RNA–Protein interactions for RNA: Q0017

Q0017, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene Q0017, Length 162 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
Q0017	Q0017	OAC1	P32332	324 aa		0.57	□□□□□ -2.32
Q0017	Q0017	COS8	P38723	381 aa		0.57	□□□□□ -2.32
Q0017	Q0017	VAR1	P02381	398 aa		0.56	□□□□□ -2.32
Q0017	Q0017	POF1	P25576	258 aa		0.56	□□□□□ -2.32
Q0017	Q0017	YGR026W	P53217	278 aa		0.56	□□□□□ -2.32
Q0017	Q0017	TIM21	P53220	239 aa		0.56	□□□□□ -2.32
Q0017	Q0017	YBL008W-A	Q3E821	79 aa		0.56	□□□□□ -2.32
Q0017	Q0017	COX5A	P00424	153 aa		0.55	□□□□□ -2.32
Q0017	Q0017	AGE2	P40529	298 aa		0.55	□□□□□ -2.32
Q0017	Q0017	YKE4	P40544	346 aa		0.55	□□□□□ -2.32
Q0017	Q0017	YGL185C	P53100	379 aa		0.55	□□□□□ -2.32
Q0017	Q0017	YGL034C	P53186	121 aa		0.55	□□□□□ -2.32
Q0017	Q0017	ARP5	P53946	755 aa		0.55	□□□□□ -2.32
Q0017	Q0017	SML1	Q04964	104 aa		0.55	□□□□□ -2.32
Q0017	Q0017	CUR1	Q06469	252 aa		0.55	□□□□□ -2.32
Q0017	Q0017	PER33	Q12144	273 aa		0.55	□□□□□ -2.32
Q0017	Q0017	RPL37B	P51402	88 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
Q0017	Q0017	YMR279C	Q03263	540 aa		0.53	□□□□□ -2.32
Q0017	Q0017	ARV1	Q06541	321 aa		0.53	□□□□□ -2.32
Q0017	Q0017	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.32
Q0017	Q0017	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	0.52	□□□□□ -2.33
Q0017	Q0017	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	0.52	□□□□□ -2.33
Q0017	Q0017	HUA1	P40325	198 aa		0.52	□□□□□ -2.33
Q0017	Q0017	YJR079W	P47126	109 aa		0.52	□□□□□ -2.33
Q0017	Q0017	ERV29	P53337	310 aa		0.52	□□□□□ -2.33
Q0017	Q0017	SWI1	P09547	1314 aa		0.52	□□□□□ -2.33
Q0017	Q0017	STH1	P32597	1359 aa		0.51	□□□□□ -2.33
Q0017	Q0017	PEX18	P38855	283 aa		0.51	□□□□□ -2.33
Q0017	Q0017	SPT7	P35177	1332 aa		0.5	□□□□□ -2.33
Q0017	Q0017	GPA2	P10823	449 aa		0.5	□□□□□ -2.33
Q0017	Q0017	VMA11	P32842	164 aa		0.5	□□□□□ -2.33
Q0017	Q0017	MSA2	P36157	363 aa		0.5	□□□□□ -2.33
Q0017	Q0017	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
Q0017	Q0017	NEJ1	Q06148	342 aa		0.5	□□□□□ -2.33
Q0017	Q0017	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
Q0017	Q0017	MAL13	P53338	473 aa		0.49	□□□□□ -2.33
Q0017	Q0017	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	0.48	□□□□□ -2.33
Q0017	Q0017	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
Q0017	Q0017	KDX1	P36005	433 aa		0.48	□□□□□ -2.33
Q0017	Q0017	YHR180W	P38868	163 aa		0.48	□□□□□ -2.33
Q0017	Q0017	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	0.48	□□□□□ -2.33
Q0017	Q0017	MNT4	P53745	580 aa		0.48	□□□□□ -2.33
Q0017	Q0017	QCR8	P08525	94 aa		0.47	□□□□□ -2.33
Q0017	Q0017	VPS45	P38932	577 aa		0.47	□□□□□ -2.33
Q0017	Q0017	YDR286C	Q05530	114 aa		0.47	□□□□□ -2.33
Q0017	Q0017	SIR4	P11978	1358 aa		0.46	□□□□□ -2.34
Q0017	Q0017	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
Q0017	Q0017	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
Q0017	Q0017	YLR462W	O13556	202 aa		0.45	□□□□□ -2.34
Q0017	Q0017	YEL075C	P39972	122 aa		0.45	□□□□□ -2.34
Q0017	Q0017	MSW1	P04803	379 aa		0.44	□□□□□ -2.34
Q0017	Q0017	YSR3	P23501	404 aa		0.44	□□□□□ -2.34
Q0017	Q0017	SVP26	P38869	228 aa		0.44	□□□□□ -2.34
Q0017	Q0017	YER189W	P40104	122 aa		0.44	□□□□□ -2.34
Q0017	Q0017	YIL001W	P40560	513 aa		0.44	□□□□□ -2.34
Q0017	Q0017	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	0.44	□□□□□ -2.34
Q0017	Q0017	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
Q0017	Q0017	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
Q0017	Q0017	HSM3	P38348	480 aa		0.43	□□□□□ -2.34
Q0017	Q0017	YNL260C	P53846	198 aa		0.43	□□□□□ -2.34
Q0017	Q0017	MGR3	Q04472	501 aa		0.43	□□□□□ -2.34
Q0017	Q0017	YLR030W	Q07967	263 aa		0.43	□□□□□ -2.34
Q0017	Q0017	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
Q0017	Q0017	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	0.42	□□□□□ -2.34
Q0017	Q0017	YGL159W	P53110	370 aa		0.42	□□□□□ -2.34
Q0017	Q0017	TOS8	P53147	276 aa		0.42	□□□□□ -2.34
Q0017	Q0017	LSB1	P53281	241 aa		0.42	□□□□□ -2.34
Q0017	Q0017	BCP1	Q06338	283 aa		0.42	□□□□□ -2.34
Q0017	Q0017	ARR2	Q06597	130 aa		0.42	□□□□□ -2.34
Q0017	Q0017	PGC1	Q08959	321 aa		0.42	□□□□□ -2.34
Q0017	Q0017	SPO19	Q03029	223 aa		0.41	□□□□□ -2.34
Q0017	Q0017	YDR124W	Q04608	324 aa		0.41	□□□□□ -2.34
Q0017	Q0017	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	0.41	□□□□□ -2.34
Q0017	Q0017	SLH1	P53327	1967 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
Q0017	Q0017	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
Q0017	Q0017	OSW5	P40219	148 aa		0.4	□□□□□ -2.35
Q0017	Q0017	UBC7	Q02159	165 aa		0.4	□□□□□ -2.35
Q0017	Q0017	AIM36	Q03798	255 aa		0.4	□□□□□ -2.35
Q0017	Q0017	FAR8	Q05040	523 aa		0.4	□□□□□ -2.35
Q0017	Q0017	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
Q0017	Q0017	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
Q0017	Q0017	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	0.39	□□□□□ -2.35
Q0017	Q0017	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		0.39	□□□□□ -2.35
Q0017	Q0017	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
Q0017	Q0017	HEM25	Q07534	307 aa		0.38	□□□□□ -2.35
Q0017	Q0017	GTR2	P53290	341 aa		0.37	□□□□□ -2.35
Q0017	Q0017	GOT1	Q03554	138 aa		0.37	□□□□□ -2.35
Q0017	Q0017	FZO1	P38297	855 aa		0.36	□□□□□ -2.35
Q0017	Q0017	YER076C	P40049	302 aa		0.36	□□□□□ -2.35
Q0017	Q0017	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
Q0017	Q0017	FIS1	P40515	155 aa		0.35	□□□□□ -2.35
Q0017	Q0017	MRH4	P53166	561 aa		0.35	□□□□□ -2.35
Q0017	Q0017	SPP2	Q02521	185 aa		0.35	□□□□□ -2.35
Q0017	Q0017	YPL162C	Q12042	273 aa		0.35	□□□□□ -2.35
Q0017	Q0017	ICE2	P40499	491 aa		0.34	□□□□□ -2.36
Q0017	Q0017	DSN1	P40568	576 aa		0.34	□□□□□ -2.36
Q0017	Q0017	RPL33B	P41056	107 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.36
Q0017	Q0017	FMP33	P46998	180 aa		0.34	□□□□□ -2.36
Q0017	Q0017	ATG39	Q06159	398 aa		0.34	□□□□□ -2.36
Q0017	Q0017	AQY2	P0CD90	149 aa		0.33	□□□□□ -2.36

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 65.3 ms