RNA–Protein interactions for RNA: YOL093W

TRM10, Transcript of tRNA methyltransferase, yeast

Gene TRM10, Length 882 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRM10	YOL093W	RCE1	Q03530	315 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	MSS11	Q03825	758 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	ATG33	Q06485	197 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	FRE3	Q08905	711 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	MCT1	Q12283	360 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	SCM3	Q12334	223 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	ORT1	Q12375	292 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	CDC23	P16522	626 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	HXT2	P23585	541 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	PRE4	P30657	266 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	DBF20	P32328	564 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	YBL010C	P32788	280 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	GPI16	P38875	610 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	PAM16	P42949	149 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	CTK2	P46962	323 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	GPG1	P53130	126 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	POP6	P53218	158 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	YLR283W	Q05867	314 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	YLR352W	Q06479	807 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	ASR1	Q06834	288 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	RFU1	Q08003	200 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	FSH3	Q99369	266 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	URA3	P03962	267 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	HEM4	P06174	275 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	CHO1	P08456	276 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	PET54	P10834	293 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	GET2	P40056	285 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	PIG2	P40187	538 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	AVT7	P40501	490 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	YIL029C	P40538	142 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	MOB2	P43563	287 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	BXI1	P48558	297 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	SIP18	P50263	79 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	AVT4	P50944	713 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	ACS1	Q01574	713 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	MRPL35	Q06678	367 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	YLR031W	Q07978	186 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	PRM4	Q12498	284 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	SPS2	P08459	502 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	RPS23B	P0CX30	145 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	URA6	P15700	204 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	CLB6	P32943	380 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	NAT2	P37293	288 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	YHR122W	P38829	231 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	CAT5	P41735	233 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	CIN2	P46670	268 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	YGL159W	P53110	370 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	RNH201	P53942	307 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	MRPL13	Q02204	264 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	YPL067C	Q02754	198 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	YPR098C	Q06089	161 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	KEI1	Q06346	221 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	INP53	Q12271	1107 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	ISA2	Q12425	185 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	SGA1	P08019	549 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	MCH2	P36032	473 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	LAG1	P38703	411 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	SEN34	P39707	275 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	YER084W	P40057	128 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	SWM2	P40342	146 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	YKE4	P40544	346 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	YIP4	P53093	235 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	YGR042W	P53227	271 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	RSM27	P53305	110 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	MRPS16	Q02608	121 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	YDR391C	Q04170	232 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	PHO92	Q06390	306 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	FIT3	Q08907	204 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	USV1	Q12132	391 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	RDI1	Q12434	202 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	ERP4	Q12450	207 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	ODC2	Q99297	307 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TRM10	YOL093W	PET122	P10355	254 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
TRM10	YOL093W	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 62.4 ms