RNA–Protein interactions for RNA: tF(GAA)G

tF(GAA)G, Transcript of Phenylalanine tRNA (tRNA-Phe), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tF(GAA)G, Length 73 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tF(GAA)GtF(GAA)G SRB4P32569 687 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G SEC17P32602 292 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G REC114P32841 428 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G MRT4P33201 236 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G SHE1P38200 338 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G RKM3P38222 552 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G MIC12P38341 106 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G STP2P38704 541 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G PAC2P39937 518 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G SIT1P39980 628 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G SCC4P40090 624 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G AIM19P40502 157 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G FMP32P43557 207 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G YFL015CP43578 164 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G YFL012WP43580 148 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G LOH1P47055 219 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G YJL028WP47062 111 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G EFM3P47163 339 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G NUP57P48837 541 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G RPL9BP51401 191 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G YPT32P51996 222 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G ERV29P53337 310 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G ARC35P53731 342 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G YNR048WP53740 393 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G GOR1P53839 350 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G APM1Q00776 475 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G YMR102CQ03177 834 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G RAV2Q03956 351 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G HPT1Q04178 221 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G LPP1Q04396 274 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G YLR173WQ06247 608 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G PBP4Q07362 185 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G RFU1Q08003 200 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G LDS2Q08218 356 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G RKM1Q08961 583 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G RKI1Q12189 258 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G YGK3Q12222 375 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G INP53Q12271 1107 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G MDY2Q12285 212 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G APC2Q12440 853 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G YCR075W-AQ3E830 75 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G TY1A-PR3Q6Q5H1 440 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G TY1A-OLQ92392 440 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G COX5BP00425 151 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G Q0255P03881 472 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G GAL1P04385 528 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G HTA1P04911 132 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G HTA2P04912 132 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G RPL22AP05749 121 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G DST1P07273 309 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G MER1P16523 270 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G PRE9P23638 258 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G PCL1P24867 279 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G VMA3P25515 160 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G ATG22P25568 528 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G PHO91P27514 894 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G RPS1AP33442 255 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G JEN1P36035 616 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G BYE1P36106 594 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G ECM4P36156 370 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G JNM1P36224 373 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G NAT2P37293 288 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G YBR063CP38083 404 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G IMD2P38697 523 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G CTF8P38877 133 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G POP2P39008 433 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G MST28P39552 234 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G RGI1P40043 161 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G VHS2P40463 436 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G NAS2P40555 220 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G MMM1P41800 426 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G ARC1P46672 376 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G SKP1P52286 194 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G MIG2P53035 382 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G RTA1P53047 317 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G YGL262WP53054 175 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G NIF3P53081 288 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G MST27P53176 234 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G YGR219WP53307 113 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G CPD1P53314 239 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G YNR071CP53757 342 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G MRPL22P53881 309 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G RRN5Q02983 363 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G YLR345WQ06137 509 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G VPS74Q06385 345 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G YEH2Q07950 538 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G THP1Q08231 455 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G TY1A-GR1Q12085 440 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G RPN5Q12250 445 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G RBD2Q12270 262 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G SFM1Q12314 213 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G MHF2Q3E829 80 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)GtF(GAA)G YPR096CO13587 100 aa0.34□□□□□ -2.36
tF(GAA)GtF(GAA)G ATP4P05626 244 aa0.34□□□□□ -2.36
tF(GAA)GtF(GAA)G HTS1P07263 546 aaKnown RBP0.34□□□□□ -2.36
tF(GAA)GtF(GAA)G YCR043CP25361 127 aa0.34□□□□□ -2.36
tF(GAA)GtF(GAA)G KRR1P25586 316 aaPredicted RBP0.34□□□□□ -2.36
tF(GAA)GtF(GAA)G AAD3P25612 363 aa0.34□□□□□ -2.36
tF(GAA)GtF(GAA)G SNC1P31109 117 aa0.34□□□□□ -2.36
tF(GAA)GtF(GAA)G DPH5P32469 300 aaPredicted RBP0.34□□□□□ -2.36
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