RNA–Protein interactions for RNA: YHR167W

THP2, Transcript of Subunit of the THO and TREX complexes, yeastyeast

Gene THP2, Length 786 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
THP2YHR167W SFG1Q12507 346 aa2.8□□□□□ -1.96
THP2YHR167W YPR117WQ06116 2489 aa2.8□□□□□ -1.96
THP2YHR167W YLR422WQ06409 1932 aa2.8□□□□□ -1.96
THP2YHR167W ATP6P00854 259 aa2.79□□□□□ -1.96
THP2YHR167W CBP2P03874 630 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
THP2YHR167W YSF3P0C074 85 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
THP2YHR167W FBA1P14540 359 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
THP2YHR167W DAL82P21705 255 aa2.79□□□□□ -1.96
THP2YHR167W GIT1P25346 518 aa2.79□□□□□ -1.96
THP2YHR167W PBN1P25580 416 aa2.79□□□□□ -1.96
THP2YHR167W FAA1P30624 700 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
THP2YHR167W VAM7P32912 316 aa2.79□□□□□ -1.96
THP2YHR167W AST1P35183 429 aa2.79□□□□□ -1.96
THP2YHR167W ECM4P36156 370 aa2.79□□□□□ -1.96
THP2YHR167W GPI18P38211 433 aa2.79□□□□□ -1.96
THP2YHR167W TDA11P38854 504 aa2.79□□□□□ -1.96
THP2YHR167W MNN9P39107 395 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
THP2YHR167W AST2P39945 430 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
THP2YHR167W COG3P40094 801 aa2.79□□□□□ -1.96
THP2YHR167W UTP25P40498 721 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
THP2YHR167W GVP36P40531 326 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
THP2YHR167W FAR7P43592 221 aa2.79□□□□□ -1.96
THP2YHR167W ATP22P50273 684 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
THP2YHR167W NRM1P53718 249 aa2.79□□□□□ -1.96
THP2YHR167W DBP6P53734 629 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
THP2YHR167W YNL095CP53932 642 aa2.79□□□□□ -1.96
THP2YHR167W MSC3Q05812 728 aa2.79□□□□□ -1.96
THP2YHR167W SSQ1Q05931 657 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
THP2YHR167W YOL019WQ08157 551 aa2.79□□□□□ -1.96
THP2YHR167W PEX27Q08580 376 aa2.79□□□□□ -1.96
THP2YHR167W SRO7Q12038 1033 aa2.79□□□□□ -1.96
THP2YHR167W FRE6Q12473 712 aa2.79□□□□□ -1.96
THP2YHR167W YKL018C-AQ3E7A7 99 aa2.79□□□□□ -1.96
THP2YHR167W ADH1P00330 348 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
THP2YHR167W RPS16AP0CX51 143 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
THP2YHR167W RPS16BP0CX52 143 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
THP2YHR167W MSK1P32048 576 aa2.78□□□□□ -1.96
THP2YHR167W MID2P36027 376 aa2.78□□□□□ -1.96
THP2YHR167W SKG1P36169 355 aa2.78□□□□□ -1.96
THP2YHR167W GRE3P38715 327 aaKnown RBP RIP-Chip data2.78□□□□□ -1.96not detected
THP2YHR167W WSC4P38739 605 aa2.78□□□□□ -1.96
THP2YHR167W SOK1P40317 901 aa2.78□□□□□ -1.96
THP2YHR167W GCN20P43535 752 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
THP2YHR167W APS3P47064 194 aa2.78□□□□□ -1.96
THP2YHR167W JHD2P47156 728 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
THP2YHR167W NAS6P50086 228 aa2.78□□□□□ -1.96
THP2YHR167W SEH1P53011 349 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
THP2YHR167W YGR168CP53293 376 aa2.78□□□□□ -1.96
THP2YHR167W YNR068CP53754 272 aa2.78□□□□□ -1.96
THP2YHR167W RRN5Q02983 363 aa2.78□□□□□ -1.96
THP2YHR167W SPO19Q03029 223 aa2.78□□□□□ -1.96
THP2YHR167W ARV1Q06541 321 aa2.78□□□□□ -1.96
THP2YHR167W YLR030WQ07967 263 aa2.78□□□□□ -1.96
THP2YHR167W YOR376WQ08900 122 aa2.78□□□□□ -1.96
THP2YHR167W TPO4Q12256 659 aa2.78□□□□□ -1.96
THP2YHR167W SFM1Q12314 213 aa2.78□□□□□ -1.96
THP2YHR167W PSF1Q12488 208 aa2.78□□□□□ -1.96
THP2YHR167W KIN28P06242 306 aa2.77□□□□□ -1.97
THP2YHR167W RHO1P06780 209 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
THP2YHR167W CBP6P07253 162 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
THP2YHR167W UGA1P17649 471 aa2.77□□□□□ -1.97
THP2YHR167W ERD2P18414 219 aa2.77□□□□□ -1.97
THP2YHR167W SNF6P18888 332 aa2.77□□□□□ -1.97
THP2YHR167W RAD51P25454 400 aa2.77□□□□□ -1.97
THP2YHR167W RPS27AP35997 82 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
THP2YHR167W DAD2P36162 133 aa2.77□□□□□ -1.97
THP2YHR167W MRPL15P36523 253 aa2.77□□□□□ -1.97
THP2YHR167W MRPL37P36532 105 aa2.77□□□□□ -1.97
THP2YHR167W RPS27BP38711 82 aa2.77□□□□□ -1.97
THP2YHR167W TRR2P38816 342 aa2.77□□□□□ -1.97
THP2YHR167W RCY1P39531 840 aa2.77□□□□□ -1.97
THP2YHR167W PRP39P39682 629 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
THP2YHR167W FMC1P40491 155 aa2.77□□□□□ -1.97
THP2YHR167W YGR201CP42936 225 aa2.77□□□□□ -1.97
THP2YHR167W EMC2P47133 292 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
THP2YHR167W BRR6P53062 197 aa2.77□□□□□ -1.97
THP2YHR167W VHT1P53241 593 aa2.77□□□□□ -1.97
THP2YHR167W TPC1P53257 314 aa2.77□□□□□ -1.97
THP2YHR167W MKC7P53379 596 aa2.77□□□□□ -1.97
THP2YHR167W EOS1P53938 366 aa2.77□□□□□ -1.97
THP2YHR167W GRX5Q02784 150 aa2.77□□□□□ -1.97
THP2YHR167W MIX14Q04341 121 aa2.77□□□□□ -1.97
THP2YHR167W ATG38Q05789 226 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
THP2YHR167W YPR174CQ06616 221 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
THP2YHR167W YDL109CQ12103 647 aa2.77□□□□□ -1.97
THP2YHR167W YOR342CQ12182 319 aa2.77□□□□□ -1.97
THP2YHR167W AIM45Q12480 344 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
THP2YHR167W MHF1Q3E835 90 aa2.77□□□□□ -1.97
THP2YHR167W DET1Q99288 334 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
THP2YHR167W HEM4P06174 275 aa2.76□□□□□ -1.97
THP2YHR167W RPC40P07703 335 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
THP2YHR167W MET2P08465 486 aa2.76□□□□□ -1.97
THP2YHR167W FAR1P21268 830 aa2.76□□□□□ -1.97
THP2YHR167W KRR1P25586 316 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
THP2YHR167W RPS5P26783 225 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
THP2YHR167W RPL16AP26784 199 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
THP2YHR167W TAF14P35189 244 aa2.76□□□□□ -1.97
THP2YHR167W YHR035WP38769 630 aa2.76□□□□□ -1.97
THP2YHR167W FET3P38993 636 aa2.76□□□□□ -1.97
THP2YHR167W PHB1P40961 287 aa2.76□□□□□ -1.97
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