Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3D0

Ttpal, Alpha-tocopherol transfer protein-like, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpalQ9D3D0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42,42■■■■■ 4,38
TtpalQ9D3D0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC39,22■■■■□ 3,87
TtpalQ9D3D0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,74■■■■□ 3,79
TtpalQ9D3D0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37,07■■■■□ 3,52
TtpalQ9D3D0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36,76■■■■□ 3,48
TtpalQ9D3D0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36,24■■■■□ 3,39
TtpalQ9D3D0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3,35
TtpalQ9D3D0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,98■■■■□ 3,35
TtpalQ9D3D0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,85■■■■□ 3,33
TtpalQ9D3D0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35,69■■■■□ 3,3
TtpalQ9D3D0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,51■■■■□ 3,28
TtpalQ9D3D0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35,48■■■■□ 3,27
TtpalQ9D3D0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,26■■■■□ 3,24
TtpalQ9D3D0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,95■■■■□ 3,18
TtpalQ9D3D0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,63■■■■□ 3,13
TtpalQ9D3D0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34,28■■■■□ 3,08
TtpalQ9D3D0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34,25■■■■□ 3,07
TtpalQ9D3D0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,22■■■■□ 3,07
TtpalQ9D3D0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34,13■■■■□ 3,05
TtpalQ9D3D0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,13■■■■□ 3,05
TtpalQ9D3D0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3,03
TtpalQ9D3D0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,94■■■■□ 3,02
TtpalQ9D3D0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33,91■■■■□ 3,02
TtpalQ9D3D0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,78■■■■□ 3
TtpalQ9D3D0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,76■■■■□ 3
TtpalQ9D3D0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,65■■■□□ 2,98
TtpalQ9D3D0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,63■■■□□ 2,97
TtpalQ9D3D0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,6■■■□□ 2,97
TtpalQ9D3D0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,6■■■□□ 2,97
TtpalQ9D3D0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,58■■■□□ 2,97
TtpalQ9D3D0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33,54■■■□□ 2,96
TtpalQ9D3D0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33,51■■■□□ 2,95
TtpalQ9D3D0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33,49■■■□□ 2,95
TtpalQ9D3D0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,39■■■□□ 2,94
TtpalQ9D3D0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,34■■■□□ 2,93
TtpalQ9D3D0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,12■■■□□ 2,89
TtpalQ9D3D0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33,06■■■□□ 2,88
TtpalQ9D3D0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32,93■■■□□ 2,86
TtpalQ9D3D0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32,85■■■□□ 2,85
TtpalQ9D3D0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,76■■■□□ 2,83
TtpalQ9D3D0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32,7■■■□□ 2,83
TtpalQ9D3D0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32,62■■■□□ 2,81
TtpalQ9D3D0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32,56■■■□□ 2,8
TtpalQ9D3D0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,53■■■□□ 2,8
TtpalQ9D3D0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32,51■■■□□ 2,79
TtpalQ9D3D0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,42■■■□□ 2,78
TtpalQ9D3D0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,42■■■□□ 2,78
TtpalQ9D3D0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,37■■■□□ 2,77
TtpalQ9D3D0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32,31■■■□□ 2,76
TtpalQ9D3D0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32,29■■■□□ 2,76
TtpalQ9D3D0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,24■■■□□ 2,75
TtpalQ9D3D0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32,13■■■□□ 2,73
TtpalQ9D3D0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,01■■■□□ 2,71
TtpalQ9D3D0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31,98■■■□□ 2,71
TtpalQ9D3D0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31,94■■■□□ 2,7
TtpalQ9D3D0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,92■■■□□ 2,7
TtpalQ9D3D0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31,91■■■□□ 2,7
TtpalQ9D3D0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,89■■■□□ 2,69
TtpalQ9D3D0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,87■■■□□ 2,69
TtpalQ9D3D0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,84■■■□□ 2,69
TtpalQ9D3D0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31,84■■■□□ 2,69
TtpalQ9D3D0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,75■■■□□ 2,67
TtpalQ9D3D0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,72■■■□□ 2,67
TtpalQ9D3D0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC31,7■■■□□ 2,67
TtpalQ9D3D0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,66■■■□□ 2,66
TtpalQ9D3D0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31,66■■■□□ 2,66
TtpalQ9D3D0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31,57■■■□□ 2,64
TtpalQ9D3D0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31,55■■■□□ 2,64
TtpalQ9D3D0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31,54■■■□□ 2,64
TtpalQ9D3D0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC31,48■■■□□ 2,63
TtpalQ9D3D0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31,46■■■□□ 2,63
TtpalQ9D3D0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31,45■■■□□ 2,62
TtpalQ9D3D0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,44■■■□□ 2,62
TtpalQ9D3D0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,44■■■□□ 2,62
TtpalQ9D3D0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,43■■■□□ 2,62
TtpalQ9D3D0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31,41■■■□□ 2,62
TtpalQ9D3D0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,62
TtpalQ9D3D0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,38■■■□□ 2,61
TtpalQ9D3D0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,35■■■□□ 2,61
TtpalQ9D3D0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
TtpalQ9D3D0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC31,33■■■□□ 2,61
TtpalQ9D3D0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
TtpalQ9D3D0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,31■■■□□ 2,6
TtpalQ9D3D0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
TtpalQ9D3D0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
TtpalQ9D3D0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31,23■■■□□ 2,59
TtpalQ9D3D0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,21■■■□□ 2,59
TtpalQ9D3D0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC31,19■■■□□ 2,58
TtpalQ9D3D0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,17■■■□□ 2,58
TtpalQ9D3D0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31,14■■■□□ 2,58
TtpalQ9D3D0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC31,13■■■□□ 2,57
TtpalQ9D3D0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,11■■■□□ 2,57
TtpalQ9D3D0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,11■■■□□ 2,57
TtpalQ9D3D0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC31,1■■■□□ 2,57
TtpalQ9D3D0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
TtpalQ9D3D0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2,55
TtpalQ9D3D0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30,96■■■□□ 2,55
TtpalQ9D3D0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,96■■■□□ 2,55
TtpalQ9D3D0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30,95■■■□□ 2,55
TtpalQ9D3D0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms