RNA–Protein interactions for RNA: tF(GAA)B

tF(GAA)B, Transcript of Phenylalanine tRNA (tRNA-Phe), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tF(GAA)B, Length 73 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tF(GAA)BtF(GAA)B SRB4P32569 687 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B SEC17P32602 292 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B REC114P32841 428 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B MRT4P33201 236 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B SHE1P38200 338 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B RKM3P38222 552 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B MIC12P38341 106 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B STP2P38704 541 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B PAC2P39937 518 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B SIT1P39980 628 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B SCC4P40090 624 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B AIM19P40502 157 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B FMP32P43557 207 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B YFL015CP43578 164 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B YFL012WP43580 148 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B LOH1P47055 219 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B YJL028WP47062 111 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B EFM3P47163 339 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B NUP57P48837 541 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B RPL9BP51401 191 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B YPT32P51996 222 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B ERV29P53337 310 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B ARC35P53731 342 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B YNR048WP53740 393 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B GOR1P53839 350 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B APM1Q00776 475 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B YMR102CQ03177 834 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B RAV2Q03956 351 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B HPT1Q04178 221 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B LPP1Q04396 274 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B YLR173WQ06247 608 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B PBP4Q07362 185 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B RFU1Q08003 200 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B LDS2Q08218 356 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B RKM1Q08961 583 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B RKI1Q12189 258 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B YGK3Q12222 375 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B INP53Q12271 1107 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B MDY2Q12285 212 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B APC2Q12440 853 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B YCR075W-AQ3E830 75 aa0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B TY1A-PR3Q6Q5H1 440 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B TY1A-OLQ92392 440 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B COX5BP00425 151 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B Q0255P03881 472 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B GAL1P04385 528 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B HTA1P04911 132 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B HTA2P04912 132 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B RPL22AP05749 121 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B DST1P07273 309 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B MER1P16523 270 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B PRE9P23638 258 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B PCL1P24867 279 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B VMA3P25515 160 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B ATG22P25568 528 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B PHO91P27514 894 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B RPS1AP33442 255 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B JEN1P36035 616 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B BYE1P36106 594 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B ECM4P36156 370 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B JNM1P36224 373 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B NAT2P37293 288 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B YBR063CP38083 404 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B IMD2P38697 523 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B CTF8P38877 133 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B POP2P39008 433 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B MST28P39552 234 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B RGI1P40043 161 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B VHS2P40463 436 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B NAS2P40555 220 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B MMM1P41800 426 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B ARC1P46672 376 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B SKP1P52286 194 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B MIG2P53035 382 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B RTA1P53047 317 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B YGL262WP53054 175 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B NIF3P53081 288 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B MST27P53176 234 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B YGR219WP53307 113 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B CPD1P53314 239 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B YNR071CP53757 342 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B MRPL22P53881 309 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B RRN5Q02983 363 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B YLR345WQ06137 509 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B VPS74Q06385 345 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B YEH2Q07950 538 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B THP1Q08231 455 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B TY1A-GR1Q12085 440 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B RPN5Q12250 445 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B RBD2Q12270 262 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B SFM1Q12314 213 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B MHF2Q3E829 80 aa0.35□□□□□ -2.35
tF(GAA)BtF(GAA)B YPR096CO13587 100 aa0.34□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B ATP4P05626 244 aa0.34□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B HTS1P07263 546 aaKnown RBP0.34□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B YCR043CP25361 127 aa0.34□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B KRR1P25586 316 aaPredicted RBP0.34□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B AAD3P25612 363 aa0.34□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B SNC1P31109 117 aa0.34□□□□□ -2.36
tF(GAA)BtF(GAA)B DPH5P32469 300 aaPredicted RBP0.34□□□□□ -2.36
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