RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000063116.9

Msx1-201, Transcript of Homeobox protein MSX-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Msx1, Length 1,935 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx1-201ENSMUST00000063116 Krt28A6BLY7 462 aa20.97■□□□□ 0.95
Msx1-201ENSMUST00000063116 Lekr1B2RVN1 116 aa20.97■□□□□ 0.95
Msx1-201ENSMUST00000063116 Tatdn2B7ZNL9 783 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ass1P16460 412 aa20.97■□□□□ 0.95
Msx1-201ENSMUST00000063116 ZfxP17012 799 aa20.97■□□□□ 0.95
Msx1-201ENSMUST00000063116 Rhox5P52651 210 aa20.97■□□□□ 0.95
Msx1-201ENSMUST00000063116 Upf3bQ3ULL6 472 aa20.97■□□□□ 0.95
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gpr156Q6PCP7 798 aa20.97■□□□□ 0.95
Msx1-201ENSMUST00000063116 Il33Q8BVZ5 266 aa20.97■□□□□ 0.95
Msx1-201ENSMUST00000063116 Phka2Q8BWJ3 1235 aa20.97■□□□□ 0.95
Msx1-201ENSMUST00000063116 Slc7a14Q8BXR1 771 aa20.97■□□□□ 0.95
Msx1-201ENSMUST00000063116 Vmn1r203Q8R273 311 aa20.97■□□□□ 0.95
Msx1-201ENSMUST00000063116 Olfr385Q8VGT1 312 aa20.97■□□□□ 0.95
Msx1-201ENSMUST00000063116 4930548H24RikQ9D496 437 aa20.97■□□□□ 0.95
Msx1-201ENSMUST00000063116 Zranb2Q9R020 330 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
Msx1-201ENSMUST00000063116 Col5a3Q9JLI2 1739 aa20.97■□□□□ 0.95
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gm28919A0A087WP35 240 aa20.96■□□□□ 0.95
Msx1-201ENSMUST00000063116 Slc6a21A0A1B0GSD2 748 aa20.96■□□□□ 0.95
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gm4297D3YWB7 211 aa20.96■□□□□ 0.95
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gimd1E9PW74 217 aa20.96■□□□□ 0.95
Msx1-201ENSMUST00000063116 Nfatc2ipO09130 412 aa20.96■□□□□ 0.95
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cbx1P83917 185 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
Msx1-201ENSMUST00000063116 OgdhQ60597 1023 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cfap100Q80VN0 613 aa20.96■□□□□ 0.95
Msx1-201ENSMUST00000063116 Nup58Q8R332 587 aa20.96■□□□□ 0.95
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cables1Q9ESJ1 568 aa20.96■□□□□ 0.95
Msx1-201ENSMUST00000063116 Rap1gapA2ALS5 663 aa20.96■□□□□ 0.95
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gm8994E9PV04 411 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
Msx1-201ENSMUST00000063116 Kpna6O35345 536 aa20.96■□□□□ 0.95
Msx1-201ENSMUST00000063116 StrnO55106 780 aa20.96■□□□□ 0.95
Msx1-201ENSMUST00000063116 Oaz1P54369 227 aa20.96■□□□□ 0.95
Msx1-201ENSMUST00000063116 AdkP55264 361 aa20.96■□□□□ 0.95
Msx1-201ENSMUST00000063116 Tubb5P99024 444 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
Msx1-201ENSMUST00000063116 Mark3Q03141 753 aa20.96■□□□□ 0.95
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cyfip2Q5SQX6 1253 aa20.96■□□□□ 0.95
Msx1-201ENSMUST00000063116 Tcaf3Q6QR59 914 aa20.96■□□□□ 0.95
Msx1-201ENSMUST00000063116 Znf12Q7TSI0 686 aa20.96■□□□□ 0.95
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cyp2d26Q8CIM7 500 aa20.96■□□□□ 0.95
Msx1-201ENSMUST00000063116 D630039A03RikQ8K0M7 236 aa20.96■□□□□ 0.95
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ube2sQ921J4 223 aa20.96■□□□□ 0.95
Msx1-201ENSMUST00000063116 Zmat2Q9CPW7 199 aa20.96■□□□□ 0.95
Msx1-201ENSMUST00000063116 Zfyve19Q9DAZ9 389 aa20.96■□□□□ 0.95
Msx1-201ENSMUST00000063116 Efcab12V9GXH0 673 aa20.96■□□□□ 0.95
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gm12394A2AKP6 982 aa20.95■□□□□ 0.94
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gm2030D3Z7C4 212 aa20.95■□□□□ 0.94
Msx1-201ENSMUST00000063116 Rps6ka1P18653 724 aa20.95■□□□□ 0.94
Msx1-201ENSMUST00000063116 Serpinh1P19324 417 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
Msx1-201ENSMUST00000063116 Haus1Q8BHX1 278 aa20.95■□□□□ 0.94
Msx1-201ENSMUST00000063116 Lrrc45Q8CIM1 670 aa20.95■□□□□ 0.94
Msx1-201ENSMUST00000063116 TtpalQ9D3D0 343 aa20.95■□□□□ 0.94
Msx1-201ENSMUST00000063116 MsraQ9D6Y7 233 aa20.95■□□□□ 0.94
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cpne8Q9DC53 577 aa20.95■□□□□ 0.94
Msx1-201ENSMUST00000063116 Adamts9E9PUN6 1931 aa20.95■□□□□ 0.94
Msx1-201ENSMUST00000063116 Slc35g2D3YVE8 412 aa20.94■□□□□ 0.94
Msx1-201ENSMUST00000063116 RarbP22605 482 aa20.94■□□□□ 0.94
Msx1-201ENSMUST00000063116 HmmrQ00547 794 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
Msx1-201ENSMUST00000063116 Tp53i13Q5F267 385 aa20.94■□□□□ 0.94
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ccdc85aQ5SP85 500 aa20.94■□□□□ 0.94
Msx1-201ENSMUST00000063116 Q6GQV0 436 aa20.94■□□□□ 0.94
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ubxn1Q922Y1 297 aa20.94■□□□□ 0.94
Msx1-201ENSMUST00000063116 PirQ9D711 290 aa20.94■□□□□ 0.94
Msx1-201ENSMUST00000063116 Upf1Q9EPU0 1124 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
Msx1-201ENSMUST00000063116 Mta2Q9R190 668 aa20.94■□□□□ 0.94
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gm28036V9GXJ1 658 aa20.94■□□□□ 0.94
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gm27029A2A4P4 543 aa20.94■□□□□ 0.94
Msx1-201ENSMUST00000063116 Rnf19bA2A7Q9 732 aa20.94■□□□□ 0.94
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cdh8P97291 799 aa20.94■□□□□ 0.94
Msx1-201ENSMUST00000063116 Evi5P97366 809 aa20.94■□□□□ 0.94
Msx1-201ENSMUST00000063116 Phlda1Q62392 405 aa20.94■□□□□ 0.94
Msx1-201ENSMUST00000063116 DcakdQ8BHC4 231 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
Msx1-201ENSMUST00000063116 Polr2bQ8CFI7 1174 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
Msx1-201ENSMUST00000063116 VasnQ9CZT5 673 aa20.94■□□□□ 0.94
Msx1-201ENSMUST00000063116 Llcfc1Q9D9P8 108 aa20.94■□□□□ 0.94
Msx1-201ENSMUST00000063116 Lonp2Q9DBN5 852 aa20.94■□□□□ 0.94
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ttc3O88196 1979 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
Msx1-201ENSMUST00000063116 EloblA6PWE0 161 aa20.93■□□□□ 0.94
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gm4788E9Q8B5 879 aa20.93■□□□□ 0.94
Msx1-201ENSMUST00000063116 PoliQ6R3M4 717 aa20.93■□□□□ 0.94
Msx1-201ENSMUST00000063116 Hpcal4Q8BGZ1 191 aa20.93■□□□□ 0.94
Msx1-201ENSMUST00000063116 H6pdQ8CFX1 789 aa20.93■□□□□ 0.94
Msx1-201ENSMUST00000063116 Dnajc12Q9R022 198 aa20.93■□□□□ 0.94
Msx1-201ENSMUST00000063116 Slc16a6B1AT66 607 aa20.92■□□□□ 0.94
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gm3164L7N2B9 238 aa20.92■□□□□ 0.94
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gm3264L7N2C5 238 aa20.92■□□□□ 0.94
Msx1-201ENSMUST00000063116 Tagap1P0CAX8 505 aa20.92■□□□□ 0.94
Msx1-201ENSMUST00000063116 Tbxas1P36423 533 aa20.92■□□□□ 0.94
Msx1-201ENSMUST00000063116 GssP51855 474 aa20.92■□□□□ 0.94
Msx1-201ENSMUST00000063116 Pcbp1P60335 356 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ctc1Q5SUQ9 1212 aa20.92■□□□□ 0.94
Msx1-201ENSMUST00000063116 Fgfr1opQ66JX5 399 aa20.92■□□□□ 0.94
Msx1-201ENSMUST00000063116 PolrmtQ8BKF1 1207 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
Msx1-201ENSMUST00000063116 Hook3Q8BUK6 718 aa20.92■□□□□ 0.94
Msx1-201ENSMUST00000063116 CarfQ8VHI4 689 aa20.92■□□□□ 0.94
Msx1-201ENSMUST00000063116 Pqbp1Q91VJ5 263 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
Msx1-201ENSMUST00000063116 RragcQ99K70 398 aa20.92■□□□□ 0.94
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ssr1Q9CY50 286 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
Msx1-201ENSMUST00000063116 Stx17Q9D0I4 301 aa20.92■□□□□ 0.94
Msx1-201ENSMUST00000063116 Pacsin2Q9WVE8 486 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
Msx1-201ENSMUST00000063116 SktA2AQ25 1946 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gm12800B1AUV4 484 aa20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23.4 ms