RNA–Protein interactions for RNA: YFL039C

ACT1, Transcript of Actin, yeast

Gene ACT1, Length 1,128 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ACT1	YFL039C	MRP49	P32388	137 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	YKL097C	P34245	136 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	FRE2	P36033	711 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	MST28	P39552	234 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	TSC11	P40061	1430 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	GLC8	P41818	229 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	UFD1	P53044	361 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	YGL082W	P53155	381 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	PCP1	P53259	346 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	BOR1	P53838	576 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	SPR6	Q01684	191 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	YMR027W	Q04371	470 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	YMR253C	Q04835	414 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	SEI1	Q06058	285 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	CNL1	Q06333	122 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	ORT1	Q12375	292 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	PSF1	Q12488	208 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	TRM732	Q03496	1420 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	POM152	P39685	1337 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	CDC7	P06243	507 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	MRS1	P07266	363 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	LSB5	P25369	354 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	YBR137W	P38276	179 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	COS8	P38723	381 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	YIL067C	P40514	678 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	BXI1	P48558	297 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	HSK3	P69852	69 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	YMR010W	Q03687	405 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	YET2	Q04210	160 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	TRM12	Q04235	462 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	HRD1	Q08109	551 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	RFM1	Q12192	310 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	REP1	P03871	373 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	CPR3	P25719	182 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	BUB3	P26449	341 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	HYM1	P32464	399 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	PDC2	P32896	925 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	YPC1	P38298	316 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	GEP4	P38812	185 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	AIM2	P39721	246 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	SER33	P40510	469 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	HAC1	P41546	238 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	BIR1	P47134	954 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	COQ5	P49017	307 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	YIP1	P53039	248 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	YPL113C	Q02961	396 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	YDR124W	Q04608	324 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	TAF9	Q05027	157 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	GAT3	Q07928	141 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	HRT3	Q12347	344 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	TRM10	Q12400	293 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	YCR007C	P25354	239 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.05	□□□□□ -1.76	not detected
ACT1	YFL039C	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	YBR220C	P38318	560 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	YHK8	P38776	514 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	SIM1	P40472	476 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	DFG10	P40526	253 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	YIL029C	P40538	142 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	IKS1	P47042	667 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	YJR015W	P47090	510 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	AVT4	P50944	713 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	YPS5	P53057	165 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	TPN1	P53099	579 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	VHT1	P53241	593 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	YNL184C	P53876	108 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	SWS2	P53937	143 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	BET5	Q03630	159 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	FMN1	Q03778	218 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	GPI17	Q04080	534 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	COQ10	Q08058	207 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	GEP5	Q12393	293 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	COX5A	P00424	153 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	DDI2	P0CH63	225 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	DDI3	P0CH64	225 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	PEX34	P25584	144 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	CDC50	P25656	391 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	AEP1	P32493	518 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ACT1	YFL039C	SFC1	P33303	322 aa		4.04	□□□□□ -1.76

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