RNA–Protein interactions for RNA: YPL060C-A

YPL060C-A, Transcript of TyA Gag protein, yeastyeast

Gene YPL060C-A, Length 3,315 nt, Biotype pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPL060C-AYPL060C-A YHI9P38765 294 aa-0.33□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A GPI8P49018 411 aa-0.33□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A PEX31P53203 462 aa-0.33□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A YPL257WQ08974 193 aa-0.33□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A SFG1Q12507 346 aa-0.33□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A COX3P00420 269 aa-0.34□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A VAR1P02381 398 aa-0.34□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A RNR2P09938 399 aaKnown RBP-0.34□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A FZO1P38297 855 aa-0.34□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A ERV15P38312 142 aa-0.34□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A YBR220CP38318 560 aa-0.34□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A BUD27P43573 796 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.34□□□□□ -2.46not detected
YPL060C-AYPL060C-A IRC6P43615 237 aa-0.34□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A YJL028WP47062 111 aa-0.34□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A EFM3P47163 339 aa-0.34□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A TCB2P48231 1178 aa-0.34□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A TPC1P53257 314 aa-0.34□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A YMR279CQ03263 540 aa-0.34□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A YLR030WQ07967 263 aa-0.34□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A NBL1Q3E7Y6 73 aa-0.34□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A CDC31P06704 161 aaKnown RBP-0.34□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A YKL063CP35725 167 aa-0.34□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A YSW1P38280 609 aa-0.34□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A PRE6P40303 254 aaKnown RBP-0.34□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A RPS29BP41058 56 aaKnown RBP-0.34□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A DAD3P69850 94 aa-0.34□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A YML018CQ03730 393 aa-0.34□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A YMR114CQ04471 368 aaKnown RBP-0.34□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A YLR297WQ05899 129 aa-0.34□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A CTS2Q06350 511 aa-0.34□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A ECM29P38737 1868 aa-0.34□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A IQG1Q12280 1495 aa-0.34□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A RAS2P01120 322 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A RRG9P40156 214 aa-0.35□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A YJR146WP47174 117 aa-0.35□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A CTF19Q02732 369 aa-0.35□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A RCE1Q03530 315 aa-0.35□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A IPP1P00817 287 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A RPL18AP0CX49 186 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A RPL18BP0CX50 186 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A HEK2P38199 381 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.35□□□□□ -2.47not detected
YPL060C-AYPL060C-A TEM1P38987 245 aa-0.35□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A COX16P47081 118 aa-0.35□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A LIF1P53150 421 aa-0.35□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A HHT1P61830 136 aa-0.35□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A YHR007C-AQ07074 71 aa-0.35□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A GEP5Q12393 293 aa-0.35□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A POP8P38208 133 aa-0.35□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A TCD1P38756 429 aa-0.35□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A VMA13P41807 478 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A ERJ5P43613 295 aaPredicted RBP-0.35□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A YJR012CP47087 207 aa-0.35□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A YPL039WQ03080 316 aa-0.35□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A RSM10Q03201 203 aa-0.35□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A QRI5P32344 111 aa-0.36□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A RXT2P38255 430 aa-0.36□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A PHO88P38264 188 aaPredicted RBP-0.36□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A NPT1P39683 429 aaKnown RBP-0.36□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A RIO2P40160 425 aaKnown RBP-0.36□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A RPL33BP41056 107 aaKnown RBP-0.36□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A EAF6P47128 113 aa-0.36□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A MND1P53102 219 aa-0.36□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A RSC1P53236 928 aa-0.36□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A PEX12Q04370 399 aa-0.36□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A YMR226CQ05016 267 aaKnown RBP-0.36□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A YPR078CQ06813 372 aa-0.36□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A CSI2Q08054 341 aa-0.36□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A FRE6Q12473 712 aa-0.36□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A TSC11P40061 1430 aa-0.36□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A URA7P28274 579 aaKnown RBP-0.36□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A AVT2P39981 480 aa-0.36□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A RRN9P53437 365 aa-0.36□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A RET3P53600 189 aa-0.36□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A YNL050CP53952 270 aa-0.36□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A HKR1P41809 1802 aa-0.36□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A AHT1P29589 182 aa-0.36□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A MGM101P32787 269 aaKnown RBP-0.36□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A OST2P46964 130 aa-0.36□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A UFD1P53044 361 aa-0.36□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A MRPS8Q03799 155 aa-0.36□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A ATG39Q06159 398 aa-0.36□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A PSY3Q12318 242 aa-0.36□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A SCM3Q12334 223 aa-0.36□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A PRM4Q12498 284 aa-0.36□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A RAD1P06777 1100 aa-0.37□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A MRX5P47007 382 aa-0.37□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A SML1Q04964 104 aa-0.37□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A RRS1Q08746 203 aaKnown RBP-0.37□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A CFT1Q06632 1357 aaKnown RBP-0.37□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A SCM4P32564 187 aa-0.37□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A NFU1P32860 256 aa-0.37□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A YPC1P38298 316 aa-0.37□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A YHL044WP38727 235 aa-0.37□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A YAR064WP39563 99 aa-0.37□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A ABM1P47146 123 aa-0.37□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A DCR2Q05924 578 aa-0.37□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A AKR2Q12013 749 aa-0.37□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A YPR011CQ12251 326 aa-0.37□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A RPN6Q12377 434 aa-0.37□□□□□ -2.47
YPL060C-AYPL060C-A AGC1Q12482 902 aa-0.37□□□□□ -2.47
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