
SSA4YER103W COQ10Q08058 207 aa11.25□□□□□ -0.61
SSA4YER103W MEK1P24719 497 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
SSA4YER103W RFA3P26755 122 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
SSA4YER103W CUE1P38428 203 aa11.25□□□□□ -0.61
SSA4YER103W SOH1P38633 127 aa11.25□□□□□ -0.61
SSA4YER103W YIL152WP40455 235 aa11.25□□□□□ -0.61
SSA4YER103W PKR1Q03880 122 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
SSA4YER103W MRPL1Q04599 285 aa11.25□□□□□ -0.61
SSA4YER103W BSC6Q08280 497 aa11.25□□□□□ -0.61
SSA4YER103W NAT5Q08689 176 aa11.25□□□□□ -0.61
SSA4YER103W YBL029C-AQ3E756 94 aa11.25□□□□□ -0.61
SSA4YER103W INH1P01097 85 aa11.24□□□□□ -0.61
SSA4YER103W RPL1AP0CX43 217 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
SSA4YER103W RPL1BP0CX44 217 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
SSA4YER103W RPB8P20436 146 aa11.24□□□□□ -0.61
SSA4YER103W LRO1P40345 661 aa11.24□□□□□ -0.61
SSA4YER103W RNH201P53942 307 aa11.24□□□□□ -0.61
SSA4YER103W YPL067CQ02754 198 aa11.24□□□□□ -0.61
SSA4YER103W MDM35O60200 86 aa11.23□□□□□ -0.61
SSA4YER103W HAP3P13434 144 aa11.23□□□□□ -0.61
SSA4YER103W PDX1P16451 410 aa11.23□□□□□ -0.61
SSA4YER103W BRR6P53062 197 aa11.23□□□□□ -0.61
SSA4YER103W FHN1P53279 174 aa11.23□□□□□ -0.61
SSA4YER103W SOL3P38858 249 aa11.23□□□□□ -0.61
SSA4YER103W COX16P47081 118 aa11.23□□□□□ -0.61
SSA4YER103W ERV2Q12284 196 aa11.23□□□□□ -0.61
SSA4YER103W PPA2P28239 310 aa11.22□□□□□ -0.61
SSA4YER103W LDH1P38139 375 aa11.22□□□□□ -0.61
SSA4YER103W ERG25P53045 309 aa11.22□□□□□ -0.61
SSA4YER103W YGR250CP53316 781 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 33.5 ms