Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
Cpne8Q9DC53 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Cpne8Q9DC53 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Cpne8Q9DC53 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Cpne8Q9DC53 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Cpne8Q9DC53 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Cpne8Q9DC53 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Cpne8Q9DC53 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
Cpne8Q9DC53 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Cpne8Q9DC53 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Cpne8Q9DC53 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Cpne8Q9DC53 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Cpne8Q9DC53 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
Cpne8Q9DC53 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Cpne8Q9DC53 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
Cpne8Q9DC53 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Cpne8Q9DC53 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Cpne8Q9DC53 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Cpne8Q9DC53 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Cpne8Q9DC53 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Cpne8Q9DC53 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Cpne8Q9DC53 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cpne8Q9DC53 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Cpne8Q9DC53 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Cpne8Q9DC53 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Cpne8Q9DC53 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Cpne8Q9DC53 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
Cpne8Q9DC53 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Cpne8Q9DC53 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Cpne8Q9DC53 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
Cpne8Q9DC53 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Cpne8Q9DC53 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Cpne8Q9DC53 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Cpne8Q9DC53 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Cpne8Q9DC53 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Cpne8Q9DC53 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Cpne8Q9DC53 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Cpne8Q9DC53 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Cpne8Q9DC53 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Cpne8Q9DC53 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Cpne8Q9DC53 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Cpne8Q9DC53 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Cpne8Q9DC53 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Cpne8Q9DC53 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Cpne8Q9DC53 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Cpne8Q9DC53 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Cpne8Q9DC53 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Cpne8Q9DC53 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Cpne8Q9DC53 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Cpne8Q9DC53 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Cpne8Q9DC53 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Cpne8Q9DC53 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Cpne8Q9DC53 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Cpne8Q9DC53 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Cpne8Q9DC53 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Cpne8Q9DC53 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Cpne8Q9DC53 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cpne8Q9DC53 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cpne8Q9DC53 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Cpne8Q9DC53 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Cpne8Q9DC53 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Cpne8Q9DC53 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Cpne8Q9DC53 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cpne8Q9DC53 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cpne8Q9DC53 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cpne8Q9DC53 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cpne8Q9DC53 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cpne8Q9DC53 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cpne8Q9DC53 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cpne8Q9DC53 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cpne8Q9DC53 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cpne8Q9DC53 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Cpne8Q9DC53 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cpne8Q9DC53 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cpne8Q9DC53 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cpne8Q9DC53 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cpne8Q9DC53 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cpne8Q9DC53 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Cpne8Q9DC53 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cpne8Q9DC53 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cpne8Q9DC53 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cpne8Q9DC53 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cpne8Q9DC53 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cpne8Q9DC53 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cpne8Q9DC53 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cpne8Q9DC53 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cpne8Q9DC53 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cpne8Q9DC53 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cpne8Q9DC53 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cpne8Q9DC53 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cpne8Q9DC53 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cpne8Q9DC53 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cpne8Q9DC53 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cpne8Q9DC53 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cpne8Q9DC53 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cpne8Q9DC53 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cpne8Q9DC53 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cpne8Q9DC53 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cpne8Q9DC53 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cpne8Q9DC53 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms