RNA–Protein interactions for RNA: YHR160C

PEX18, Transcript of Peroxin, yeast

Gene PEX18, Length 852 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PEX18	YHR160C	MDM32	Q12171	622 aa		2.34	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	2.34	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	PCL9	Q12477	304 aa		2.34	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		2.34	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	2.34	□□□□□ -2.03
PEX18	YHR160C	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	2.33	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	KSS1	P14681	368 aa		2.33	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	PBN1	P25580	416 aa		2.33	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	NTG1	P31378	399 aa		2.33	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	YBR241C	P38142	488 aa		2.33	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.33	□□□□□ -2.04	not detected
PEX18	YHR160C	BIG1	P38813	335 aa		2.33	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	TDA11	P38854	504 aa		2.33	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	PEX22	P39718	180 aa		2.33	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	ECO1	P43605	281 aa		2.33	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	YFR054C	P43622	192 aa		2.33	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	RPE1	P46969	238 aa		2.33	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	APS3	P47064	194 aa		2.33	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	RMR1	P53060	241 aa		2.33	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	COS6	P53344	381 aa		2.33	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	YNL095C	P53932	642 aa		2.33	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	NCE101	Q02820	53 aa		2.33	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	2.33	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	MIX14	Q04341	121 aa		2.33	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	PEX12	Q04370	399 aa		2.33	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	YDR286C	Q05530	114 aa		2.33	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	MSC3	Q05812	728 aa		2.33	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	SPO77	Q06134	477 aa		2.33	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	YDL211C	Q12121	372 aa		2.33	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	YOR342C	Q12182	319 aa		2.33	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	MHF2	Q3E829	80 aa		2.33	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	2.32	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	RPL43B	P0CX26	92 aa		2.32	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	2.32	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	2.32	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	2.32	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	2.32	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	YAK1	P14680	807 aa		2.32	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	CTA1	P15202	515 aa		2.32	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	ERD1	P16151	362 aa		2.32	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.32	□□□□□ -2.04	not detected
PEX18	YHR160C	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	2.32	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	2.32	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	NSG1	P38837	291 aa		2.32	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	RCY1	P39531	840 aa		2.32	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	2.32	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	YGR201C	P42936	225 aa		2.32	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	2.32	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	2.32	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	YGR016W	P53209	190 aa		2.32	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	2.32	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	RNH202	Q05635	350 aa		2.32	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	2.32	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	2.32	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	PEX27	Q08580	376 aa		2.32	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	PSY3	Q12318	242 aa		2.32	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	MRX4	Q12467	430 aa		2.32	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	2.32	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	YOS9	Q99220	542 aa		2.32	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	FLO9	P39712	1322 aa		2.32	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	2.31	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	2.31	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	2.31	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	SAG1	P20840	650 aa		2.31	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	SCO1	P23833	295 aa		2.31	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	GRR1	P24814	1151 aa		2.31	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	RAD51	P25454	400 aa		2.31	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	TPO5	P36029	618 aa		2.31	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	SMP1	P38128	452 aa		2.31	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	ALP1	P38971	573 aa		2.31	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	NAS2	P40555	220 aa		2.31	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	CIN2	P46670	268 aa		2.31	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	EFM3	P47163	339 aa		2.31	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	NUP57	P48837	541 aa		2.31	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	SHE4	P51534	789 aa		2.31	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	2.31	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	2.31	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	RRN5	Q02983	363 aa		2.31	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	KRE28	Q04431	385 aa		2.31	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	DCR2	Q05924	578 aa		2.31	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	YLR446W	Q06204	433 aa		2.31	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	YPR195C	Q06594	109 aa		2.31	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	2.31	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	2.31	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	2.31	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	YOR214C	Q12282	236 aa		2.31	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	YLR126C	Q12288	251 aa		2.31	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	SFM1	Q12314	213 aa		2.31	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	YOR032W-A	Q8TGS1	66 aa		2.31	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	YOL085C	Q99345	113 aa		2.31	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		2.3	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	YOL163W	P0CF20	169 aa		2.3	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		2.3	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	SNF4	P12904	322 aa		2.3	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	ERD2	P18414	219 aa		2.3	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	YPK2	P18961	677 aa		2.3	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	HSP30	P25619	332 aa		2.3	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	UBC8	P28263	218 aa		2.3	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	ITR2	P30606	609 aa		2.3	□□□□□ -2.04
PEX18	YHR160C	MSK1	P32048	576 aa		2.3	□□□□□ -2.04

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