RNA–Protein interactions for RNA: YOL013C

HRD1, Transcript of Ubiquitin-protein ligase, yeastyeast

Gene HRD1, Length 1,656 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRD1YOL013C SHC1P39000 512 aa2.77□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C KRE29P40026 464 aa2.77□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C MOB2P43563 287 aa2.77□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C TMA22P47089 198 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C YJR141WP47172 347 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C YJR149WP47177 404 aa2.77□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C OST3P48439 350 aa2.77□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C PRP24P49960 444 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C SHY1P53266 389 aa2.77□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C GIS2P53849 153 aaKnown RBP RIP-Chip data2.77□□□□□ -1.97 RIP-Chip
HRD1YOL013C YLR460CP54007 376 aa2.77□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C VPS60Q03390 229 aa2.77□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C PRM6Q04705 352 aa2.77□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C FAR10Q06001 478 aa2.77□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C ATP16Q12165 160 aa2.77□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C USB1Q12208 290 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C PDR5P33302 1511 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C MHP1P43638 1398 aa2.77□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C USO1P25386 1790 aa2.77□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C LTE1P07866 1435 aa2.77□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C RPL15AP05748 204 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C QCR2P07257 368 aa2.76□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C BCY1P07278 416 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C YOL163WP0CF20 169 aa2.76□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C AEP1P32493 518 aa2.76□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C YPT52P36018 234 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C HEK2P38199 381 aaKnown RBP RIP-Chip data2.76□□□□□ -1.97not detected
HRD1YOL013C FIG1P38224 298 aa2.76□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C MED8P38304 223 aa2.76□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C WSC4P38739 605 aa2.76□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C YHR127WP38833 243 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C MMS2P53152 137 aa2.76□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C SYF2P53277 215 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C NRM1P53718 249 aa2.76□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C IBD2P53892 351 aa2.76□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C HCR1Q05775 265 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C GGA1Q06336 557 aa2.76□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C YDL114WQ07530 308 aa2.76□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C YPL229WQ99395 206 aa2.76□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C SEC7P11075 2009 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C YAL064W-BO13512 126 aa2.76□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C ALK2P32789 676 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C YOX1P34161 385 aa2.76□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C ANR2P36090 516 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C ECM13P38195 257 aa2.76□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C MBA1P38300 278 aa2.76□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C YBP1P38315 674 aa2.76□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C YHL049CP38722 271 aa2.76□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C ICE2P40499 491 aa2.76□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C YJL213WP40896 331 aa2.76□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C DIM1P41819 318 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C YNR066CP53752 436 aa2.76□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C TPS1Q00764 495 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C YDC1Q02896 317 aa2.76□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C YML018CQ03730 393 aa2.76□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C HNT3Q08702 217 aa2.76□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C YOR376WQ08900 122 aa2.76□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C RFM1Q12192 310 aa2.76□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C IML1P47170 1584 aa2.75□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C COX5AP00424 153 aa2.75□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C SPT3P06844 337 aa2.75□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C ZWF1P11412 505 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C ATR1P13090 542 aa2.75□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C CPR1P14832 162 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C CBS2P14905 389 aa2.75□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C MRPL3P36516 390 aa2.75□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C HMT1P38074 348 aa2.75□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C PTI1P39927 425 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C PAN6P40459 309 aa2.75□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C AVT7P40501 490 aa2.75□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C EGT2P42835 1041 aa2.75□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C CPR7P47103 393 aa2.75□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C YGL235WP53071 178 aa2.75□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C NSA1P53136 463 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C GTR2P53290 341 aa2.75□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C GRX8Q05926 109 aa2.75□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C SEI1Q06058 285 aa2.75□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C GAS2Q06135 555 aa2.75□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C YNG1Q08465 219 aa2.75□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C TPO4Q12256 659 aa2.75□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C MRX4Q12467 430 aa2.75□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C HTZ1Q12692 134 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C DNF3Q12674 1656 aa2.74□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C YKR104WP0CE69 306 aa2.74□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C IFM1P25038 676 aa2.74□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C OAC1P32332 324 aa2.74□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C MRP21P38175 177 aa2.74□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C SEO1P39709 593 aa2.74□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C IRC18P47056 224 aa2.74□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C FMP41P53889 259 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C FYV6P53913 173 aa2.74□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C NRK1P53915 240 aa2.74□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C SDC1Q03323 175 aa2.74□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C YET2Q04210 160 aa2.74□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C SPG4Q04438 115 aa2.74□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C YOR292CQ08743 309 aa2.74□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C DRS2P39524 1355 aa2.74□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C CDC28P00546 298 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C RPS24AP0CX31 135 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
HRD1YOL013C RPS24BP0CX32 135 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 33.5 ms