RNA–Protein interactions for RNA: YML038C

YMD8, Transcript of Putative nucleotide sugar transporter, yeast

Gene YMD8, Length 1,329 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMD8	YML038C	SPO12	P17123	173 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YMD8	YML038C	EXO70	P19658	623 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YMD8	YML038C	NUP1	P20676	1076 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YMD8	YML038C	IFM1	P25038	676 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YMD8	YML038C	YCR101C	P25607	182 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YMD8	YML038C	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YMD8	YML038C	INO2	P26798	304 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YMD8	YML038C	YEF1	P32622	495 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YMD8	YML038C	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YMD8	YML038C	SPC34	P36131	295 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YMD8	YML038C	LAG1	P38703	411 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YMD8	YML038C	EFM1	P38732	585 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YMD8	YML038C	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
YMD8	YML038C	YER186C	P40101	306 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YMD8	YML038C	HPM1	P40481	377 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YMD8	YML038C	MOB1	P40484	314 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YMD8	YML038C	OST3	P48439	350 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YMD8	YML038C	CDH1	P53197	566 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YMD8	YML038C	POP6	P53218	158 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YMD8	YML038C	STP1	Q00947	519 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YMD8	YML038C	SPR6	Q01684	191 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YMD8	YML038C	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YMD8	YML038C	CSN9	Q03981	162 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YMD8	YML038C	YPR098C	Q06089	161 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YMD8	YML038C	YDL009C	Q12210	107 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YMD8	YML038C	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YMD8	YML038C	YPR064W	Q12492	139 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YMD8	YML038C	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YMD8	YML038C	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YMD8	YML038C	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YMD8	YML038C	SUC2	P00724	532 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YMD8	YML038C	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YMD8	YML038C	NMT1	P14743	455 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YMD8	YML038C	CTA1	P15202	515 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YMD8	YML038C	SPO11	P23179	398 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YMD8	YML038C	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YMD8	YML038C	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YMD8	YML038C	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YMD8	YML038C	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YMD8	YML038C	RTS2	P40962	232 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YMD8	YML038C	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YMD8	YML038C	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YMD8	YML038C	HCH1	P53834	153 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YMD8	YML038C	PDR17	P53844	350 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YMD8	YML038C	ARL3	Q02804	198 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YMD8	YML038C	DPP1	Q05521	289 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YMD8	YML038C	NEJ1	Q06148	342 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YMD8	YML038C	IRC10	Q08118	586 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YMD8	YML038C	SRL2	Q12020	392 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YMD8	YML038C	ERV2	Q12284	196 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YMD8	YML038C	YLR126C	Q12288	251 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YMD8	YML038C	NCA2	Q12374	616 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YMD8	YML038C	BI3	Q9ZZW7	517 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YMD8	YML038C	RIF1	P29539	1916 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YMD8	YML038C	HAP2	P06774	265 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMD8	YML038C	PHO80	P20052	293 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMD8	YML038C	EPT1	P22140	391 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMD8	YML038C	TRX3	P25372	127 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMD8	YML038C	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YMD8	YML038C	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YMD8	YML038C	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YMD8	YML038C	MRPL3	P36516	390 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMD8	YML038C	FMP23	P38231	175 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMD8	YML038C	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YMD8	YML038C	KRE29	P40026	464 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMD8	YML038C	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YMD8	YML038C	PMT4	P46971	762 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMD8	YML038C	CPR7	P47103	393 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMD8	YML038C	YIP1	P53039	248 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMD8	YML038C	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YMD8	YML038C	BET5	Q03630	159 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMD8	YML038C	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YMD8	YML038C	GLO2	Q05584	274 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMD8	YML038C	BNA5	Q05979	453 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMD8	YML038C	TPO3	Q06451	622 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMD8	YML038C	YLR030W	Q07967	263 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMD8	YML038C	TAF10	Q12030	206 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMD8	YML038C	ORT1	Q12375	292 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMD8	YML038C	YDL199C	Q12407	687 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMD8	YML038C	PEX11	Q12462	236 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMD8	YML038C	SLO1	Q3E784	85 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMD8	YML038C	YOL163W	P0CF20	169 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YMD8	YML038C	LSB5	P25369	354 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YMD8	YML038C	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YMD8	YML038C	CPR3	P25719	182 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YMD8	YML038C	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YMD8	YML038C	YKL075C	P36083	450 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YMD8	YML038C	YKR041W	P36134	250 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YMD8	YML038C	MRPL28	P36527	147 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YMD8	YML038C	YCR041W	P37265	110 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YMD8	YML038C	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YMD8	YML038C	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YMD8	YML038C	GEP4	P38812	185 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YMD8	YML038C	FCY21	P40039	528 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YMD8	YML038C	DFG10	P40526	253 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YMD8	YML038C	AZF1	P41696	914 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YMD8	YML038C	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YMD8	YML038C	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YMD8	YML038C	UBC7	Q02159	165 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YMD8	YML038C	YPL014W	Q02606	381 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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