RNA–Protein interactions for RNA: YLR048W

RPS0B, Transcript of Protein component of the small (40S) ribosomal subunit, yeast

Gene RPS0B, Length 759 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS0B	YLR048W	YDR248C	Q03786	193 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	NNT1	Q05874	261 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	ECM19	Q06011	112 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	MSA1	Q08471	629 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	YPS3	Q12303	508 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	YAL067W-A	Q8TGK6	75 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	YER121W	P40076	114 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	ILM1	P47155	203 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	YGR067C	P53243	804 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	YNL140C	P53910	189 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	ATG5	Q12380	294 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	PUT1	P09368	476 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	ECM34	P38728	170 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	ECM14	P38836	430 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	FAR7	P43592	221 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	PGU1	P47180	361 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	NRK1	P53915	240 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	YML122C	Q03207	126 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	INM2	Q05533	292 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	AGC1	Q12482	902 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	QCR2	P07257	368 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.73	□□□□□ -1.81	not detected
RPS0B	YLR048W	RPB9	P27999	122 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	APS1	P35181	156 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	YHL044W	P38727	235 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	CAX4	P53223	239 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	YLR460C	P54007	376 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	MRPS16	Q02608	121 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	YPL039W	Q03080	316 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	TLG2	Q08144	397 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	YPR011C	Q12251	326 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	SWI1	P09547	1314 aa		3.72	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	AME1	P38313	324 aa		3.72	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	YER189W	P40104	122 aa		3.72	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	CAT5	P41735	233 aa		3.72	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	YJL028W	P47062	111 aa		3.72	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	UFD1	P53044	361 aa		3.72	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	RTC4	P53850	401 aa		3.72	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	YML108W	Q03759	105 aa		3.72	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	TVP15	Q03860	143 aa		3.72	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	YML096W	Q04489	525 aa		3.72	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	TIM22	Q12328	207 aa		3.72	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	YOL085C	Q99345	113 aa		3.72	□□□□□ -1.81
RPS0B	YLR048W	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	CPT1	P17898	393 aa		3.71	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	CKA2	P19454	339 aa		3.71	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	YKE4	P40544	346 aa		3.71	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	UFE1	P41834	346 aa		3.71	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	3.71	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	ERV29	P53337	310 aa		3.71	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	OSH6	Q02201	448 aa		3.71	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	EMI1	Q04406	187 aa		3.71	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	GRX8	Q05926	109 aa		3.71	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	YDL211C	Q12121	372 aa		3.71	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	MDM32	Q12171	622 aa		3.71	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	YHR139C-A	O13536	103 aa		3.7	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	MRS1	P07266	363 aa		3.7	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	COX10	P21592	462 aa		3.7	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	3.7	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	TEM1	P38987	245 aa		3.7	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	PET191	Q02772	108 aa		3.7	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	ARO80	Q04052	950 aa		3.7	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	MCH1	Q07376	486 aa		3.7	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	SLD7	Q08457	257 aa		3.7	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		3.7	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	FLO11	P08640	1367 aa		3.7	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		3.69	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	ECM13	P38195	257 aa		3.69	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	3.69	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	PRM8	P53174	237 aa		3.69	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	YLR036C	Q07986	203 aa		3.69	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	EMP46	Q12396	444 aa		3.69	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	YLR462W	O13556	202 aa		3.68	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	FIG1	P38224	298 aa		3.68	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	YEL075C	P39972	122 aa		3.68	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	AIM25	P47140	327 aa		3.68	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	JAC1	P53193	184 aa		3.68	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	PST1	Q12355	444 aa		3.68	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	IGO2	Q9P305	131 aa		3.68	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		3.68	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	YPT53	P36019	220 aa		3.67	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	SPL2	P38839	148 aa		3.67	□□□□□ -1.82

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