RNA–Protein interactions for RNA: YOR367W

SCP1, Transcript of Component of yeast cortical actin cytoskeleton, yeast

Gene SCP1, Length 603 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SCP1	YOR367W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	4.29	□□□□□ -1.72
SCP1	YOR367W	APS1	P35181	156 aa		4.29	□□□□□ -1.72
SCP1	YOR367W	SMP1	P38128	452 aa		4.29	□□□□□ -1.72
SCP1	YOR367W	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	4.29	□□□□□ -1.72
SCP1	YOR367W	RRT13	P40042	185 aa		4.29	□□□□□ -1.72
SCP1	YOR367W	YPI1	P43587	155 aa		4.29	□□□□□ -1.72
SCP1	YOR367W	FAR7	P43592	221 aa		4.29	□□□□□ -1.72
SCP1	YOR367W	GTR2	P53290	341 aa		4.29	□□□□□ -1.72
SCP1	YOR367W	RTC4	P53850	401 aa		4.29	□□□□□ -1.72
SCP1	YOR367W	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	4.29	□□□□□ -1.72
SCP1	YOR367W	NNT1	Q05874	261 aa		4.29	□□□□□ -1.72
SCP1	YOR367W	YPL229W	Q99395	206 aa		4.29	□□□□□ -1.72
SCP1	YOR367W	PUT1	P09368	476 aa		4.28	□□□□□ -1.72
SCP1	YOR367W	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.28	□□□□□ -1.72	not detected
SCP1	YOR367W	OAC1	P32332	324 aa		4.28	□□□□□ -1.72
SCP1	YOR367W	SWD3	P38123	315 aa		4.28	□□□□□ -1.72
SCP1	YOR367W	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.72
SCP1	YOR367W	AME1	P38313	324 aa		4.28	□□□□□ -1.72
SCP1	YOR367W	ARN2	P38724	620 aa		4.28	□□□□□ -1.72
SCP1	YOR367W	ECM14	P38836	430 aa		4.28	□□□□□ -1.72
SCP1	YOR367W	YER121W	P40076	114 aa		4.28	□□□□□ -1.72
SCP1	YOR367W	YGL034C	P53186	121 aa		4.28	□□□□□ -1.72
SCP1	YOR367W	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.72
SCP1	YOR367W	NRK1	P53915	240 aa		4.28	□□□□□ -1.72
SCP1	YOR367W	YPS3	Q12303	508 aa		4.28	□□□□□ -1.72
SCP1	YOR367W	AGC1	Q12482	902 aa		4.28	□□□□□ -1.72
SCP1	YOR367W	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
SCP1	YOR367W	YHL044W	P38727	235 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SCP1	YOR367W	SYS1	P41544	203 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SCP1	YOR367W	YGR018C	P53211	109 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SCP1	YOR367W	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
SCP1	YOR367W	ECM19	Q06011	112 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SCP1	YOR367W	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
SCP1	YOR367W	TLG2	Q08144	397 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SCP1	YOR367W	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
SCP1	YOR367W	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
SCP1	YOR367W	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
SCP1	YOR367W	ECM34	P38728	170 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SCP1	YOR367W	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
SCP1	YOR367W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
SCP1	YOR367W	ATG5	Q12380	294 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SCP1	YOR367W	YAL067W-A	Q8TGK6	75 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SCP1	YOR367W	CKA2	P19454	339 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SCP1	YOR367W	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
SCP1	YOR367W	YER189W	P40104	122 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SCP1	YOR367W	PRM8	P53174	237 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SCP1	YOR367W	TVP15	Q03860	143 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SCP1	YOR367W	MSA1	Q08471	629 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SCP1	YOR367W	MDM32	Q12171	622 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SCP1	YOR367W	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
SCP1	YOR367W	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
SCP1	YOR367W	TEM1	P38987	245 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SCP1	YOR367W	YKE4	P40544	346 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SCP1	YOR367W	CAT5	P41735	233 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SCP1	YOR367W	YJL028W	P47062	111 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SCP1	YOR367W	UFD1	P53044	361 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SCP1	YOR367W	JAC1	P53193	184 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SCP1	YOR367W	ERV29	P53337	310 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SCP1	YOR367W	DID2	P69771	204 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SCP1	YOR367W	YPL039W	Q03080	316 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SCP1	YOR367W	GRX8	Q05926	109 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SCP1	YOR367W	YLR036C	Q07986	203 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SCP1	YOR367W	YPR011C	Q12251	326 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SCP1	YOR367W	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
SCP1	YOR367W	MRS1	P07266	363 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SCP1	YOR367W	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
SCP1	YOR367W	MGT1	P26188	188 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SCP1	YOR367W	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
SCP1	YOR367W	FIG1	P38224	298 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SCP1	YOR367W	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
SCP1	YOR367W	UFE1	P41834	346 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SCP1	YOR367W	CAX4	P53223	239 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SCP1	YOR367W	ARO80	Q04052	950 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SCP1	YOR367W	TIM22	Q12328	207 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SCP1	YOR367W	SWI1	P09547	1314 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SCP1	YOR367W	CPT1	P17898	393 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SCP1	YOR367W	RPB9	P27999	122 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SCP1	YOR367W	ECM13	P38195	257 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SCP1	YOR367W	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SCP1	YOR367W	ABF2	Q02486	183 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SCP1	YOR367W	MRPS16	Q02608	121 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SCP1	YOR367W	PEX12	Q04370	399 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SCP1	YOR367W	EMI1	Q04406	187 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SCP1	YOR367W	YML096W	Q04489	525 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SCP1	YOR367W	SLD7	Q08457	257 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SCP1	YOR367W	YDL211C	Q12121	372 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SCP1	YOR367W	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SCP1	YOR367W	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SCP1	YOR367W	ACP1	P32463	125 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SCP1	YOR367W	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SCP1	YOR367W	PGU1	P47180	361 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SCP1	YOR367W	RSM27	P53305	110 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SCP1	YOR367W	OSH6	Q02201	448 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SCP1	YOR367W	MCH1	Q07376	486 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SCP1	YOR367W	YOL024W	Q08172	172 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SCP1	YOR367W	EMP46	Q12396	444 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SCP1	YOR367W	YOL085C	Q99345	113 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SCP1	YOR367W	IGO2	Q9P305	131 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SCP1	YOR367W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SCP1	YOR367W	YLR462W	O13556	202 aa		4.2	□□□□□ -1.74

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