Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3D0

Ttpal, Alpha-tocopherol transfer protein-like, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpalQ9D3D0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42.42■■■■■ 4.38
TtpalQ9D3D0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
TtpalQ9D3D0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
TtpalQ9D3D0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
TtpalQ9D3D0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
TtpalQ9D3D0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
TtpalQ9D3D0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
TtpalQ9D3D0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TtpalQ9D3D0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
TtpalQ9D3D0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
TtpalQ9D3D0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
TtpalQ9D3D0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
TtpalQ9D3D0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
TtpalQ9D3D0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.18
TtpalQ9D3D0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
TtpalQ9D3D0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TtpalQ9D3D0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
TtpalQ9D3D0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
TtpalQ9D3D0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
TtpalQ9D3D0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TtpalQ9D3D0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
TtpalQ9D3D0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TtpalQ9D3D0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TtpalQ9D3D0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
TtpalQ9D3D0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
TtpalQ9D3D0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TtpalQ9D3D0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TtpalQ9D3D0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TtpalQ9D3D0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TtpalQ9D3D0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TtpalQ9D3D0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TtpalQ9D3D0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
TtpalQ9D3D0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
TtpalQ9D3D0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TtpalQ9D3D0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TtpalQ9D3D0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TtpalQ9D3D0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
TtpalQ9D3D0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
TtpalQ9D3D0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
TtpalQ9D3D0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
TtpalQ9D3D0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
TtpalQ9D3D0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TtpalQ9D3D0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
TtpalQ9D3D0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
TtpalQ9D3D0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
TtpalQ9D3D0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TtpalQ9D3D0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TtpalQ9D3D0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TtpalQ9D3D0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TtpalQ9D3D0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TtpalQ9D3D0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TtpalQ9D3D0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
TtpalQ9D3D0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
TtpalQ9D3D0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TtpalQ9D3D0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
TtpalQ9D3D0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TtpalQ9D3D0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
TtpalQ9D3D0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
TtpalQ9D3D0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TtpalQ9D3D0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TtpalQ9D3D0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
TtpalQ9D3D0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TtpalQ9D3D0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TtpalQ9D3D0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
TtpalQ9D3D0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TtpalQ9D3D0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TtpalQ9D3D0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TtpalQ9D3D0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TtpalQ9D3D0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TtpalQ9D3D0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TtpalQ9D3D0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TtpalQ9D3D0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.62
TtpalQ9D3D0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TtpalQ9D3D0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TtpalQ9D3D0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
TtpalQ9D3D0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TtpalQ9D3D0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TtpalQ9D3D0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TtpalQ9D3D0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TtpalQ9D3D0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TtpalQ9D3D0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
TtpalQ9D3D0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TtpalQ9D3D0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TtpalQ9D3D0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TtpalQ9D3D0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TtpalQ9D3D0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
TtpalQ9D3D0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TtpalQ9D3D0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TtpalQ9D3D0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TtpalQ9D3D0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TtpalQ9D3D0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TtpalQ9D3D0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TtpalQ9D3D0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TtpalQ9D3D0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
TtpalQ9D3D0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TtpalQ9D3D0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TtpalQ9D3D0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TtpalQ9D3D0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TtpalQ9D3D0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
TtpalQ9D3D0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
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