RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558065.1

SEMA4B-204, Transcript of semaphorin 4B, human

TSL 1 (best)

Gene SEMA4B, Length 3,751 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SEMA4B-204	ENST00000558065	NUF2	Q9BZD4	464 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	ITSN1	Q15811	1721 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	MST1R	Q04912	1400 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	CBX6	O95503	412 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	CFL1	P23528	166 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	STX17	P56962	302 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	GNA13	Q14344	377 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	11.7	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	ERI1	Q8IV48	349 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	SPATA20	Q8TB22	786 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	DISC1	Q9NRI5	854 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	GAK	O14976	1311 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	KRT75	O95678	551 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	PTPN4	P29074	926 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	ATP5D	P30049	168 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	WASHC4	Q2M389	1173 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	ZNF75CP	Q92670	426 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	BIRC8	Q96P09	236 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	RNF14	Q9UBS8	474 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	PABPN1L	A6NDY0	278 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065		H3BUI4	141 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	RGS13	O14921	159 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	CLOCK	O15516	846 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	LRRC14	Q15048	493 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	PEX26	Q7Z412	305 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	ZNF410	Q86VK4	478 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	RNF169	Q8NCN4	708 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	VPS33B	Q9H267	617 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	NHEJ1	Q9H9Q4	299 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	PALMD	Q9NP74	551 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	FYB1	O15117	783 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	HAUS5	O94927	633 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	IL32	P24001	234 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	CXCR2	P25025	360 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	GJA9	P57773	515 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	ADAM17	P78536	824 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	PTPA	Q15257	358 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	IGSF11	Q5DX21	431 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	POTEH	Q6S545	545 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	GMIP	Q9P107	970 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	KLRF2	D3W0D1	207 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	PPP6R2	O75170	966 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	RASSF2	P50749	326 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	KCNMA1	Q12791	1236 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	11.68	□□□□□ -0.54	3e-6	■■■■■ 34.6
SEMA4B-204	ENST00000558065	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	MCM10	Q7L590	875 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	VPS16	Q9H269	839 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	AZI2	Q9H6S1	392 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	PSME4	Q14997	1843 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	CHD4	Q14839	1912 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	IDH3B	O43837	385 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	PON1	P27169	355 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	IST1	P53990	364 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	P2RX3	P56373	397 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	ACAP1	Q15027	740 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	NDUFAF5	Q5TEU4	345 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	NANOGP8	Q6NSW7	305 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SEMA4B-204	ENST00000558065	PDSS2	Q86YH6	399 aa		11.68	□□□□□ -0.54

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