RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494037.1

TSPAN7-208, Transcript of tetraspanin 7, humanhuman

TSL 4

Gene TSPAN7, Length 575 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN7-208ENST00000494037 BRCC3P46736 316 aa9.06□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 NASPP49321 788 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 MCL1Q07820 350 aa9.06□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 PSMD5Q16401 504 aa9.06□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 PTPN21Q16825 1174 aa9.06□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 SLC10A6Q3KNW5 377 aa9.06□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 ATAT1Q5SQI0 421 aa9.06□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa9.06□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 SLC39A4Q6P5W5 647 aa9.06□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 HFE2Q6ZVN8 426 aa9.06□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 CEP57Q86XR8 500 aa9.06□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 HSCBQ8IWL3 235 aa9.06□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 GPR65Q8IYL9 337 aa9.06□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 MYCT1Q8N699 235 aa9.06□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 EDAQ92838 391 aa9.06□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 BICD1Q96G01 975 aa9.06□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 ACAP3Q96P50 834 aa9.06□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 CLSTN3Q9BQT9 956 aa9.06□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 ZHX3Q9H4I2 956 aa9.06□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 FNIP2Q9P278 1114 aa9.06□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa9.06□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 TBX20Q9UMR3 447 aa9.06□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 NR2E1Q9Y466 385 aa9.06□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 VPS13AQ96RL7 3174 aa9.05□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 TISP43B9A030 160 aa9.05□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 H0YCG3 227 aa9.05□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 CLDN3O15551 220 aa9.05□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 TRAK2O60296 914 aa9.05□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 FAM189A1O60320 539 aa9.05□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 PIGRP01833 764 aa9.05□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 KRT18P05783 430 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 ASGR2P07307 311 aa9.05□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 FGFR3P22607 806 aa9.05□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 TKTP29401 623 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 DDIT3P35638 169 aa9.05□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP9.05□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 LIG4P49917 911 aa9.05□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 ZXDAP98168 799 aa9.05□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 CREMQ03060 361 aa9.05□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 SPAG1Q07617 926 aa9.05□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 SLC39A14Q15043 492 aa9.05□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 LILRA6Q6PI73 481 aa9.05□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa9.05□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa9.05□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 TRIM67Q6ZTA4 783 aa9.05□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 CCDC149Q6ZUS6 474 aa9.05□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 DYMQ7RTS9 669 aa9.05□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 SFR1Q86XK3 245 aa9.05□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 MAP4K3Q8IVH8 894 aa9.05□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 UROC1Q96N76 676 aa9.05□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 IKZF4Q9H2S9 585 aa9.05□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 SMOC2Q9H3U7 446 aa9.05□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 SLC38A7Q9NVC3 462 aa9.05□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 STK17AQ9UEE5 414 aa9.05□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 KCNG1Q9UIX4 513 aa9.05□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 FBXW11Q9UKB1 542 aa9.05□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 ANK1P16157 1881 aa9.04□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa9.04□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 TMEM221A6NGB7 291 aa9.04□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 MYMKA6NI61 221 aa9.04□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 M0R296 226 aa9.04□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 PAPLNO95428 1278 aa9.04□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 TXLNAP40222 546 aa9.04□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 GTF2BQ00403 316 aa9.04□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 PKP1Q13835 747 aa9.04□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 STK38Q15208 465 aa9.04□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 RRAGBQ5VZM2 374 aa9.04□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 LINC00301Q8NCQ3 95 aa9.04□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 KREMEN2Q8NCW0 462 aa9.04□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 HDAC7Q8WUI4 952 aa9.04□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 DDX12PQ92771 950 aa9.04□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 DNAJC19Q96DA6 116 aa9.04□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 ASIC4Q96FT7 647 aa9.04□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 MTRRQ9UBK8 725 aa9.04□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 CCDC39Q9UFE4 941 aa9.04□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 USTQ9Y2C2 406 aa9.04□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa9.04□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 USP34Q70CQ2 3546 aa9.04□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 CLUHO75153 1309 aa9.04□□□□□ -0.96
TSPAN7-208ENST00000494037 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa9.03□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms