RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613876.1

CCL23-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 23, humanhuman

TSL 3

Gene CCL23, Length 402 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23-202ENST00000613876 CCDC175P0C221 793 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 CCDC172P0C7W6 258 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 GHRP10912 638 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 AKAP5P24588 427 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 CLCN1P35523 988 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 YARSP54577 528 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 MYL6P60660 151 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 KRT83P78385 493 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 GCNT1Q02742 428 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 PTK2Q05397 1052 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 PAK2Q13177 524 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 TRPC3Q13507 836 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 LPIN1Q14693 890 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 TMEM132DQ14C87 1099 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 FMNL3Q8IVF7 1028 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 FAM126BQ8IXS8 530 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 FAM71AQ8IYT1 594 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 PPM1KQ8N3J5 372 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 C1orf127Q8N9H9 656 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 USP38Q8NB14 1042 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 ACRBPQ8NEB7 543 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 CXorf38Q8TB03 319 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 SHC3Q92529 594 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 ARMC5Q96C12 935 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 KIF12Q96FN5 646 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 ZNF333Q96JL9 665 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 SNX27Q96L92 541 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 TSPAN18Q96SJ8 248 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 APOL6Q9BWW8 343 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 XYLT2Q9H1B5 865 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 FAM105AQ9NUU6 356 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 RNF19AQ9NV58 838 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 DPP3Q9NY33 737 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 CNTN3Q9P232 1028 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 SIX4Q9UIU6 781 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 HES2Q9Y543 173 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 IPPQ9Y573 584 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 NUB1Q9Y5A7 615 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 UMODL1Q5DID0 1318 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 A0A087X0T9 212 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 A0A0U1RQJ8 604 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 RCCD1A6NED2 376 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP5.72□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 TLR3O15455 904 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 CYP26A1O43174 497 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 ZNF623O75123 536 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 ABL1P00519 1130 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 ITGB3P05106 788 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 KRT19P08727 400 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 FAM228BP0C875 321 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 ITGA4P13612 1032 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 KCNE1P15382 129 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 SELPP16109 830 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 CHRNB2P17787 502 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 ACO1P21399 889 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 TNFAIP3P21580 790 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 ANXA13P27216 316 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 ATICP31939 592 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 USP8P40818 1118 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 MAGEA1P43355 309 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 GUCY2FP51841 1108 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 KIF11P52732 1056 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 NOP14P78316 857 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 RBP5P82980 135 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 CYP27A1Q02318 531 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 BFSP2Q13515 415 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 CUL2Q13617 745 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 MBTPS1Q14703 1052 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 GPNMBQ14956 572 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 SPA17Q15506 151 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 PTPN14Q15678 1187 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 SLC18A3Q16572 532 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 NYAP1Q6ZVC0 841 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 UBR7Q8N806 425 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 BEST2Q8NFU1 509 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 SLC30A5Q8TAD4 765 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 OLIG1Q8TAK6 271 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL23-202ENST00000613876 CAGE1Q8TC20 777 aa5.72□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45 ms