RNA–Protein interactions for RNA: YPL253C

VIK1, Transcript of Protein that forms a kinesin-14 heterodimeric motor with Kar3p, yeast

Gene VIK1, Length 1,944 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VIK1	YPL253C	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	0.31	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	COX20	Q04935	205 aa		0.31	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	BOP2	Q06150	570 aa		0.31	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	CTR3	Q06686	241 aa		0.31	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		0.31	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	IRA1	P18963	3092 aa		0.31	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	TRA1	P38811	3744 aa		0.31	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	SWI1	P09547	1314 aa		0.31	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	YHR139C-A	O13536	103 aa		0.3	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	0.3	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	MSF1	P08425	469 aa		0.3	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	YHR032W-A	P0C5N6	59 aa		0.3	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	CWP1	P28319	239 aa		0.3	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	PEX3	P28795	441 aa		0.3	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	MSA2	P36157	363 aa		0.3	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	MAL32	P38158	584 aa		0.3	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	YBR220C	P38318	560 aa		0.3	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	PEX18	P38855	283 aa		0.3	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	CTR2	P38865	189 aa		0.3	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	RCY1	P39531	840 aa		0.3	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	RTT105	P40063	208 aa		0.3	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	DSN1	P40568	576 aa		0.3	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	YAR1	P46683	200 aa		0.3	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	YJR012C	P47087	207 aa		0.3	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	KAP114	P53067	1004 aa		0.3	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	TIM21	P53220	239 aa		0.3	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	MAL12	P53341	584 aa		0.3	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	SNZ2	P53824	298 aa		0.3	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	0.3	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	0.3	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	GMC2	Q06201	188 aa		0.3	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	COQ10	Q08058	207 aa		0.3	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	RRT8	Q08219	342 aa		0.3	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	MSA1	Q08471	629 aa		0.3	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	YOR029W	Q12243	111 aa		0.3	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	0.3	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	MHT1	Q12525	324 aa		0.3	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		0.3	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	YBL008W-A	Q3E821	79 aa		0.3	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	SAS5	Q99314	248 aa		0.3	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	YPL229W	Q99395	206 aa		0.3	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	0.3	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	0.3	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	0.3	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	0.3	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	SEC22	P22214	214 aa		0.3	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	0.3	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	RNP1	P32385	249 aa		0.3	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	0.3	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	0.3	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	TEM1	P38987	245 aa		0.3	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	DDI1	P40087	428 aa		0.3	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	0.3	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	PEX10	Q05568	337 aa		0.3	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	0.3	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	YLR030W	Q07967	263 aa		0.3	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	SLD7	Q08457	257 aa		0.3	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	YOL107W	Q12239	342 aa		0.3	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	PST1	Q12355	444 aa		0.3	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	EMP46	Q12396	444 aa		0.3	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	STH1	P32597	1359 aa		0.29	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	0.29	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	DAL82	P21705	255 aa		0.29	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	VPS3	P23643	1011 aa		0.29	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	0.29	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	RCN1	P36054	211 aa		0.29	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	MRX3	P38172	270 aa		0.29	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	GOS1	P38736	223 aa		0.29	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	SHC1	P39000	512 aa		0.29	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	OST2	P46964	130 aa		0.29	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	0.29	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	YGL159W	P53110	370 aa		0.29	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	0.29	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	0.29	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	0.29	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	PRM15	Q03262	622 aa		0.29	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	0.29	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	YOR186W	Q08560	144 aa		0.29	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	BTS1	Q12051	335 aa		0.29	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	MSH5	Q12175	901 aa		0.29	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	BBP1	Q12365	385 aa		0.29	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	VPS13	Q07878	3144 aa		0.29	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	COX5A	P00424	153 aa		0.28	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	Q0255	P03881	472 aa		0.28	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	RAD3	P06839	778 aa		0.28	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	YKR104W	P0CE69	306 aa		0.28	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	RSR1	P13856	272 aa		0.28	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	YUH1	P35127	236 aa		0.28	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	YBR219C	P38317	127 aa		0.28	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	YHR125W	P38831	101 aa		0.28	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	YER189W	P40104	122 aa		0.28	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	MRH4	P53166	561 aa		0.28	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	YNL046W	P53956	172 aa		0.28	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	ASI3	P53983	676 aa		0.28	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	SPG4	Q04438	115 aa		0.28	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
VIK1	YPL253C	ATO3	Q12359	275 aa		0.28	□□□□□ -2.36

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