RNA–Protein interactions for RNA: YGR279C

SCW4, Transcript of Cell wall protein with similarity to glucanases, yeast

Gene SCW4, Length 1,161 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SCW4	YGR279C	MAK32	P23060	363 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	CPR2	P23285	205 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	ERG4	P25340	473 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	CNE1	P27825	502 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	REC114	P32841	428 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	CLB6	P32943	380 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	RIB7	P33312	244 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	MTC6	P38849	526 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	PIG2	P40187	538 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	PRM5	P40476	318 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	LYS5	P50113	272 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	YDC1	Q02896	317 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	YPR098C	Q06089	161 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	KEI1	Q06346	221 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	FIT3	Q08907	204 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	ATG41	Q12048	136 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	PET54	P10834	293 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	PET18	P25362	215 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	ATG15	P25641	520 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	TCA17	P32613	152 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	MRPL36	P36531	177 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	UMP1	P38293	148 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	OSH7	P38755	437 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	YHK8	P38776	514 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	CHS7	P38843	316 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	LNP1	P38878	278 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	YJL016W	P47072	561 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	AVT4	P50944	713 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	YGL159W	P53110	370 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	ERV29	P53337	310 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	YNL092W	P53934	400 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	YNL046W	P53956	172 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	YKR005C	Q02203	525 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	DLT1	Q04216	342 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	BLM10	P43583	2143 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	RPL43B	P0CX26	92 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	RPS23B	P0CX30	145 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	CDC23	P16522	626 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	VMA3	P25515	160 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	YBR220C	P38318	560 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	YIL029C	P40538	142 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	TIR3	P40552	269 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	BUD8	P41698	603 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	EGT2	P42835	1041 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	AIM25	P47140	327 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	GPG1	P53130	126 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	MRH4	P53166	561 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	VHT1	P53241	593 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	RNH201	P53942	307 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	MRPS16	Q02608	121 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	YPL067C	Q02754	198 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	YMR254C	Q04838	102 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	PHO92	Q06390	306 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	PIN3	Q06449	215 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	GRC3	Q07845	632 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	PEX27	Q08580	376 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	YOR385W	Q08909	290 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCW4	YGR279C	PRP8	P33334	2413 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	YML003W	P0CF16	290 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	URA6	P15700	204 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	HNM1	P19807	563 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	CPR4	P25334	318 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	MRPS5	P33759	307 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	MCH2	P36032	473 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	MRPL3	P36516	390 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	BMT5	P40493	336 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	MRP51	Q02950	344 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCW4	YGR279C	GMC1	Q04399	608 aa		4.58	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 54.3 ms