RNA–Protein interactions for RNA: YBR217W

ATG12, Transcript of Ubiquitin-like modifier involved in autophagy and the Cvt pathway, yeast

Gene ATG12, Length 561 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG12	YBR217W	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	BNA2	P47125	453 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	DOC1	P53068	250 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	YNL046W	P53956	172 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	YKR005C	Q02203	525 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	YDR114C	Q04597	100 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	YLR283W	Q05867	314 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	TGS1	Q12052	315 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	ORT1	Q12375	292 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	YCL048W-A	Q2V2Q2	79 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	REP1	P03871	373 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	SNC2	P33328	115 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	SLM1	P40485	686 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	BUD8	P41698	603 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	BUD25	P85052	153 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	SPO19	Q03029	223 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	YDR248C	Q03786	193 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	GMC1	Q04399	608 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	SPR28	Q04921	423 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	TPO3	Q06451	622 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	REP2	P03872	296 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	HIS3	P06633	220 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	YOX1	P34161	385 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
ATG12	YBR217W	UMP1	P38293	148 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	RMD6	P39975	231 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	GRX3	Q03835	250 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	GPN3	Q06543	272 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	CSI2	Q08054	341 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	FCY22	Q12119	530 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	HXT2	P23585	541 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	CNE1	P27825	502 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	YBR137W	P38276	179 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
ATG12	YBR217W	GON7	P46984	123 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	YHC3	P47040	408 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	TAF4	P50105	388 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	MGR3	Q04472	501 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	PIN3	Q06449	215 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	MDM36	Q06820	579 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	IES3	Q12345	250 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	EAF3	Q12432	401 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	HUT1	Q12520	339 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	TY1A-DR4	O74302	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	TY1A-H	P0C2I4	478 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	TY1A-A	P0CX57	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	TY1A-PR1	P0CX58	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	TY1A-OR	P0CX59	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	TY1A-PR2	P0CX60	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	TY1A-DR5	P0CX65	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	TY1A-ER2	P0CX66	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	TY1A-GR3	P0CX67	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	TY1A-LR1	P0CX68	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	TY1A-MR2	P0CX69	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	PET18	P25362	215 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	YKL063C	P35725	167 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	GPX2	P38143	162 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	CCZ1	P38273	704 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	TY1A-JR2	P47099	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	SSN8	P47821	323 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	UFD1	P53044	361 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	GEP7	P53171	287 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	CPR8	P53728	308 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	TY1A-DR1	Q03856	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	CAC2	Q04199	468 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	TY1A-ML1	Q04706	440 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	MRPL35	Q06678	367 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	TY1A-BR	Q12217	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	YOR029W	Q12243	111 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	ERP4	Q12450	207 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	TY1A-NL2	Q12470	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	TY1A-GR2	Q12485	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	YMR105W-A	Q8TGS8	64 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	YLR358C	O13565	187 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	QCR7	P00128	127 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	APA2	P22108	325 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	IMP1	P28627	190 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	YBL010C	P32788	280 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	VMA11	P32842	164 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG12	YBR217W	VAM7	P32912	316 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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