RNA–Protein interactions for RNA: YHL009W-B

YHL009W-B, Transcript of Retrotransposon TYA Gag and TYB Pol genes, yeastyeast

Gene YHL009W-B, Length 5,409 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHL009W-BYHL009W-B COX8P04039 78 aa-0.79□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B CDC23P16522 626 aa-0.79□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B CTM1P38818 585 aa-0.79□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B YHR125WP38831 101 aa-0.79□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B SPO73P40031 143 aa-0.79□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B IDP2P41939 412 aa-0.79□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B YJR111CP47148 283 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B ASN2P49090 572 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B MPA43P53583 542 aaPredicted RBP-0.79□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B ARE2P53629 642 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B UBX4P54730 416 aa-0.79□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B RPA49Q01080 415 aaPredicted RBP-0.79□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B MRPS8Q03799 155 aa-0.79□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B SNF8Q12483 233 aa-0.79□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B MTR10Q99189 972 aa-0.79□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B MSW1P04803 379 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B YLR156WP0CE96 114 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B YLR159WP0CE97 114 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B YLR161WP0CE98 114 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B CKA1P15790 372 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B ISY1P21374 235 aaPredicted RBP-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B APA2P22108 325 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B CDC10P25342 322 aaKnown RBP-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B PPA2P28239 310 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B SAC6P32599 642 aaKnown RBP-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B ASC1P38011 319 aaKnown RBP-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B YSW1P38280 609 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B SRP14P38985 146 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B MST28P39552 234 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B YEL014CP39999 101 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B DJP1P40564 432 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B YJL009WP47078 108 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B MIC26P50087 233 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B AIF1P52923 378 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B MND1P53102 219 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B MST27P53176 234 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B BRP1P53194 125 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B YNL046WP53956 172 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B YPR172WQ06608 200 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B TAF10Q12030 206 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B VIK1Q12045 647 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B SLM3Q12093 417 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B COX3P00420 269 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B HAP3P13434 144 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B MDH1P17505 334 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.8□□□□□ -2.54not detected
YHL009W-BYHL009W-B MSK1P32048 576 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B YUH1P35127 236 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B NUP133P36161 1157 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B FIG1P38224 298 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B TIF34P40217 347 aaKnown RBP-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B COA1P40452 197 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B SFH5P47008 294 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B YGR016WP53209 190 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B JJJ1P53863 590 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B VPS71Q03433 280 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B YPR098CQ06089 161 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B YEH1Q07804 573 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B DGA1Q08650 418 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B YPL257WQ08974 193 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B PRP46Q12417 451 aaPredicted RBP-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B ERP4Q12450 207 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B SEC39Q12745 709 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B YOR034C-AQ3E735 80 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B YHR213W-BQ8TGK1 99 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B MDM12Q92328 271 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B IZH4Q99393 312 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B STH1P32597 1359 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B ARF1P11076 181 aaKnown RBP-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B RPC82P32349 654 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B CAB3P36076 571 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B MRPL40P36534 297 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B ECM31P38122 312 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B YBL044WP38194 122 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B GRE3P38715 327 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.8□□□□□ -2.54not detected
YHL009W-BYHL009W-B IPT1P38954 527 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B YER134CP40081 178 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B ABM1P47146 123 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B TAF6P53040 516 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B LST7P53237 242 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B RPT4P53549 437 aaKnown RBP-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B OSH6Q02201 448 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B RRP6Q12149 733 aaKnown RBP-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B CEX1Q12453 761 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B YDL007C-AQ2V2Q0 85 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B TDH3P00359 332 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.8□□□□□ -2.54not detected
YHL009W-BYHL009W-B COX5BP00425 151 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B GPA2P10823 449 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B FAR1P21268 830 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B MEK1P24719 497 aaPredicted RBP-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B GSP2P32836 220 aaKnown RBP-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B BLI1P35727 113 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B YHR127WP38833 243 aaKnown RBP-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B VPS45P38932 577 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B GET1P53192 235 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B EFM6P53970 246 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B MDM36Q06820 579 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B MCP1Q12106 302 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B RIB3Q99258 208 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B ODC2Q99297 307 aa-0.8□□□□□ -2.54
YHL009W-BYHL009W-B CDC8P00572 216 aa-0.81□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 21.8 ms