Protein–RNA interactions for Protein: O35345

Kpna6, Importin subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna6O35345 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42.75■■■■■ 4.43
Kpna6O35345 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
Kpna6O35345 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Kpna6O35345 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
Kpna6O35345 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
Kpna6O35345 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
Kpna6O35345 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Kpna6O35345 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Kpna6O35345 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Kpna6O35345 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Kpna6O35345 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
Kpna6O35345 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Kpna6O35345 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Kpna6O35345 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Kpna6O35345 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Kpna6O35345 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
Kpna6O35345 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Kpna6O35345 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Kpna6O35345 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Kpna6O35345 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Kpna6O35345 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Kpna6O35345 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Kpna6O35345 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Kpna6O35345 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Kpna6O35345 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Kpna6O35345 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Kpna6O35345 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Kpna6O35345 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Kpna6O35345 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
Kpna6O35345 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Kpna6O35345 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Kpna6O35345 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Kpna6O35345 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Kpna6O35345 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Kpna6O35345 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Kpna6O35345 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Kpna6O35345 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Kpna6O35345 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
Kpna6O35345 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Kpna6O35345 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
Kpna6O35345 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Kpna6O35345 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Kpna6O35345 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Kpna6O35345 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Kpna6O35345 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
Kpna6O35345 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Kpna6O35345 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Kpna6O35345 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Kpna6O35345 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
Kpna6O35345 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Kpna6O35345 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Kpna6O35345 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Kpna6O35345 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Kpna6O35345 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Kpna6O35345 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Kpna6O35345 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Kpna6O35345 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Kpna6O35345 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Kpna6O35345 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Kpna6O35345 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Kpna6O35345 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Kpna6O35345 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Kpna6O35345 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Kpna6O35345 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Kpna6O35345 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Kpna6O35345 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Kpna6O35345 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Kpna6O35345 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Kpna6O35345 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Kpna6O35345 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Kpna6O35345 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
Kpna6O35345 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
Kpna6O35345 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Kpna6O35345 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Kpna6O35345 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Kpna6O35345 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Kpna6O35345 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Kpna6O35345 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Kpna6O35345 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Kpna6O35345 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Kpna6O35345 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Kpna6O35345 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
Kpna6O35345 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Kpna6O35345 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Kpna6O35345 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Kpna6O35345 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Kpna6O35345 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Kpna6O35345 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Kpna6O35345 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Kpna6O35345 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Kpna6O35345 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
Kpna6O35345 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Kpna6O35345 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Kpna6O35345 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Kpna6O35345 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Kpna6O35345 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
Kpna6O35345 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Kpna6O35345 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Kpna6O35345 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Kpna6O35345 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms