RNA–Protein interactions for RNA: Q0110

BI2, Transcript of Mitochondrial mRNA maturase with a role in splicing, yeast

Gene BI2, Length 1,272 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BI2	Q0110	CTF19	Q02732	369 aa		0.88	□□□□□ -2.27
BI2	Q0110	YBR220C	P38318	560 aa		0.87	□□□□□ -2.27
BI2	Q0110	HSM3	P38348	480 aa		0.87	□□□□□ -2.27
BI2	Q0110	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
BI2	Q0110	YHR125W	P38831	101 aa		0.87	□□□□□ -2.27
BI2	Q0110	LSB1	P53281	241 aa		0.87	□□□□□ -2.27
BI2	Q0110	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
BI2	Q0110	CTR3	Q06686	241 aa		0.87	□□□□□ -2.27
BI2	Q0110	REX3	Q12090	404 aa		0.87	□□□□□ -2.27
BI2	Q0110	DDI2	P0CH63	225 aa		0.86	□□□□□ -2.27
BI2	Q0110	DDI3	P0CH64	225 aa		0.86	□□□□□ -2.27
BI2	Q0110	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
BI2	Q0110	CTR2	P38865	189 aa		0.86	□□□□□ -2.27
BI2	Q0110	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	0.86	□□□□□ -2.27
BI2	Q0110	YGL185C	P53100	379 aa		0.86	□□□□□ -2.27
BI2	Q0110	YGR219W	P53307	113 aa		0.86	□□□□□ -2.27
BI2	Q0110	MAL13	P53338	473 aa		0.86	□□□□□ -2.27
BI2	Q0110	YMR279C	Q03263	540 aa		0.86	□□□□□ -2.27
BI2	Q0110	ERV41	Q04651	352 aa		0.86	□□□□□ -2.27
BI2	Q0110	MDY2	Q12285	212 aa		0.86	□□□□□ -2.27
BI2	Q0110	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	0.85	□□□□□ -2.27
BI2	Q0110	AVT2	P39981	480 aa		0.85	□□□□□ -2.27
BI2	Q0110	NUP57	P48837	541 aa		0.85	□□□□□ -2.27
BI2	Q0110	YGL034C	P53186	121 aa		0.85	□□□□□ -2.27
BI2	Q0110	CSI2	Q08054	341 aa		0.85	□□□□□ -2.27
BI2	Q0110	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	0.85	□□□□□ -2.27
BI2	Q0110	STF1	P01098	86 aa		0.84	□□□□□ -2.27
BI2	Q0110	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	0.84	□□□□□ -2.27
BI2	Q0110	OAC1	P32332	324 aa		0.84	□□□□□ -2.27
BI2	Q0110	VMA11	P32842	164 aa		0.84	□□□□□ -2.27
BI2	Q0110	MRX5	P47007	382 aa		0.84	□□□□□ -2.27
BI2	Q0110	BUD25	P85052	153 aa		0.84	□□□□□ -2.27
BI2	Q0110	SWI1	P09547	1314 aa		0.84	□□□□□ -2.28
BI2	Q0110	YLR462W	O13556	202 aa		0.83	□□□□□ -2.28
BI2	Q0110	COX5A	P00424	153 aa		0.83	□□□□□ -2.28
BI2	Q0110	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	0.83	□□□□□ -2.28
BI2	Q0110	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	0.83	□□□□□ -2.28
BI2	Q0110	ERV15	P38312	142 aa		0.83	□□□□□ -2.28
BI2	Q0110	YEL075C	P39972	122 aa		0.83	□□□□□ -2.28
BI2	Q0110	YER189W	P40104	122 aa		0.83	□□□□□ -2.28
BI2	Q0110	YKE4	P40544	346 aa		0.83	□□□□□ -2.28
BI2	Q0110	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	0.82	□□□□□ -2.28
BI2	Q0110	MSA2	P36157	363 aa		0.82	□□□□□ -2.28
BI2	Q0110	FMP33	P46998	180 aa		0.82	□□□□□ -2.28
BI2	Q0110	YNR062C	P53748	327 aa		0.82	□□□□□ -2.28
BI2	Q0110	SPP2	Q02521	185 aa		0.82	□□□□□ -2.28
BI2	Q0110	YDR124W	Q04608	324 aa		0.82	□□□□□ -2.28
BI2	Q0110	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		0.82	□□□□□ -2.28
BI2	Q0110	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	0.81	□□□□□ -2.28
BI2	Q0110	PEX18	P38855	283 aa		0.81	□□□□□ -2.28
BI2	Q0110	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	0.81	□□□□□ -2.28
BI2	Q0110	YLR162W	Q06235	118 aa		0.81	□□□□□ -2.28
BI2	Q0110	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	0.81	□□□□□ -2.28
BI2	Q0110	FMP16	Q12497	93 aa		0.81	□□□□□ -2.28
BI2	Q0110	OPI1	P21957	404 aa		0.8	□□□□□ -2.28
BI2	Q0110	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28
BI2	Q0110	AGE2	P40529	298 aa		0.8	□□□□□ -2.28
BI2	Q0110	DSN1	P40568	576 aa		0.8	□□□□□ -2.28
BI2	Q0110	YJR012C	P47087	207 aa		0.8	□□□□□ -2.28
BI2	Q0110	FAR8	Q05040	523 aa		0.8	□□□□□ -2.28
BI2	Q0110	NEJ1	Q06148	342 aa		0.8	□□□□□ -2.28
BI2	Q0110	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	0.8	□□□□□ -2.28
BI2	Q0110	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	0.79	□□□□□ -2.28
BI2	Q0110	COA1	P40452	197 aa		0.79	□□□□□ -2.28
BI2	Q0110	YJR079W	P47126	109 aa		0.79	□□□□□ -2.28
BI2	Q0110	YGL159W	P53110	370 aa		0.79	□□□□□ -2.28
BI2	Q0110	MRH4	P53166	561 aa		0.79	□□□□□ -2.28
BI2	Q0110	GOT1	Q03554	138 aa		0.79	□□□□□ -2.28
BI2	Q0110	SML1	Q04964	104 aa		0.79	□□□□□ -2.28
BI2	Q0110	GMC2	Q06201	188 aa		0.79	□□□□□ -2.28
BI2	Q0110	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	0.79	□□□□□ -2.28
BI2	Q0110	FLO9	P39712	1322 aa		0.79	□□□□□ -2.28
BI2	Q0110	UBR2	Q07963	1872 aa		0.79	□□□□□ -2.28
BI2	Q0110	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	0.78	□□□□□ -2.28
BI2	Q0110	FZO1	P38297	855 aa		0.78	□□□□□ -2.28
BI2	Q0110	DDI1	P40087	428 aa		0.78	□□□□□ -2.28
BI2	Q0110	ERV29	P53337	310 aa		0.78	□□□□□ -2.28
BI2	Q0110	YLR030W	Q07967	263 aa		0.78	□□□□□ -2.28
BI2	Q0110	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	0.78	□□□□□ -2.28
BI2	Q0110	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
BI2	Q0110	SNF8	Q12483	233 aa		0.78	□□□□□ -2.28
BI2	Q0110	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	0.78	□□□□□ -2.28
BI2	Q0110	SIR4	P11978	1358 aa		0.78	□□□□□ -2.28
BI2	Q0110	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
BI2	Q0110	MSW1	P04803	379 aa		0.77	□□□□□ -2.29
BI2	Q0110	UPS2	P35200	230 aa		0.77	□□□□□ -2.29
BI2	Q0110	MRPL40	P36534	297 aa		0.77	□□□□□ -2.29
BI2	Q0110	YHR180W	P38868	163 aa		0.77	□□□□□ -2.29
BI2	Q0110	ATG17	Q06410	417 aa		0.77	□□□□□ -2.29
BI2	Q0110	VPS3	P23643	1011 aa		0.76	□□□□□ -2.29
BI2	Q0110	QRI5	P32344	111 aa		0.76	□□□□□ -2.29
BI2	Q0110	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	0.76	□□□□□ -2.29
BI2	Q0110	YKL070W	P36087	169 aa		0.76	□□□□□ -2.29
BI2	Q0110	SVP26	P38869	228 aa		0.76	□□□□□ -2.29
BI2	Q0110	FIS1	P40515	155 aa		0.76	□□□□□ -2.29
BI2	Q0110	YIL001W	P40560	513 aa		0.76	□□□□□ -2.29
BI2	Q0110	SNZ3	P43545	298 aa		0.76	□□□□□ -2.29
BI2	Q0110	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	0.76	□□□□□ -2.29
BI2	Q0110	GTR2	P53290	341 aa		0.76	□□□□□ -2.29
BI2	Q0110	OST6	Q03723	332 aa		0.76	□□□□□ -2.29

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