RNA–Protein interactions for RNA: YML005W

TRM12, Transcript of S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase, yeast

Gene TRM12, Length 1,389 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRM12	YML005W	TVP15	Q03860	143 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TRM12	YML005W	EMI1	Q04406	187 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TRM12	YML005W	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
TRM12	YML005W	YDR222W	Q04925	415 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TRM12	YML005W	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
TRM12	YML005W	SEI1	Q06058	285 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TRM12	YML005W	YPR011C	Q12251	326 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TRM12	YML005W	YPS3	Q12303	508 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TRM12	YML005W	TIM22	Q12328	207 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TRM12	YML005W	SWI1	P09547	1314 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TRM12	YML005W	CUP2	P15315	225 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TRM12	YML005W	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
TRM12	YML005W	TAF14	P35189	244 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TRM12	YML005W	CUE1	P38428	203 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TRM12	YML005W	YHI9	P38765	294 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TRM12	YML005W	YJL028W	P47062	111 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TRM12	YML005W	MIC26	P50087	233 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TRM12	YML005W	CDC123	Q05791	360 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TRM12	YML005W	YOL019W	Q08157	551 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TRM12	YML005W	NCB2	Q92317	146 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TRM12	YML005W	SNA3	P14359	133 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TRM12	YML005W	CKA2	P19454	339 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TRM12	YML005W	APA2	P22108	325 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TRM12	YML005W	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	2.79	□□□□□ -1.96
TRM12	YML005W	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
TRM12	YML005W	SLX1	P38324	304 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TRM12	YML005W	TRR2	P38816	342 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TRM12	YML005W	YJR149W	P47177	404 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TRM12	YML005W	TOS8	P53147	276 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TRM12	YML005W	MRH4	P53166	561 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TRM12	YML005W	HST4	P53688	370 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TRM12	YML005W	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	2.79	□□□□□ -1.96
TRM12	YML005W	MSA1	Q08471	629 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TRM12	YML005W	YOR186W	Q08560	144 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TRM12	YML005W	PRR2	Q12310	699 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TRM12	YML005W	YBL008W-A	Q3E821	79 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TRM12	YML005W	SAC3	P46674	1301 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TRM12	YML005W	YHR139C-A	O13536	103 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TRM12	YML005W	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
TRM12	YML005W	YAK1	P14680	807 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TRM12	YML005W	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
TRM12	YML005W	DRE2	P36152	348 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TRM12	YML005W	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
TRM12	YML005W	SUR2	P38992	349 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TRM12	YML005W	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
TRM12	YML005W	MGA1	P53050	456 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TRM12	YML005W	NIF3	P53081	288 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TRM12	YML005W	FLC3	P53121	802 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TRM12	YML005W	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
TRM12	YML005W	GET4	Q12125	312 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TRM12	YML005W	PPH21	P23594	369 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TRM12	YML005W	SRY1	P36007	326 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TRM12	YML005W	MRPL39	P36533	70 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TRM12	YML005W	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
TRM12	YML005W	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
TRM12	YML005W	OST3	P48439	350 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TRM12	YML005W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
TRM12	YML005W	YPL150W	Q12152	901 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TRM12	YML005W	DCN1	Q12395	269 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TRM12	YML005W	YPL247C	Q12523	523 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TRM12	YML005W	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TRM12	YML005W	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TRM12	YML005W	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TRM12	YML005W	CBF1	P17106	351 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TRM12	YML005W	ERD2	P18414	219 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TRM12	YML005W	ECM13	P38195	257 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TRM12	YML005W	SPL2	P38839	148 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TRM12	YML005W	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
TRM12	YML005W	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
TRM12	YML005W	YFR045W	P43617	309 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TRM12	YML005W	MDM34	P53083	459 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TRM12	YML005W	GOT1	Q03554	138 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TRM12	YML005W	ECM11	Q04110	302 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TRM12	YML005W	YDR124W	Q04608	324 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TRM12	YML005W	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
TRM12	YML005W	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
TRM12	YML005W	IES3	Q12345	250 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TRM12	YML005W	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
TRM12	YML005W	YPK2	P18961	677 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TRM12	YML005W	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
TRM12	YML005W	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
TRM12	YML005W	MID2	P36027	376 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TRM12	YML005W	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
TRM12	YML005W	MCM22	P47167	239 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TRM12	YML005W	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
TRM12	YML005W	GIM3	P53900	129 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TRM12	YML005W	SNZ1	Q03148	297 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TRM12	YML005W	TPO4	Q12256	659 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TRM12	YML005W	SPT3	P06844	337 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TRM12	YML005W	YOL163W	P0CF20	169 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TRM12	YML005W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
TRM12	YML005W	SSO1	P32867	290 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TRM12	YML005W	NUP57	P48837	541 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TRM12	YML005W	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
TRM12	YML005W	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
TRM12	YML005W	JLP1	Q12358	412 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TRM12	YML005W	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
TRM12	YML005W	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
TRM12	YML005W	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
TRM12	YML005W	HTB2	P02294	131 aa		2.74	□□□□□ -1.97

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