RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553948.1

TTC7B-202, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 7B, humanhuman

TSL 5

Gene TTC7B, Length 630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7B-202ENST00000553948 TRAPPC3O43617 180 aa35.35■■■■□ 3.25
TTC7B-202ENST00000553948 FGFR3P22607 806 aa35.35■■■■□ 3.25
TTC7B-202ENST00000553948 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP35.35■■■■□ 3.25
TTC7B-202ENST00000553948 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP35.35■■■■□ 3.25
TTC7B-202ENST00000553948 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP35.35■■■■□ 3.25
TTC7B-202ENST00000553948 REEP2Q9BRK0 252 aa35.35■■■■□ 3.25
TTC7B-202ENST00000553948 BACH2Q9BYV9 841 aa35.35■■■■□ 3.25
TTC7B-202ENST00000553948 PRKD2Q9BZL6 878 aa35.35■■■■□ 3.25
TTC7B-202ENST00000553948 ZMYND10O75800 440 aa35.34■■■■□ 3.25
TTC7B-202ENST00000553948 KCNE1P15382 129 aa35.34■■■■□ 3.25
TTC7B-202ENST00000553948 PLCG1P19174 1290 aa35.34■■■■□ 3.25
TTC7B-202ENST00000553948 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP35.34■■■■□ 3.25
TTC7B-202ENST00000553948 NCKAP1LP55160 1127 aa35.34■■■■□ 3.25
TTC7B-202ENST00000553948 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP35.34■■■■□ 3.25
TTC7B-202ENST00000553948 KARSQ15046 597 aaKnown RBP35.34■■■■□ 3.25
TTC7B-202ENST00000553948 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP35.34■■■■□ 3.25
TTC7B-202ENST00000553948 SMOC2Q9H3U7 446 aa35.34■■■■□ 3.25
TTC7B-202ENST00000553948 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa35.34■■■■□ 3.25
TTC7B-202ENST00000553948 CNTN3Q9P232 1028 aa35.34■■■■□ 3.25
TTC7B-202ENST00000553948 FBXW11Q9UKB1 542 aa35.34■■■■□ 3.25
TTC7B-202ENST00000553948 CD300LGQ6UXG3 332 aa35.33■■■■□ 3.25
TTC7B-202ENST00000553948 HAUS6Q7Z4H7 955 aa35.33■■■■□ 3.25
TTC7B-202ENST00000553948 LRRC15Q8TF66 581 aa35.33■■■■□ 3.25
TTC7B-202ENST00000553948 CLDN3O15551 220 aa35.32■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP35.32■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP35.32■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 MCM6Q14566 821 aa35.32■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 LIN9Q5TKA1 542 aa35.32■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 C3orf58Q8NDZ4 430 aa35.32■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 RAD54LQ92698 747 aa35.32■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 BICD1Q96G01 975 aa35.32■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 CLIC4Q9Y696 253 aa35.32■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa35.31■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 ADAM12O43184 909 aa35.31■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP35.31■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 FAM13AO94988 1023 aa35.31■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 KRT18P05783 430 aaKnown RBP35.31■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 MCL1Q07820 350 aa35.31■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 MYCT1Q8N699 235 aa35.31■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 MTRRQ9UBK8 725 aa35.31■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 I3L4J1 428 aa35.3■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 PODXLO00592 558 aa35.3■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 SYT1P21579 422 aa35.3■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 SCP2P22307 547 aa35.3■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 TKTP29401 623 aaKnown RBP35.3■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 OR1D2P34982 312 aa35.3■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 SEZ6Q53EL9 994 aa35.3■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP35.3■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 CCSER1Q9C0I3 900 aa35.3■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 KCNK12Q9HB15 430 aa35.3■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 PARVGQ9HBI0 331 aa35.3■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 KMT2EQ8IZD2 1858 aa35.29■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP35.29■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 RPL9P32969 192 aaKnown RBP35.29■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 BRCC3P46736 316 aa35.29■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 TDGQ13569 410 aa35.29■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 RAB33AQ14088 237 aa35.29■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 ANKS3Q6ZW76 656 aa35.29■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 KCNN1Q92952 543 aa35.29■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 IGSF9Q9P2J2 1179 aa35.29■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP35.28■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP35.28■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 ZNF131P52739 623 aa35.28■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 RESTQ13127 1097 aa35.28■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 PTPAQ15257 358 aa35.28■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 SLC10A6Q3KNW5 377 aa35.28■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 PPM1LQ5SGD2 360 aa35.28■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 IER5LQ5T953 404 aa35.28■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP35.28■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP35.28■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 PRRX2Q99811 253 aa35.28■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 BACE2Q9Y5Z0 518 aa35.28■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 K7ENM7 598 aa35.27■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 C8AP07357 584 aa35.27■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP35.27■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 LIG4P49917 911 aa35.27■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 VCPP55072 806 aaKnown RBP35.27■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 NHLH1Q02575 133 aa35.27■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 MYADMQ96S97 322 aa35.27■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 ZHX3Q9H4I2 956 aa35.27■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP35.27■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 EPS15L1Q9UBC2 864 aa35.27■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 TBX20Q9UMR3 447 aa35.27■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 CDY1Q9Y6F8 540 aa35.27■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 TBCAO75347 108 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 CLTAP09496 248 aa35.26■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP35.26■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 AVPR2P30518 371 aa35.26■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 EPSTI1Q96J88 318 aa35.26■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 HAPLN2Q9GZV7 340 aa35.26■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 NUB1Q9Y5A7 615 aa35.26■■■■□ 3.24
TTC7B-202ENST00000553948 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.23
TTC7B-202ENST00000553948 WDFY4Q6ZS81 3184 aa35.25■■■■□ 3.23
TTC7B-202ENST00000553948 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP35.25■■■■□ 3.23
TTC7B-202ENST00000553948 TRAK2O60296 914 aa35.25■■■■□ 3.23
TTC7B-202ENST00000553948 HOXA9P31269 272 aa35.25■■■■□ 3.23
TTC7B-202ENST00000553948 DDIT3P35638 169 aa35.25■■■■□ 3.23
TTC7B-202ENST00000553948 SPECC1Q5M775 1068 aa35.25■■■■□ 3.23
TTC7B-202ENST00000553948 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP35.25■■■■□ 3.23
TTC7B-202ENST00000553948 FAM173BQ6P4H8 233 aa35.25■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms