RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000337004.8

PTDSS1-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTDSS1, Length 2,366 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-201ENST00000337004 MCOLN2Q8IZK6 566 aa22.95■■□□□ 1.26
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PTDSS1-201ENST00000337004 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
PTDSS1-201ENST00000337004 AAASQ9NRG9 546 aa22.95■■□□□ 1.26
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PTDSS1-201ENST00000337004 CCDC38Q502W7 563 aa22.94■■□□□ 1.26
PTDSS1-201ENST00000337004 RHBDF2Q6PJF5 856 aa22.94■■□□□ 1.26
PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF677Q86XU0 584 aa22.94■■□□□ 1.26
PTDSS1-201ENST00000337004 RDM1Q8NG50 284 aa22.94■■□□□ 1.26
PTDSS1-201ENST00000337004 DYDC1Q8WWB3 177 aa22.94■■□□□ 1.26
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PTDSS1-201ENST00000337004 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PTDSS1-201ENST00000337004 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
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PTDSS1-201ENST00000337004 GSTA1P08263 222 aa22.94■■□□□ 1.26
PTDSS1-201ENST00000337004 MAP3K10Q02779 954 aa22.94■■□□□ 1.26
PTDSS1-201ENST00000337004 SLC39A4Q6P5W5 647 aa22.94■■□□□ 1.26
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PTDSS1-201ENST00000337004 C1orf112Q9NSG2 853 aa22.94■■□□□ 1.26
PTDSS1-201ENST00000337004 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa22.94■■□□□ 1.26
PTDSS1-201ENST00000337004 ARHGEF16Q5VV41 709 aa22.93■■□□□ 1.26
PTDSS1-201ENST00000337004 CEP170P1Q96L14 293 aa22.93■■□□□ 1.26
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PTDSS1-201ENST00000337004 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
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PTDSS1-201ENST00000337004 BPIFB4P59827 614 aa22.93■■□□□ 1.26
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PTDSS1-201ENST00000337004 BSNDQ8WZ55 320 aa22.93■■□□□ 1.26
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PTDSS1-201ENST00000337004 PXMP2Q9NR77 195 aa22.93■■□□□ 1.26
PTDSS1-201ENST00000337004 LARGE2Q8N3Y3 721 aa22.92■■□□□ 1.26
PTDSS1-201ENST00000337004 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PTDSS1-201ENST00000337004 ELMO3Q96BJ8 720 aa22.92■■□□□ 1.26
PTDSS1-201ENST00000337004 TRAIPQ9BWF2 469 aa22.92■■□□□ 1.26
PTDSS1-201ENST00000337004 DCLK3Q9C098 648 aa22.92■■□□□ 1.26
PTDSS1-201ENST00000337004 MROH7Q68CQ1 1323 aa22.92■■□□□ 1.26
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PTDSS1-201ENST00000337004 RRM1P23921 792 aa22.92■■□□□ 1.26
PTDSS1-201ENST00000337004 CHKAP35790 457 aa22.92■■□□□ 1.26
PTDSS1-201ENST00000337004 NSFP46459 744 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PTDSS1-201ENST00000337004 ITGA8P53708 1063 aa22.92■■□□□ 1.26
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PTDSS1-201ENST00000337004 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.26
PTDSS1-201ENST00000337004 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa22.92■■□□□ 1.26
PTDSS1-201ENST00000337004 NLRX1Q86UT6 975 aa22.92■■□□□ 1.26
PTDSS1-201ENST00000337004 CPA5Q8WXQ8 436 aa22.92■■□□□ 1.26
PTDSS1-201ENST00000337004 ATG4AQ8WYN0 398 aa22.92■■□□□ 1.26
PTDSS1-201ENST00000337004 FAM213AQ9BRX8 229 aa22.92■■□□□ 1.26
PTDSS1-201ENST00000337004 MTFR1LQ9H019 292 aa22.92■■□□□ 1.26
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PTDSS1-201ENST00000337004 ADCY8P40145 1251 aa22.91■■□□□ 1.26
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PTDSS1-201ENST00000337004 SCLT1Q96NL6 688 aa22.91■■□□□ 1.26
PTDSS1-201ENST00000337004 PGAP2Q9UHJ9 254 aa22.91■■□□□ 1.26
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PTDSS1-201ENST00000337004 SLC12A4Q9UP95 1085 aa22.91■■□□□ 1.26
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PTDSS1-201ENST00000337004 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa22.91■■□□□ 1.26
PTDSS1-201ENST00000337004 TMEM120BA0PK00 339 aa22.9■■□□□ 1.26
PTDSS1-201ENST00000337004 THAP12O43422 761 aa22.9■■□□□ 1.26
PTDSS1-201ENST00000337004 CALCAP01258 141 aa22.9■■□□□ 1.26
PTDSS1-201ENST00000337004 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP22.9■■□□□ 1.26
PTDSS1-201ENST00000337004 PTP4A2Q12974 167 aa22.9■■□□□ 1.26
PTDSS1-201ENST00000337004 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
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PTDSS1-201ENST00000337004 XRRA1Q6P2D8 792 aa22.9■■□□□ 1.26
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PTDSS1-201ENST00000337004 LIN9Q5TKA1 542 aa22.89■■□□□ 1.26
PTDSS1-201ENST00000337004 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa22.89■■□□□ 1.26
PTDSS1-201ENST00000337004 MGARPQ8TDB4 240 aa22.89■■□□□ 1.26
PTDSS1-201ENST00000337004 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP22.89■■□□□ 1.26
PTDSS1-201ENST00000337004 MAFGO15525 162 aa22.89■■□□□ 1.25
PTDSS1-201ENST00000337004 SORBS3O60504 671 aa22.89■■□□□ 1.25
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