Protein–RNA interactions for Protein: Q9R022

Dnajc12, DnaJ homolog subfamily C member 12, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc12Q9R022 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40,59■■■■■ 4,09
Dnajc12Q9R022 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37,4■■■■□ 3,58
Dnajc12Q9R022 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,96■■■■□ 3,51
Dnajc12Q9R022 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,18■■■■□ 3,38
Dnajc12Q9R022 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35,75■■■■□ 3,31
Dnajc12Q9R022 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,44■■■■□ 3,26
Dnajc12Q9R022 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,05■■■■□ 3,2
Dnajc12Q9R022 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35,02■■■■□ 3,2
Dnajc12Q9R022 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34,98■■■■□ 3,19
Dnajc12Q9R022 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,61■■■■□ 3,13
Dnajc12Q9R022 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,25■■■■□ 3,07
Dnajc12Q9R022 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34,04■■■■□ 3,04
Dnajc12Q9R022 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,04■■■■□ 3,04
Dnajc12Q9R022 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33,97■■■■□ 3,03
Dnajc12Q9R022 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,75■■■□□ 2,99
Dnajc12Q9R022 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33,64■■■□□ 2,98
Dnajc12Q9R022 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33,41■■■□□ 2,94
Dnajc12Q9R022 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,35■■■□□ 2,93
Dnajc12Q9R022 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,34■■■□□ 2,93
Dnajc12Q9R022 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,34■■■□□ 2,93
Dnajc12Q9R022 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,24■■■□□ 2,91
Dnajc12Q9R022 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,23■■■□□ 2,91
Dnajc12Q9R022 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,02■■■□□ 2,88
Dnajc12Q9R022 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32,99■■■□□ 2,87
Dnajc12Q9R022 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,99■■■□□ 2,87
Dnajc12Q9R022 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,95■■■□□ 2,86
Dnajc12Q9R022 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32,87■■■□□ 2,85
Dnajc12Q9R022 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32,82■■■□□ 2,84
Dnajc12Q9R022 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,82■■■□□ 2,84
Dnajc12Q9R022 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,52■■■□□ 2,8
Dnajc12Q9R022 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32,4■■■□□ 2,78
Dnajc12Q9R022 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32,39■■■□□ 2,78
Dnajc12Q9R022 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,39■■■□□ 2,78
Dnajc12Q9R022 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32,19■■■□□ 2,74
Dnajc12Q9R022 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,15■■■□□ 2,74
Dnajc12Q9R022 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,13■■■□□ 2,73
Dnajc12Q9R022 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,09■■■□□ 2,73
Dnajc12Q9R022 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,08■■■□□ 2,73
Dnajc12Q9R022 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,97■■■□□ 2,71
Dnajc12Q9R022 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31,95■■■□□ 2,71
Dnajc12Q9R022 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31,93■■■□□ 2,7
Dnajc12Q9R022 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31,83■■■□□ 2,69
Dnajc12Q9R022 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,72■■■□□ 2,67
Dnajc12Q9R022 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,68■■■□□ 2,66
Dnajc12Q9R022 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,63■■■□□ 2,65
Dnajc12Q9R022 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,58■■■□□ 2,65
Dnajc12Q9R022 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,52■■■□□ 2,64
Dnajc12Q9R022 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,51■■■□□ 2,63
Dnajc12Q9R022 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31,48■■■□□ 2,63
Dnajc12Q9R022 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31,39■■■□□ 2,62
Dnajc12Q9R022 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,38■■■□□ 2,61
Dnajc12Q9R022 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31,38■■■□□ 2,61
Dnajc12Q9R022 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31,37■■■□□ 2,61
Dnajc12Q9R022 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31,29■■■□□ 2,6
Dnajc12Q9R022 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,21■■■□□ 2,59
Dnajc12Q9R022 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,19■■■□□ 2,58
Dnajc12Q9R022 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31,16■■■□□ 2,58
Dnajc12Q9R022 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31,12■■■□□ 2,57
Dnajc12Q9R022 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,11■■■□□ 2,57
Dnajc12Q9R022 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31,06■■■□□ 2,56
Dnajc12Q9R022 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
Dnajc12Q9R022 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Dnajc12Q9R022 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,56
Dnajc12Q9R022 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,56
Dnajc12Q9R022 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,01■■■□□ 2,55
Dnajc12Q9R022 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30,99■■■□□ 2,55
Dnajc12Q9R022 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Dnajc12Q9R022 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Dnajc12Q9R022 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,54
Dnajc12Q9R022 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30,9■■■□□ 2,54
Dnajc12Q9R022 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,89■■■□□ 2,53
Dnajc12Q9R022 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,88■■■□□ 2,53
Dnajc12Q9R022 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
Dnajc12Q9R022 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30,71■■■□□ 2,51
Dnajc12Q9R022 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30,64■■■□□ 2,5
Dnajc12Q9R022 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
Dnajc12Q9R022 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30,6■■■□□ 2,49
Dnajc12Q9R022 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30,59■■■□□ 2,49
Dnajc12Q9R022 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
Dnajc12Q9R022 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Dnajc12Q9R022 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30,51■■■□□ 2,47
Dnajc12Q9R022 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
Dnajc12Q9R022 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30,49■■■□□ 2,47
Dnajc12Q9R022 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
Dnajc12Q9R022 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Dnajc12Q9R022 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,34■■■□□ 2,45
Dnajc12Q9R022 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30,31■■■□□ 2,44
Dnajc12Q9R022 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Dnajc12Q9R022 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Dnajc12Q9R022 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30,23■■■□□ 2,43
Dnajc12Q9R022 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30,17■■■□□ 2,42
Dnajc12Q9R022 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Dnajc12Q9R022 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Dnajc12Q9R022 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Dnajc12Q9R022 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30,08■■■□□ 2,41
Dnajc12Q9R022 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Dnajc12Q9R022 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Dnajc12Q9R022 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,4
Dnajc12Q9R022 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Dnajc12Q9R022 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23,4 ms