RNA–Protein interactions for RNA: YCL043C

PDI1, Transcript of Protein disulfide isomerase, yeast

Gene PDI1, Length 1,569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PDI1	YCL043C	FYV7	Q12247	151 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	GLO4	Q12320	285 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	TFC7	Q12415	435 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	BEM2	P39960	2167 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	RTG1	P32607	177 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	OMA1	P36163	345 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	MRPL28	P36527	147 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	EHT1	P38295	451 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	SUR2	P38992	349 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	VPS52	P39904	641 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	YJL068C	P40363	299 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	MET28	P40573	187 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	PAM16	P42949	149 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	YGL185C	P53100	379 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	YGL117W	P53133	265 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	APJ1	P53940	528 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	YDL129W	Q07555	291 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	IRA1	P18963	3092 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	AI1	P03875	834 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	SCEI	P03882	235 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	SPS4	P09937	338 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	PRO1	P32264	428 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	ORC2	P32833	620 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	SEF1	P34228	1148 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	MNL1	P38888	796 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	PMT6	P42934	759 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	TAX4	P47030	604 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	UBX6	P47049	396 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	NUP57	P48837	541 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	VHT1	P53241	593 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	SUN4	P53616	420 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	MTQ1	P53944	314 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	HLR1	Q04429	423 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	YMR252C	Q04814	134 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	RSF1	Q05043	376 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	AKR2	Q12013	749 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	ATP5	P09457	212 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	SNC2	P33328	115 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	MAL32	P38158	584 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	YBR013C	P38215	129 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	SPC25	P40014	221 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	PUG1	P40100	303 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	FLX1	P40464	311 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	SDP1	P40479	209 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	CIN5	P40917	295 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	VNX1	P42839	908 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	SLS1	P42900	643 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	IBA57	P47158	497 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	MGA1	P53050	456 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	YGL114W	P53134	725 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	YGL101W	P53144	215 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	MAL12	P53341	584 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	PGA1	P53896	198 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	YKR011C	Q02209	353 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	ATC1	Q04005	294 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	YMR253C	Q04835	414 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	YML053C	Q04978	212 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	IRC13	Q08630	104 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	YDR262W	Q12331	272 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	SOD2	P00447	233 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	RPB5	P20434	215 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	EHD3	P28817	500 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	SPC29	P33419	253 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	MSN4	P33749	630 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	ELF1	P36053	145 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	YMR262W	P38430	313 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	GPI16	P38875	610 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	ICE2	P40499	491 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	YPS6	P40583	537 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	GLC8	P41818	229 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	MEP3	P53390	489 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	CWC27	Q02770	301 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	SEN15	Q04675	128 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	FDH1	Q08911	376 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PDI1	YCL043C	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67

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